為了從雨生紅球藻中獲得感知藍(lán)光信號(hào)的植物類(lèi)型隱花色素（CRY）序列,采用同源克隆和RACE相結(jié)合的方法獲得了雨生紅球藻編碼植物類(lèi)型Hae-P-CRY的c DNA全長(zhǎng),并對(duì)其序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明,Hae-P-CRY基因的c DNA全長(zhǎng)為3 608 bp,包含開(kāi)放閱讀框全長(zhǎng)2 988 bp,編碼995個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)等電點(diǎn)6.19,理論分子質(zhì)量為107.7 ku。經(jīng)Blast P分析發(fā)現(xiàn),Hae-P-CRY氨基酸序列與萊茵衣藻來(lái)源植物類(lèi)型Cre CRY氨基酸序列的相似性達(dá)到66.6%,與擬南芥CRY氨基酸序列相似性為46.94%。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,Hae-P-CRY與其他真核綠藻來(lái)源的植物型CRY聚在一支,屬于植物類(lèi)型CRY。結(jié)構(gòu)域分析表明,Hae-P-CRY基因含有光感知PHR結(jié)構(gòu)域和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)CCT結(jié)構(gòu)域,暗示具有感知和轉(zhuǎn)導(dǎo)光信號(hào)功能。試驗(yàn)從雨生紅球藻得到植物類(lèi)型Hae-P-CRY基因序列,可為其表達(dá)、功能及互作蛋白研究奠定基礎(chǔ),同時(shí)為進(jìn)一步解析雨生紅球藻在藍(lán)光響應(yīng)中的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)。 

【文章來(lái)源】：山西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(05)

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料和方法
    1.1 試驗(yàn)材料
        1.1.1 材料
        1.1.2 試劑
        1.1.3 儀器
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 總RNA的提取
        1.2.2 模板的制備
        1.2.3 引物設(shè)計(jì)
        1.2.4 同源片段的獲得
        1.2.5 c DNA全長(zhǎng)的獲得
        1.2.6 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 雨生紅球藻總RNA提取
    2.2 雨生紅球藻Hae-P-CRY基因cDNA序列的獲得
    2.3 雨生紅球藻Hae-P-CRY的理化性質(zhì)分析
    2.4 雨生紅球藻Hae-P-CRY的二級(jí)結(jié)構(gòu)分析
    2.5 雨生紅球藻Hae-P-CRY結(jié)構(gòu)域和序列比對(duì)分析
    2.6 雨生紅球藻Hae-P-CRY的起源和系統(tǒng)進(jìn)化
3 討論
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3093207