喜樹堿衍生物的抗腫瘤定量構(gòu)效關(guān)系研究
發(fā)布時間:2022-08-07 17:56
定量構(gòu)效關(guān)系是現(xiàn)代分析中的一種重要工具,主要是探究結(jié)構(gòu)與性能之間的關(guān)系,在藥物研發(fā)中尤為重要,利用定量構(gòu)效關(guān)系可以得到藥物分子的結(jié)構(gòu)與生物活性之間的關(guān)系,從而去了解藥物分子的作用,然后去指導藥物分子的合成,讓合成更有目的性,減少了資源的浪費并且縮減了藥物分子的研發(fā)周期。癌癥是世界五大絕癥之一,長期困擾著人類。目前國際上癌癥的治療方法有很多,傳統(tǒng)意義上的手術(shù)、放療和化療,現(xiàn)階段的生物療法,但是都對癌癥的治療有不足的的地方。喜樹堿及其衍生物對治療癌癥具有明顯的療效,其對于癌細胞的殺傷抑制作用是在癌細胞分裂的S期,喜樹堿與拓撲異構(gòu)酶I相結(jié)合生成喜樹堿-拓撲異構(gòu)酶I-DNA三元復合物,促進可裂解復合物的穩(wěn)定,阻礙DNA鏈閉合,導致DNA單鏈斷裂,形成“路障”,抑制復制叉的進程,與正在進行的復制叉相遇則會造成不可逆的DNA雙鏈斷裂,最終引起細胞死亡。本論文中,通過查閱大量相關(guān)文獻找到了兩組具有抗腫瘤活性的喜樹堿衍生物分子以及對應的活性數(shù)據(jù)。實驗方法:第一步通過高斯軟件(Gaussian 09)分別對兩組分子進行優(yōu)化,在密度泛函理論的基礎(chǔ)上首先采用B3LYP/6-31g(d,p)進行初步優(yōu)化,然后...
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 喜樹堿綜述
1.1 喜樹堿簡介
1.1.1 喜樹簡介
1.1.2 喜樹堿分子的發(fā)現(xiàn)和分子理化性質(zhì)
1.2 喜樹堿目前的研究現(xiàn)狀
1.2.1 拓撲替康研究現(xiàn)狀
1.2.2 伊利替康研究現(xiàn)狀
1.2.3 其他喜樹堿衍生物的研究現(xiàn)狀
1.3 喜樹堿抗腫瘤機制
1.4 課題研究的主要內(nèi)容
1.4.1 兩組喜樹堿衍生物結(jié)構(gòu)參數(shù)的確定
1.4.2 兩組喜樹堿衍生物的活性數(shù)據(jù)半數(shù)抑制率(IC_(50))
第二章 定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)概述
2.1 定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)簡介
2.1.1 定量構(gòu)效關(guān)系的發(fā)展
2.1.2 定量構(gòu)效關(guān)系研究方法
2.2 高斯軟件(Gaussian)
2.2.1 計算化學
2.2.2 Gaussian和 GaussView軟件的簡介
2.2.3 GaussView的功能
2.2.4 Gaussian的功能
2.3 主成分分析
2.3.1 SPSS軟件介紹
2.3.2 主成分分析方法分析原理和過程
2.3.3 主成分計算的主要步驟
2.3.4 主成分分析在SPSS19.0 中的主要計算方法
2.4 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)
2.4.1 MATLAB軟件簡介
2.4.2 MATLAB軟件的優(yōu)點
2.4.3 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)
第三章 第一組喜樹堿類衍生物的定量構(gòu)效關(guān)系研究
3.1 第一組喜樹堿衍生物分子的結(jié)構(gòu)和活性數(shù)據(jù)
3.2 第一組喜樹堿衍生物分子的高斯優(yōu)化
3.3 第一組具有抗腫瘤活性的喜樹堿衍生物分子的主成分分析
3.3.1 第一組喜樹堿衍生物分子結(jié)構(gòu)參數(shù)標準化處理
3.3.2 第一組喜樹堿衍生物分子結(jié)構(gòu)參數(shù)的因子分析
3.3.3 第一組喜樹堿衍生物分子的主成分得分
