基于生物信息學(xué)研究茶多酚EGCG對小鼠腸道菌群及代謝的影響
發(fā)布時間:2023-02-18 20:49
近年來,隨著生物組學(xué)及高通量測序技術(shù)的蓬勃發(fā)展,利用生物信息學(xué)的分析軟件和分析方法,對生物大數(shù)據(jù)進(jìn)行解析,可高效全面地揭示龐大、復(fù)雜的生物數(shù)據(jù)中包含的生物學(xué)奧秘。表沒食子兒茶素沒食子酸酯(EGCG)是茶葉茶多酚中含量最高的一種具有強(qiáng)抗氧化活性的多酚類物質(zhì),能有效清除機(jī)體自由基,延緩衰老。然而,EGCG抗衰老作用機(jī)制較為復(fù)雜,尚未完全清楚。本研究通過連續(xù)腹腔注射D-半乳糖建立衰老模型,利用UPLC-QTOF/MS代謝組學(xué)分析技術(shù)和Illumina MiSeq高通量測序技術(shù),結(jié)合生物信息學(xué)方法,研究EGCG對衰老小鼠腸道菌群及體內(nèi)代謝的影響,從而揭示衰老的生物學(xué)奧秘,探討EGCG抗衰老作用機(jī)理。主要研究內(nèi)容總結(jié)如下:(1)D-半乳糖致衰老小鼠模型的建立與EGCG的干預(yù)作用。本實驗在10周內(nèi)連續(xù)給小鼠腹腔注射D-半乳糖,建立衰老模型,數(shù)據(jù)顯示衰老小鼠胸腺、脾臟和腦指數(shù)下降,學(xué)習(xí)記憶能力下降,肝、腦組織抗氧化能力減弱,血糖血脂升高,腎功能下降,表明模型復(fù)制成功;進(jìn)一步實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn)EGCG能夠增加衰老小鼠胸腺、脾臟和腦指數(shù),提高肝、腦抗氧化能力、改善學(xué)習(xí)記憶能力、血糖血脂、腎功能等,提示EGCG...
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 引言
1.1 概述
1.2 代謝組學(xué)研究進(jìn)展
1.2.1 代謝組學(xué)概念
1.2.2 代謝組學(xué)研究過程
1.2.3 代謝組學(xué)在衰老研究中的應(yīng)用
1.3 腸道菌群與衰老
1.4 茶葉、茶多酚、表沒食子兒茶素沒食子酸酯(EGCG)
1.4.1 茶葉
1.4.2 茶多酚、EGCG
1.4.3 EGCG生物活性
1.5 研究內(nèi)容、目的和意義
1.5.1 研究內(nèi)容
1.5.2 研究目的和意義
第2章 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠的功效學(xué)研究
2.1 引言
2.2 實驗材料
2.2.1 實驗動物
2.2.2 實驗試劑
2.2.3 實驗儀器
2.3 實驗方法
2.3.1 實驗分組與D-半乳糖致衰老模型的建立
2.3.2 Morris水迷宮實驗
2.3.3 樣本收集
2.3.4 小鼠臟器指數(shù)測定
2.3.5 氧化應(yīng)激測定
2.3.6 血糖、血脂測定
2.3.7 腎功能測定
2.3.8 統(tǒng)計學(xué)分析
2.4 實驗結(jié)果
2.4.1 EGCG對衰老小鼠的一般狀態(tài)觀察
2.4.2 EGCG對衰老小鼠體重的影響
2.4.3 EGCG對衰老小鼠臟器指數(shù)的影響
2.4.4 EGCG對衰老小鼠Morris水迷宮實驗的影響
2.4.5 EGCG對衰老小鼠抗氧化能力的影響
2.4.6 EGCG對衰老小鼠血糖、血脂的影響
2.4.7 EGCG對衰老小鼠腎功能的影響
2.5 討論
2.6 本章小結(jié)
第3章 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠腸道菌群的影響
3.1 引言
3.2 實驗材料
3.2.1 實驗試劑
3.2.2 實驗儀器
3.3 實驗方法
3.3.1 樣本收集
3.3.2 氧化應(yīng)激測定
3.3.3 小鼠體外糞便含水量測定
3.3.4 小鼠盲腸、結(jié)腸內(nèi)容物和體外糞便pH測定
3.3.5 小鼠盲腸、結(jié)腸內(nèi)容物和體外糞便中SCFAs測定
3.3.6 糞便DNA提取和PCR擴(kuò)增
3.3.7 Illumina Miseq測序及分析
3.3.8 統(tǒng)計學(xué)分析
3.4 實驗結(jié)果
3.4.1 EGCG對小鼠小腸抗氧化能力的影響
3.4.2 EGCG對衰老小鼠體外糞便含水量的測定
3.4.3 EGCG對衰老小鼠盲腸、結(jié)腸內(nèi)容物和體外糞便中pH影響
3.4.4 EGCG對衰老小鼠盲腸、結(jié)腸內(nèi)容物和體外糞便中SCFAs的測定
3.4.7 腸道菌群的OTU及多樣性分析
3.4.8 EGCG對衰老小鼠腸道菌群的門水平組成分析
3.4.9 EGCG對衰老小鼠腸道菌群的屬水平組成分析
3.5 討論
3.6 本章小結(jié)
第4章 EGCG對衰老小鼠血液、尿液的代謝組學(xué)研究
4.1 引言
4.2 實驗材料
4.2.1 實驗試劑
4.2.2 實驗儀器
4.3 實驗方法
4.3.1 樣品收集
4.3.2 樣品前處理
4.3.3 UPLC-QTOF/MS條件
4.3.4 數(shù)據(jù)處理
4.4 實驗結(jié)果
4.4.1 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠血清代謝組學(xué)分析
4.4.2 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠尿液代謝組學(xué)分析
4.4.3 代謝通路分析
4.5 本章小結(jié)
第5章 EGCG對衰老小鼠腸道、腦組織的代謝組學(xué)研究
