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矩陣設(shè)計檢測金針菇轉(zhuǎn)化子外源DNA插入位點

發(fā)布時間:2023-04-28 05:01
  插入位點分析對于金針菇功能基因組學(xué)的研究極為重要,分析方法常用反向PCR、熱不對稱交錯PCR、Tail-PCR、染色體步移等,存在操作復(fù)雜、消耗時間長、特異性較差、效率低等缺點。近年來開始應(yīng)用基因組重測序的方法,對轉(zhuǎn)化子逐一測序與分析,工作量較大、費用較高。本研究應(yīng)用矩陣設(shè)計,把多個轉(zhuǎn)化子的DNA混合構(gòu)成樣品池,重測序后分析插入位點,M個樣品池的測序數(shù)據(jù)可分析M×(M+1)/2個轉(zhuǎn)化子的插入位點。應(yīng)用矩陣設(shè)計構(gòu)建6個樣品池檢測21個轉(zhuǎn)化子,獲得21個插入位點,表明這種方法可行、適合大樣本分析,如突變體庫。

【文章頁數(shù)】:10 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 供試菌株
    1.2 DNA提取與PCR檢測
    1.3 矩陣設(shè)計樣品池
    1.4 基因組重測序
    1.5 插入位點分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 DNA樣品檢測與轉(zhuǎn)化子鑒定
    2.2 插入位點分析
    2.3 插入位點PCR驗證
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本文編號:3803792

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