3.3.4 第一組喜樹堿衍生物分子的主成分分析結(jié)果討論
3.4 第一組喜樹堿衍生物分子的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預測
第四章 第二組喜樹堿衍生物分子的定量構(gòu)效關(guān)系研究
4.1 第二組喜樹堿衍生物分子結(jié)構(gòu)和活性數(shù)據(jù)
4.2 第二組喜樹堿衍生物分子的高斯優(yōu)化
4.3 第二組具有抗腫瘤活性的喜樹堿衍生物分子的主成分分析
4.3.1 第二組喜樹堿衍生物分子的結(jié)構(gòu)參數(shù)的標準化處理
4.3.2 第二組喜樹堿衍生物分子結(jié)構(gòu)參數(shù)的因子分析
4.3.3 第二組喜樹堿衍生物分子的主成分得分
4.3.4 第二組喜樹堿衍生物分子的主成分分析總結(jié)
4.4 第二組喜樹堿衍生物分子的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預測
第五章 總結(jié)論
參考文獻
附錄
感謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]應用統(tǒng)計學類課程學習:有“理”才“行”[J]. 曹洪玉,唐乾,唐川,馮寶民. 高教學刊. 2018(23)
[2]中藥消癥湯聯(lián)合羥基喜樹堿膀胱灌注預防膀胱癌術(shù)后復發(fā)的效果及對患者血清VEGF的影響[J]. 劉兵,尹學來,陳國宏,薄海,韓兵. 癌癥進展. 2018(12)
[3]胃癌組織DNA拓撲異構(gòu)酶2α等8種分子的蛋白表達與脈管侵犯的關(guān)系[J]. 戴東方,陳德玉,李小琴,顧漢剛,王德強. 江蘇大學學報(醫(yī)學版). 2018(02)
[4]蔗糖水解反應速率常數(shù)測定實驗數(shù)據(jù)處理方法的改進[J]. 殷悅,洪琴,孫凱鋮,王奇,張海鵬,張增俠,錢彬,王旭濤,濮亞敏,胡俊逸,徐華劍,陳定奔,陳丹,鐘愛國. 當代化工. 2018(02)
[5]微生物組學中的高維計數(shù)和成分數(shù)據(jù)分析[J]. 吳昌晶,何順,鄧明華. 中國科學:數(shù)學. 2017(12)
[6]DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)者——莫里斯·威爾金斯[J]. 張建. 生物學通報. 2017(12)
[7]基于Matlab的遺傳算法在結(jié)構(gòu)優(yōu)化設(shè)計中的應用[J]. 吳立華,白潔,左亞軍,譚國所,劉永福,李克天. 機電工程技術(shù). 2017(10)
[8]Gaussian09軟件在結(jié)構(gòu)化學教學中的應用:分子軌道的分析[J]. 梁錦霞. 廣東化工. 2017(16)
[9]Gaussian09軟件在結(jié)構(gòu)化學教學中的應用:優(yōu)化分子的結(jié)構(gòu)[J]. 梁錦霞. 廣東化工. 2017(15)
[10]Gaussian09/GaussView5.0在分析化學教學中的應用[J]. 黎唯,謝惠定,黃燕,宋流東,邵婭婷,邱開雄. 昆明醫(yī)科大學學報. 2016(10)
博士論文
[1]基于因子分析多元有序Logistic回歸對慢性胰腺炎分級診斷模型的研究[D]. 邊云.第二軍醫(yī)大學 2016
碩士論文
[1]喜樹堿類抗腫瘤藥物的設(shè)計、合成與構(gòu)效關(guān)系研究[D]. 陳海樂.蘭州大學 2017
[2]基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的QSAR模型在混合物聯(lián)合毒性中的應用研究[D]. 趙亞玲.電子科技大學 2017
[3]依據(jù)UGT1A1基因型調(diào)整伊立替康劑量對FOLFIRI方案治療轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌的毒性和療效影響的前瞻性臨床研究[D]. 秦雙.安徽醫(yī)科大學 2017
