為了從分子水平研究玉木耳褐變的機理,對褐變和未褐變的玉木耳子實體進行了轉錄組測序分析,共篩選到5915個差異基因,其中有924個Unigene上調表達,有4991個Unigene下調表達。通過基因本體(Gene Ontology, GO)富集分析發(fā)現(xiàn),差異基因顯著富集于細胞及代謝過程、單一有機體、細胞和細胞組分、細胞器和大分子復合體、結合作用和催化活性。KEGG代謝通路富集分析表明,富集程度比較顯著的通路包括翻譯通路、信號轉導途徑、內分泌系統(tǒng)、折疊排序及退化、運輸和分解代謝通路。挑選與組織褐變相關的差異基因進行qRT-PCR表達模式驗證,獲得的結果與表達譜分析結果一致。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 總RNA的提取、cDNA文庫構建及轉錄組測序
    1.3 序列組裝
    1.4 基因注釋
    1.5 差異表達基因分析
    1.6 qRT-PCR驗證測序結果
2 結果與分析
    2.1 轉錄組測序數(shù)據(jù)組裝及統(tǒng)計
    2.2 轉錄組Unigene的功能注釋
    2.3 Unigene的功能注釋和分類
    2.4 差異表達基因KEGG富集分析
    2.5 轉錄組的實時熒光定量PCR驗證
3 討論



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