5.1 引言
5.2 實驗材料
5.3 實驗方法
5.3.1 樣品收集
5.3.2 樣品前處理
5.3.3 UPLC-Q-TOF/MS條件
5.3.4 數(shù)據(jù)處理
5.4 實驗結(jié)果
5.4.1 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠腸道代謝組學(xué)分析
5.4.2 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠腦代謝組學(xué)分析
5.4.3 代謝通路分析
5.5 本章小結(jié)
第6章 結(jié)論與展望
6.1 結(jié)論
6.2 進(jìn)一步工作的方向
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
本文編號:3745505
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 引言
1.1 概述
1.2 代謝組學(xué)研究進(jìn)展
1.2.1 代謝組學(xué)概念
1.2.2 代謝組學(xué)研究過程
1.2.3 代謝組學(xué)在衰老研究中的應(yīng)用
1.3 腸道菌群與衰老
1.4 茶葉、茶多酚、表沒食子兒茶素沒食子酸酯(EGCG)
1.4.1 茶葉
1.4.2 茶多酚、EGCG
1.4.3 EGCG生物活性
1.5 研究內(nèi)容、目的和意義
1.5.1 研究內(nèi)容
1.5.2 研究目的和意義
第2章 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠的功效學(xué)研究
2.1 引言
2.2 實驗材料
2.2.1 實驗動物
2.2.2 實驗試劑
2.2.3 實驗儀器
2.3 實驗方法
2.3.1 實驗分組與D-半乳糖致衰老模型的建立
2.3.2 Morris水迷宮實驗
2.3.3 樣本收集
2.3.4 小鼠臟器指數(shù)測定
2.3.5 氧化應(yīng)激測定
2.3.6 血糖、血脂測定
2.3.7 腎功能測定
2.3.8 統(tǒng)計學(xué)分析
2.4 實驗結(jié)果
2.4.1 EGCG對衰老小鼠的一般狀態(tài)觀察
2.4.2 EGCG對衰老小鼠體重的影響
2.4.3 EGCG對衰老小鼠臟器指數(shù)的影響
2.4.4 EGCG對衰老小鼠Morris水迷宮實驗的影響
2.4.5 EGCG對衰老小鼠抗氧化能力的影響
2.4.6 EGCG對衰老小鼠血糖、血脂的影響
2.4.7 EGCG對衰老小鼠腎功能的影響
2.5 討論
2.6 本章小結(jié)
第3章 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠腸道菌群的影響
3.1 引言
3.2 實驗材料
3.2.1 實驗試劑
3.2.2 實驗儀器
3.3 實驗方法
3.3.1 樣本收集
3.3.2 氧化應(yīng)激測定
3.3.3 小鼠體外糞便含水量測定
3.3.4 小鼠盲腸、結(jié)腸內(nèi)容物和體外糞便pH測定
3.3.5 小鼠盲腸、結(jié)腸內(nèi)容物和體外糞便中SCFAs測定
3.3.6 糞便DNA提取和PCR擴(kuò)增
3.3.7 Illumina Miseq測序及分析
3.3.8 統(tǒng)計學(xué)分析
3.4 實驗結(jié)果
3.4.1 EGCG對小鼠小腸抗氧化能力的影響
3.4.2 EGCG對衰老小鼠體外糞便含水量的測定
3.4.3 EGCG對衰老小鼠盲腸、結(jié)腸內(nèi)容物和體外糞便中pH影響
3.4.4 EGCG對衰老小鼠盲腸、結(jié)腸內(nèi)容物和體外糞便中SCFAs的測定
3.4.7 腸道菌群的OTU及多樣性分析
3.4.8 EGCG對衰老小鼠腸道菌群的門水平組成分析
3.4.9 EGCG對衰老小鼠腸道菌群的屬水平組成分析
3.5 討論
3.6 本章小結(jié)
第4章 EGCG對衰老小鼠血液、尿液的代謝組學(xué)研究
4.1 引言
4.2 實驗材料
4.2.1 實驗試劑
4.2.2 實驗儀器
4.3 實驗方法
4.3.1 樣品收集
4.3.2 樣品前處理
4.3.3 UPLC-QTOF/MS條件
4.3.4 數(shù)據(jù)處理
4.4 實驗結(jié)果
4.4.1 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠血清代謝組學(xué)分析
4.4.2 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠尿液代謝組學(xué)分析
4.4.3 代謝通路分析
4.5 本章小結(jié)
第5章 EGCG對衰老小鼠腸道、腦組織的代謝組學(xué)研究
5.1 引言
5.2 實驗材料
5.3 實驗方法
5.3.1 樣品收集
5.3.2 樣品前處理
5.3.3 UPLC-Q-TOF/MS條件
5.3.4 數(shù)據(jù)處理
5.4 實驗結(jié)果
5.4.1 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠腸道代謝組學(xué)分析
5.4.2 EGCG對D-半乳糖致衰老小鼠腦代謝組學(xué)分析
5.4.3 代謝通路分析
5.5 本章小結(jié)
第6章 結(jié)論與展望
6.1 結(jié)論
6.2 進(jìn)一步工作的方向
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間的研究成果
本文編號:3745505
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