[4]新型喜樹堿類化合物ZH-001的抗腫瘤活性及其分子機制研究[D]. 張卉.浙江工業(yè)大學 2016
[5]基于遺傳算法的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的優(yōu)化研究及MATLAB仿真[D]. 任謝楠.天津師范大學 2014
[6]基于MATLAB GUI的多功能計算系統(tǒng)設(shè)計及實現(xiàn)[D]. 鄧昌瑞.南昌大學 2012
[7]基于MATLAB的數(shù)據(jù)采集與分析系統(tǒng)的研究及設(shè)計[D]. 姜衍猛.山東大學 2012
[8]新型拓撲異構(gòu)酶I抑制劑的計算機設(shè)計、合成與抗腫瘤活性研究[D]. 付小旦.溫州大學 2010
本文編號:3670779
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 喜樹堿綜述
1.1 喜樹堿簡介
1.1.1 喜樹簡介
1.1.2 喜樹堿分子的發(fā)現(xiàn)和分子理化性質(zhì)
1.2 喜樹堿目前的研究現(xiàn)狀
1.2.1 拓撲替康研究現(xiàn)狀
1.2.2 伊利替康研究現(xiàn)狀
1.2.3 其他喜樹堿衍生物的研究現(xiàn)狀
1.3 喜樹堿抗腫瘤機制
1.4 課題研究的主要內(nèi)容
1.4.1 兩組喜樹堿衍生物結(jié)構(gòu)參數(shù)的確定
1.4.2 兩組喜樹堿衍生物的活性數(shù)據(jù)半數(shù)抑制率(IC_(50))
第二章 定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)概述
2.1 定量構(gòu)效關(guān)系(QSAR)簡介
2.1.1 定量構(gòu)效關(guān)系的發(fā)展
2.1.2 定量構(gòu)效關(guān)系研究方法
2.2 高斯軟件(Gaussian)
2.2.1 計算化學
2.2.2 Gaussian和 GaussView軟件的簡介
2.2.3 GaussView的功能
2.2.4 Gaussian的功能
2.3 主成分分析
2.3.1 SPSS軟件介紹
2.3.2 主成分分析方法分析原理和過程
2.3.3 主成分計算的主要步驟
2.3.4 主成分分析在SPSS19.0 中的主要計算方法
2.4 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)
2.4.1 MATLAB軟件簡介
2.4.2 MATLAB軟件的優(yōu)點
2.4.3 BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)
第三章 第一組喜樹堿類衍生物的定量構(gòu)效關(guān)系研究
3.1 第一組喜樹堿衍生物分子的結(jié)構(gòu)和活性數(shù)據(jù)
3.2 第一組喜樹堿衍生物分子的高斯優(yōu)化
3.3 第一組具有抗腫瘤活性的喜樹堿衍生物分子的主成分分析
3.3.1 第一組喜樹堿衍生物分子結(jié)構(gòu)參數(shù)標準化處理
3.3.2 第一組喜樹堿衍生物分子結(jié)構(gòu)參數(shù)的因子分析
3.3.3 第一組喜樹堿衍生物分子的主成分得分
3.3.4 第一組喜樹堿衍生物分子的主成分分析結(jié)果討論
3.4 第一組喜樹堿衍生物分子的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預測
第四章 第二組喜樹堿衍生物分子的定量構(gòu)效關(guān)系研究
4.1 第二組喜樹堿衍生物分子結(jié)構(gòu)和活性數(shù)據(jù)
4.2 第二組喜樹堿衍生物分子的高斯優(yōu)化
4.3 第二組具有抗腫瘤活性的喜樹堿衍生物分子的主成分分析
4.3.1 第二組喜樹堿衍生物分子的結(jié)構(gòu)參數(shù)的標準化處理
4.3.2 第二組喜樹堿衍生物分子結(jié)構(gòu)參數(shù)的因子分析
4.3.3 第二組喜樹堿衍生物分子的主成分得分
4.3.4 第二組喜樹堿衍生物分子的主成分分析總結(jié)
