柑橘潰瘍病是一種世界性的植物檢疫病害,發(fā)病后在葉、枝和果上形成火山口狀病斑,影響果實(shí)外觀,嚴(yán)重時(shí)造成落葉落果,影響果樹(shù)長(zhǎng)勢(shì)、柑橘產(chǎn)量和品質(zhì),造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。柑橘潰瘍病的發(fā)生除了與品種抗性、田間管理和防治措施等因素密切相關(guān)外,還與葉際微生物種群結(jié)構(gòu)及其多樣性有一定的關(guān)系。而柑橘潰瘍病病葉與未發(fā)病葉片葉表細(xì)菌種群結(jié)構(gòu)的差異,以及葉際微生物與潰瘍病菌種群數(shù)量變化之間的相關(guān)分析一直鮮見(jiàn)報(bào)道。因此,本文以患潰瘍病的冰糖橙植株為研究對(duì)象,采用基于16s rDNA的V3-V4可變區(qū)的Miseq測(cè)序技術(shù)和熒光定量PCR（qPCR）,比較分析發(fā)病與未發(fā)病冰糖橙葉表細(xì)菌種群結(jié)構(gòu)、數(shù)量以及葉際細(xì)菌與柑橘潰瘍病菌種群數(shù)量及發(fā)病情況的關(guān)系；分析討論潰瘍病潰瘍病菌發(fā)病對(duì)冰糖橙葉際細(xì)菌種群結(jié)構(gòu)和組成的影響以及發(fā)生過(guò)程中可能的協(xié)同或拮抗菌群。具體研究結(jié)果如下：（1）病葉葉表細(xì)菌Miseq高通量測(cè)序的數(shù)據(jù)量多于未發(fā)病葉片樣品。通過(guò)Miseq平臺(tái)測(cè)序和后續(xù)生物信息學(xué)分析,總共從20個(gè)樣品中獲得了390,929條Tags,平均每個(gè)樣品19,546.45條tags。其中未發(fā)病葉片葉表總序列有187,012條tags,平均... 

【文章來(lái)源】：湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)湖南省

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 前言
    1.1 葉際微生物
        1.1.1 葉際微生物群落組成
        1.1.2 葉際微生物的特點(diǎn)
        1.1.3 葉際微生物與外界的互作
        1.1.4 影響葉際微生物種群多樣性的因素
    1.2 柑橘潰瘍病
    1.3 基于免培養(yǎng)法的微生物多樣性研究進(jìn)展
    1.4 本論文的研究目的與意義
2 冰糖橙葉表細(xì)菌多樣性分析
    2.1 試驗(yàn)材料
        2.1.1 供試材料
        2.1.2 本研究采用的試劑盒及常用試劑
        2.1.3 儀器設(shè)備
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 葉表微生物宏基因組DNA的提取
        2.2.2 葉表微生物宏基因組DNA質(zhì)量檢測(cè)
        2.2.3 建立文庫(kù)與測(cè)序
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 葉表面微生物宏基因組DNA質(zhì)量檢測(cè)
        2.3.2 葉表細(xì)菌的Miseq測(cè)序與分析
    2.4 討論
        2.4.1 高通量測(cè)序及數(shù)據(jù)處理
        2.4.2 葉表細(xì)菌物種及其豐度分析
3 柑橘潰瘍病菌種群豐度與發(fā)病的關(guān)聯(lián)分析
    3.1 試驗(yàn)材料
        3.1.1 樣品來(lái)源
        3.1.2 儀器設(shè)備
    3.2 試驗(yàn)方法
        3.2.1 柑橘潰瘍病的分離和鑒定
        3.2.2 潰瘍病發(fā)病情指數(shù)調(diào)查
        3.2.3 柑橘潰瘍病菌種群豐度的相對(duì)定量分析
        3.2.4 一些葉表細(xì)菌群落與Xanthomonas種群豐度的關(guān)聯(lián)分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 菌種分離和保存
        3.3.2 潰瘍病的鑒定
        3.3.3 潰瘍病發(fā)病情況調(diào)查結(jié)果
        3.3.4 柑橘潰瘍病菌種群豐度的相對(duì)定量分析
        3.3.5 一些優(yōu)勢(shì)屬與Xanthomonas種群豐度的關(guān)聯(lián)分析
    3.4 討論
4 全文總結(jié)
    4.1 主要結(jié)論
    4.2 創(chuàng)新點(diǎn)
    4.3 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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[2]高通量測(cè)序等分子生物學(xué)技術(shù)研究填埋場(chǎng)生物反應(yīng)器脫氮微生物群落變化[D]. 王潔.華東師范大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3256948