植物自交不親和性（self-incompatibility,SI）是植物在進化過程中形成的一種遺傳機制,能夠維持植物的遺傳多樣性,實現(xiàn)遺傳重組,在被子植物的進化過程中發(fā)揮了重要的作用。目前,在蘭科植物中自交親和性植株占大多數(shù),但也存在自交不親和的類群,其中束花石斛又占了大約3/4。本研究以國家蘭科中心栽培的束花石斛為材料,通過Illumina技術(shù)對束花石斛自交和異交的轉(zhuǎn)錄組進行了測序及組裝,并利用基因克隆、遺傳轉(zhuǎn)化等研究手段對束花石斛自交親和、不親和的分子機制進行了分析研究,初步篩選出一些有關(guān)束花石斛自交不親和的基因。具體研究結(jié)果如下;1)首次對束花石斛進行轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得51,577,372條clean reads,數(shù)據(jù)量達到5.16G。利用SOAPdenovo軟件以及Trinity軟件最終組裝到91,457個有功能注釋的unigenes,其平均長度為1105bp。2)通過對蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫進行Blast搜索,共有25,208條Unigene被注釋,其中多數(shù)基因可劃歸于44個功能條目、25個蛋白族和256條KEGG途徑。3)將束花石斛三個轉(zhuǎn)錄組中的All-Unigenes按照表達量（R... 

【文章來源】：深圳大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

pCAMBIA1302載體結(jié)構(gòu)示意圖

圖 6 miRNA 測序信息分析流程2.2.6.3 基于同源性篩選出的潛在候選 miRNA我們可參考 FriedlanderMR 以及 WenM 等人的方法來進行篩選[51,52]。具體方法見附錄 72.2.6.4 候選 miRNA 的靶基因預(yù)測我們對通過測序得到的 known-miRNA 以及 novel-miRNA 進行靶基因的預(yù)測，根據(jù)植物 miRNA 獨有的特點(與靶基因匹配度高)，因此我們采用了計算機預(yù)測的方法對其進行靶基因預(yù)測。

束花石斛自交不親和的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及相關(guān) miRNA 的挖掘3、結(jié)果與分析石斛轉(zhuǎn)錄組測序及其生物信息學(xué)分析石斛總 RNA 提取及其質(zhì)量檢測 RNA 經(jīng)核酸電泳檢測結(jié)果如下圖所示，三個組樣品所提28S 兩條帶，凝膠電泳顯示無明顯降解情況。通過 NanoDH4、ZH4、CK 組的 RNA 樣品的 A260/A280 比值，分別為 1 1.9 和 2.2 之間，并且三個組的 RNA 濃度分別為：325ng/μL、RNA 總量都在 30μg 以上；符合建庫要求。

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號：3262389