4.4 第二組喜樹堿衍生物分子的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預測
第五章 總結(jié)論
參考文獻
附錄
感謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]應用統(tǒng)計學類課程學習:有“理”才“行”[J]. 曹洪玉,唐乾,唐川,馮寶民. 高教學刊. 2018(23)
[2]中藥消癥湯聯(lián)合羥基喜樹堿膀胱灌注預防膀胱癌術(shù)后復發(fā)的效果及對患者血清VEGF的影響[J]. 劉兵,尹學來,陳國宏,薄海,韓兵. 癌癥進展. 2018(12)
[3]胃癌組織DNA拓撲異構(gòu)酶2α等8種分子的蛋白表達與脈管侵犯的關(guān)系[J]. 戴東方,陳德玉,李小琴,顧漢剛,王德強. 江蘇大學學報(醫(yī)學版). 2018(02)
[4]蔗糖水解反應速率常數(shù)測定實驗數(shù)據(jù)處理方法的改進[J]. 殷悅,洪琴,孫凱鋮,王奇,張海鵬,張增俠,錢彬,王旭濤,濮亞敏,胡俊逸,徐華劍,陳定奔,陳丹,鐘愛國. 當代化工. 2018(02)
[5]微生物組學中的高維計數(shù)和成分數(shù)據(jù)分析[J]. 吳昌晶,何順,鄧明華. 中國科學:數(shù)學. 2017(12)
[6]DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)者——莫里斯·威爾金斯[J]. 張建. 生物學通報. 2017(12)
[7]基于Matlab的遺傳算法在結(jié)構(gòu)優(yōu)化設(shè)計中的應用[J]. 吳立華,白潔,左亞軍,譚國所,劉永福,李克天. 機電工程技術(shù). 2017(10)
[8]Gaussian09軟件在結(jié)構(gòu)化學教學中的應用:分子軌道的分析[J]. 梁錦霞. 廣東化工. 2017(16)
[9]Gaussian09軟件在結(jié)構(gòu)化學教學中的應用:優(yōu)化分子的結(jié)構(gòu)[J]. 梁錦霞. 廣東化工. 2017(15)
[10]Gaussian09/GaussView5.0在分析化學教學中的應用[J]. 黎唯,謝惠定,黃燕,宋流東,邵婭婷,邱開雄. 昆明醫(yī)科大學學報. 2016(10)
博士論文
[1]基于因子分析多元有序Logistic回歸對慢性胰腺炎分級診斷模型的研究[D]. 邊云.第二軍醫(yī)大學 2016
碩士論文
[1]喜樹堿類抗腫瘤藥物的設(shè)計、合成與構(gòu)效關(guān)系研究[D]. 陳海樂.蘭州大學 2017
[2]基于人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的QSAR模型在混合物聯(lián)合毒性中的應用研究[D]. 趙亞玲.電子科技大學 2017
[3]依據(jù)UGT1A1基因型調(diào)整伊立替康劑量對FOLFIRI方案治療轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌的毒性和療效影響的前瞻性臨床研究[D]. 秦雙.安徽醫(yī)科大學 2017
[4]新型喜樹堿類化合物ZH-001的抗腫瘤活性及其分子機制研究[D]. 張卉.浙江工業(yè)大學 2016
[5]基于遺傳算法的BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的優(yōu)化研究及MATLAB仿真[D]. 任謝楠.天津師范大學 2014
[6]基于MATLAB GUI的多功能計算系統(tǒng)設(shè)計及實現(xiàn)[D]. 鄧昌瑞.南昌大學 2012
[7]基于MATLAB的數(shù)據(jù)采集與分析系統(tǒng)的研究及設(shè)計[D]. 姜衍猛.山東大學 2012
[8]新型拓撲異構(gòu)酶I抑制劑的計算機設(shè)計、合成與抗腫瘤活性研究[D]. 付小旦.溫州大學 2010
本文編號:3670779
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