越橘杜鵑花類菌根共生相關miRNA前體克隆及功能初探
發(fā)布時間:2021-08-20 04:39
越橘的果實富含碳水化合物及多種微量元素,具有多種生理活性功能。在自然界中,越橘根系一般會與真菌共生形成菌根,其可促進越橘對營養(yǎng)和水分的吸收,增加越橘對環(huán)境脅迫的抵抗能力。侵染越橘的菌根真菌為內(nèi)生菌根真菌,專性寄生杜鵑花科植物,被稱為杜鵑花類菌根真菌(Ericoid mycorrhizal fungi,EMF)。大量研究顯示MicroRNA(miRNA)在菌根形成過程中起著重要作用,為挖掘菌根共生相關miRNA并了解其作用機制,本研究從菌根侵染過程中差異表達的miRNA入手,分析其靶基因功能以及miRNA對其靶基因的調(diào)控作用;并通過miRNA過表達及沉默策略分析miRNA前體功能。研究結果如下:(1)以越橘組培苗為材料,對越橘根系接種杜鵑花類菌根真菌Cryptosporiopsis ericae菌株ZE103;對未接種及接種一、二、三周的越橘毛根組織實施轉(zhuǎn)錄組測序。對過濾后的轉(zhuǎn)錄組原始數(shù)據(jù)進行挖掘,篩選出9種差異表達miRNA的靶基因Unigene。對149個miRNA靶基因的GO富集分析顯示,miRNA靶基因主要富集于細胞(Cell)、細胞結構(Cell part)、細胞器(Organ...
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1轉(zhuǎn)錄組de?novo組裝圖解??Figure?2-1?Schematic?overview?of?the?assembly?process?in?transcriptome?de?novo??
圖2-3?9種miRNA預測?
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【參考文獻】:
期刊論文
[1]菌根真菌提高植物耐鹽性的研究進展[J]. 張建峰,謝金宏,田磊,吉麗,陳德國,田春杰. 北方園藝. 2019(23)
[2]miR-186過表達慢病毒載體的構建及鑒定[J]. 李勝男,王夢旭,胡偉東,陳少鳳,陳杏蘭,李友. 吉林大學學報(醫(yī)學版). 2019(05)
[3]叢枝菌根真菌提高林木抗逆性機制研究進展[J]. 胡華英,曹升,張虹,周垂帆,何宗明,馬祥慶. 世界林業(yè)研究. 2019(02)
[4]改進莖環(huán)引物RT-PCR法實時定量檢測microRNA[J]. 薛慧慧,馬驍驍,朱長保,晁天柱,肖君華,周宇荀. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2014(28)
博士論文
[1]礦質(zhì)養(yǎng)分對枳(Poncirus trifoliata L.Raf)根毛生長發(fā)育的影響及其與叢枝菌根形成的關系[D]. 曹秀.華中農(nóng)業(yè)大學 2014
本文編號:3352830
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:71 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1轉(zhuǎn)錄組de?novo組裝圖解??Figure?2-1?Schematic?overview?of?the?assembly?process?in?transcriptome?de?novo??
圖2-3?9種miRNA預測?
調(diào)控作用。??Level2?GO?terms?of?all??120?1?卜?79.47??100-?r?66.23??1|」丨|上??k曙丨??/??、?^?^?c/?pj-ncess.??/?穿》.?/?^?-ilijia??Comno^nt??I?§?/?/?Woiecuiar?Fimcticr:??/?/?/?/?/?/??Biological?Process?Cellular?Component?Molecular?Function??圖2-4差異miRNA靶基因GO二級Term注釋結果??Figure?2-4?Secondary?GO-term?annotation?result?of?target?genes?cut?by?differential??expression?miRNAs??2.3.4?9種miRNA朝基因的KEGG通路分析??KEGG功能富集結果顯示,9種miRNA靶基因可富集至22條調(diào)控途徑。依據(jù)各通??路的大類進行排序,基因信息處理(Genetic?information?processing)及代謝(Metabolism)??類所包含的基因數(shù)較多,分別為68和65個。在各調(diào)控途徑中,剪接體調(diào)控途徑??(Splicesome.?ko03040?)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白加工途徑(Protein?processing?in?endoplasmic??reticulum.?ko04141?)、核糖體生物發(fā)生途徑(Ribosome?biogenesis?in?eukaryotes.?ko03008)??及胞吞作用調(diào)控途徑(End〇Cyt〇Sis,k〇04144)富集的基因數(shù)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]菌根真菌提高植物耐鹽性的研究進展[J]. 張建峰,謝金宏,田磊,吉麗,陳德國,田春杰. 北方園藝. 2019(23)
[2]miR-186過表達慢病毒載體的構建及鑒定[J]. 李勝男,王夢旭,胡偉東,陳少鳳,陳杏蘭,李友. 吉林大學學報(醫(yī)學版). 2019(05)
[3]叢枝菌根真菌提高林木抗逆性機制研究進展[J]. 胡華英,曹升,張虹,周垂帆,何宗明,馬祥慶. 世界林業(yè)研究. 2019(02)
[4]改進莖環(huán)引物RT-PCR法實時定量檢測microRNA[J]. 薛慧慧,馬驍驍,朱長保,晁天柱,肖君華,周宇荀. 現(xiàn)代生物醫(yī)學進展. 2014(28)
博士論文
[1]礦質(zhì)養(yǎng)分對枳(Poncirus trifoliata L.Raf)根毛生長發(fā)育的影響及其與叢枝菌根形成的關系[D]. 曹秀.華中農(nóng)業(yè)大學 2014
本文編號:3352830
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