【目的】探究江西鉛山紅芽芋對(duì)超低溫療法脫毒的轉(zhuǎn)錄組響應(yīng)機(jī)制,為江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗的規(guī)�；瘧�(yīng)用奠定理論依據(jù)。【方法】以江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗（VF組）和江西鉛山紅芽芋超低溫療法帶毒苗（V組）試驗(yàn)材料進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組比較分析。【結(jié)果】VF組Clean reads為42 406 188,GC含量為54.09%;V組Clean reads為46 818 060,GC含量為50.36%。VF組和V組表達(dá)量FPKM的對(duì)數(shù)值在0～2,表達(dá)量密度在0～0.8。VF組和V組表達(dá)的共有基因數(shù)為23 820,V組單獨(dú)表達(dá)的基因數(shù)為10 298,VF組單獨(dú)表達(dá)的基因數(shù)為4 477。VF組和V組表達(dá)量的相關(guān)系數(shù)為0.287,樣本間相關(guān)性較差。VF組和V組共產(chǎn)生差異表達(dá)基因5 282個(gè),與V組比較,VF組上調(diào)基因3 011,下調(diào)基因2 271。GO富集分析顯示,差異基因主要注釋到過(guò)氧化氫分解過(guò)程、過(guò)氧化氫代謝過(guò)程、一元羧酸生物合成過(guò)程、多糖分解代謝過(guò)程、金屬離子輸運(yùn)、細(xì)胞外區(qū)、細(xì)胞壁、外部封裝結(jié)構(gòu)、膜的固有成分、質(zhì)膜固有成分、核酸結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子活性、序列特異性DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子活性、單加氧酶活性、鐵離... 

【文章來(lái)源】：福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2020,35(10)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：13 頁(yè)

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 RNA提取
        1.2.2 Illumina Hiseq測(cè)序
        1.2.3 數(shù)據(jù)分析
        1.2.4 差異基因的q RT-PCR驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
    2.1 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗測(cè)序數(shù)據(jù)產(chǎn)出分析
    2.2 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗測(cè)序數(shù)據(jù)與組裝結(jié)果
    2.3 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗表達(dá)量分析
    2.4 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗表達(dá)量樣本間Venn分析
    2.5 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗表達(dá)量樣本間相關(guān)性分析
    2.6 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗差異表達(dá)分析
    2.7 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗差異表達(dá)基因GO富集分析
    2.8 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗差異表達(dá)基因KEGG注釋
    2.9 江西鉛山紅芽芋超低溫療法脫毒苗相關(guān)差異表達(dá)基因的q RT-PCR分析驗(yàn)證
3 討論與結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[4]冷凍脅迫轉(zhuǎn)金柑MLP2–1基因擬南芥的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和代謝通路[J]. 滕進(jìn)婧,李夢(mèng)蕓,郭純,何瑩,喬克威,楊華.  湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(04)
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碩士論文
[1]百子蓮胚性愈傷組織超低溫保存中鈣離子的分布變化及逆境應(yīng)答機(jī)制初探[D]. 何廣深.上海交通大學(xué) 2014



本文編號(hào)：3230387