刺梨(Rosa roxburghii Tratt.,2n=2x=14)屬薔薇科(Rosaceae)薔薇屬(Rosa),主要分布于我國西南地區(qū),以貴州的種質(zhì)資源最為豐富。迄今對刺梨的遺傳背景知之甚少,基因組信息更是缺乏,導(dǎo)致可用的遺傳標(biāo)記及相關(guān)的遺傳多樣性研究極其有限。本研究利用前期轉(zhuǎn)錄組及基因組調(diào)研圖測序開發(fā)的SSR標(biāo)記,并結(jié)合ITS和cpDNA序列,對包括貴州、云南、四川、重慶、湖南、湖北、陜西7省(市)共29個野生刺梨居群的遺傳多樣性、遺傳結(jié)構(gòu)及親緣地理學(xué)等信息進(jìn)行了分析。主要研究結(jié)果如下:1.結(jié)合EST-SSR和nSSR各10對引物對29個野生刺梨居群共255份材料進(jìn)行遺傳多樣性分析,結(jié)果表明,與薔薇科桃、梨、中國櫻桃等植物相比,刺梨居群的遺傳多樣性處于適中到較高水平(Na=4.00,Ne=3.11,I=1.14,Ho=0.84,He=0.67,Nei’s=0.62),其中以織金(ZJ)居群遺傳多樣性最高;基于ITS序列變異分析結(jié)果共發(fā)現(xiàn)9個核苷酸變異,據(jù)此定義了10個單倍型,也表現(xiàn)出適中的遺傳多樣性水平(Hd=0.247,π=0.00040),并以水城(SC)居群遺傳多樣性最高...

【文章頁數(shù)】：92 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1部分引物在6個野生刺梨（A、B、C、D、E、F）和無籽刺梨（G）、金櫻子（H）、懸鉤子薔薇（I）中的擴(kuò)增（引物026、027、028、029、030信息見表5）

圖1部分引物在6個野生刺梨（A、B、C、D、E、F）和無籽刺梨（G）、金櫻子（H）、懸鉤子薔薇（I）中的擴(kuò)增（引物026、027、028、029、030信息見表5）Fig.1Amplificationofprimer26,27,28,29and30sh....

圖2引物70對255份材料的擴(kuò)增Fig.2Amplificationofprimer70showedin255materials50bp—F

圖2引物70對255份材料的擴(kuò)增g.2Amplificationofprimer70showedin255mate結(jié)果性的nSSR引物在所有樣品上均能擴(kuò)增出清的擴(kuò)增條帶在4～10條之間，平均7.3條，其87.67%（表4）。圖3為引....

圖3引物028對255份材料的擴(kuò)增Fig.3Amplificationofprimer028showedin255materials3.1.2群體遺傳多樣性分析

27圖3引物028對255份材料的擴(kuò)增Fig.3Amplificationofprimer028showedin255materials3.1.2群體遺傳多樣性分析3.1.2.1基于EST-SSR群體遺傳多樣性分析采用卡方檢驗(yàn)對各居群的多基因座位....

圖4基于STRUCTURE分析對刺梨類群數(shù)的數(shù)學(xué)模型建立Fig.4ModelingofclusternumberforR.roxburghiiusingSTRUCTURE

圖4基于STRUCTURE分析對刺梨類群數(shù)的數(shù)學(xué)模型建立Fig.4ModelingofclusternumberforR.roxburghiiusingSTRUCTURE類群1和2在29個刺梨群體中分布的情況有所不同（圖5，其中紅色代表類....

本文編號：3981934