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m~6A去甲基化酶FTO調(diào)節(jié)MZF1基因的驗證及其作用位點的鑒定

發(fā)布時間:2020-04-19 07:25
【摘要】:N6-甲基腺苷(m~6A)是真核生物mRNA序列中最常見、最豐富的表觀修飾之一,該修飾過程是動態(tài)可逆的,由甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3、WTAP和METTL14催化,并可在去甲基化酶FTO和ALKBH5的作用下去除。m~6A修飾可調(diào)控mRNA選擇性剪接、翻譯和穩(wěn)定性,m~6A修飾水平的異常可導致多種疾病,其中包括多種惡性腫瘤。m~6A修飾雖然在mRNA的5’UTR、編碼區(qū)和3'UTR均有發(fā)現(xiàn),但主要富集于終止密碼子附近并在多種生物學過程中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用,其中包括mRNA穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)。m~6A主要存在于RRACH基序(R為G或A,H為A、C或U)且其調(diào)節(jié)作用主要依賴與之結(jié)合的蛋白,目前m~6A結(jié)合蛋白及其下游的代謝通路已被大量研究,但這些蛋白結(jié)合m~6A所需的序列特征尚不明確。而這些序列特征的解析對于最終揭示m~6A的功能與調(diào)節(jié)機制是不可或缺的。在前期的工作中,我們篩選獲得了m~6A去甲基化酶FTO的候選靶基因MZF1并初步確定了位于該基因mRNA終止密碼子附近的作用位點。本研究在前期工作的基礎上,通過構(gòu)建FTO敲低和過表達穩(wěn)轉(zhuǎn)細胞系進一步確定FTO對MZF1基因的調(diào)節(jié)作用。然后以FTO對MZF1基因mRNA穩(wěn)定性的調(diào)節(jié)作為模型,通過對MZF1基因mRNA終止密碼子附近的作用位點GGACU的突變、替換及其側(cè)翼序列的截短,利用雙熒光素酶實驗研究MZF1基因受FTO調(diào)節(jié)的核心序列及不同RRACH基序的調(diào)節(jié)效率。本研究可以闡明在m~6A調(diào)控mRNA穩(wěn)定性的過程中,RRCAH基序類型及其側(cè)翼序列對調(diào)節(jié)功能的影響,初步揭示m~6A調(diào)節(jié)mRNA穩(wěn)定性的分子機制,為m~6A調(diào)控基因表達的分子機制研究提供重要數(shù)據(jù)。
【圖文】:

過程,堿基序列,甲基化酶,機制研究


哈爾濱工業(yè)大學理學碩士學位論文RRACH 序列,也于 m6A 修飾位點兩側(cè)的堿基序列有關。最近盡管隨著 m6A 研的熱潮大量介導 m6A 修飾的甲基化酶,去甲基化酶,與結(jié)合蛋白,,功能與機制研究和揭示,但相關 m6A 發(fā)生的堿基序列特征尚不明確,而對于這些基序的研工作對于了解 m6A 的機制與功能是必不可少的。

循環(huán)相關,蛋白,功能機制,理學碩士


哈爾濱工業(yè)大學理學碩士學位論文它使用低復雜性區(qū)域識別 m6A 修飾暴露的基序,定位于細胞核中,與前體 RNA 結(jié)合進而影響 mRNA 的剪切,翻譯與表達。通過 m6A 結(jié)合蛋白可以將不同的調(diào)節(jié)或功能機制募集到含 m6A 的 mRNA 中,因此影響靶 mRNA 的命運[25]。
【學位授予單位】:哈爾濱工業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:Q78

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本文編號:2633086

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