miR156-SPL模式調(diào)控蘋果耐鹽性的研究
發(fā)布時間:2021-06-02 17:09
蘋果(Malus domestica)是薔薇科蘋果屬的一種多年生落葉喬木,在我國種植范圍較廣。近年來全球土地的鹽漬化和次生鹽漬化現(xiàn)象也越來越嚴(yán)重,鹽脅迫嚴(yán)重影響著蘋果的質(zhì)量和產(chǎn)量。本實驗室前期對耐鹽的‘寒富’蘋果同源四倍體及‘寒富’蘋果進行數(shù)字表達(dá)譜和小RNA組測序分析發(fā)現(xiàn)miR156-SPL模式表達(dá)水平呈現(xiàn)顯著差異。已有報道m(xù)iR156-SPL模式參與調(diào)控植株形態(tài)建成、階段轉(zhuǎn)變、花和果實的發(fā)育等多個生理生化過程。本研究以蘋果miR156a和MdSPL3基因作為研究對象,探究兩者在鹽脅迫作用下調(diào)控蘋果耐鹽性的機制。主要研究結(jié)果如下:1.‘寒富’蘋果同源四倍體植株葉片寬厚、顏色深綠,其葉片的光合特性和葉綠素?zé)晒鈪?shù)明顯優(yōu)于二倍體;鹽脅迫處理下,‘寒富’蘋果同源四倍體的耐鹽性要明顯強于二倍體。miR156a和MdSPL3基因在‘寒富’蘋果及其同源四倍體葉片中差異表達(dá),且miR156a和MdSPL3基因的表達(dá)均受鹽脅迫的影響。RLM-5’RACE結(jié)果表明MdSPL3基因轉(zhuǎn)錄本3’UTR區(qū)域有miR156a靶位點,且該切割位點在miR156a的5’端的第10和11位的C和U堿基之間。證明蘋果m...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:106 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
RNA-seq實驗流程(祁云霞等,2011)
Fig.2 Process of RNA-seq2.2.14.3 生物信息學(xué)分析生物信息學(xué)分析流程如圖3所示:獲得高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)之后,利用各種軟件的分析獲得Unigene的注釋信息;之后運用WEGO軟件(http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl)進行GO基因功能分類;采用DE-Seq進行樣品組間的差異表達(dá)分析,獲得樣品之間的差異表達(dá)基因(Differentially Expressed Gene,DEG)集;采用Benjamini-Hochberg方法進行校正。
圖 4 ‘寒富’蘋果及其同源四倍體植株形態(tài)差異A:一年生‘寒富’蘋果及其同源四倍體幼苗;B:二年生‘寒富’蘋果及其同源四倍體幼苗Fig.4 The morphological differences of plants in diploid and autotetraploid ‘Hanfu’ apple One-year old diploid and autotetraploid ‘Hanfu’apple seedlings; B:Two-year old diploid and autotetraploid ‘Hanfu’aplants1.2 ‘寒富’蘋果及其同源四倍體葉片的形態(tài)差異‘寒富’蘋果及其同源四倍體幼苗在葉片形態(tài)上表現(xiàn)出明顯的不同。如圖1所示,與體相比,‘寒富’蘋果同源四倍體植株的葉片寬厚,葉色深綠。如表9所示,與二倍體
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米轉(zhuǎn)錄因子ZmSPL16的克隆與功能鑒定[J]. 崔揚,馮彥輝,陳眾峰,王曉敏,王云鵬,杜賢章. 分子植物育種. 2019(20)
[2]NaCl對旱柳生長發(fā)育及部分生理特性的影響[J]. 李斌彬,歐陽潔,王嘉玥,吳航楓,劉祥君,鄒金華. 天津師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(06)
[3]蘋果‘長富2號’開花調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子基因MdSPL6的克隆及表達(dá)分析[J]. 樊勝,張嵐清,劉柯,雷超,陳欣,姚殿城,張東,韓明玉. 園藝學(xué)報. 2016(11)
[4]蘋果MdSBP20基因抗非生物脅迫的研究[J]. 沙婷,侯鴻敏,孟祥娜,柏素花,周愛琴,沙廣利,戴洪義,祝軍. 華北農(nóng)學(xué)報. 2016(03)
[5]蘋果WRKY基因家族生物信息學(xué)及表達(dá)分析[J]. 谷彥冰,冀志蕊,遲福梅,喬壯,徐成楠,張俊祥,董慶龍,周宗山. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(16)
[6]植物轉(zhuǎn)錄因子家族在耐鹽抗旱調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的作用[J]. 李田,孫景寬,劉京濤. 生命科學(xué). 2015(02)
[7]鹽脅迫下氮素形態(tài)對油菜和水稻幼苗離子運輸和分布的影響[J]. 劉梅,鄭青松,劉兆普,郭世偉. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報. 2015(01)
[8]水稻OsWRKY轉(zhuǎn)錄因子對非生物脅迫響應(yīng)的重疊表達(dá)特性分析[J]. 孫利軍,黃磊,李大勇,張慧娟,宋鳳鳴. 植物生理學(xué)報. 2014(11)
[9]果樹耐鹽性研究進展[J]. 靳娟,魯曉燕,王依. 園藝學(xué)報. 2014(09)
[10]蘋果全基因組SBP-box基因家族分析及代表成員的分子克隆[J]. 張曉輝,魏小春,李錫香,孫玉燕,王冠,常兆晶,劉冠群,邱楊,宋江萍,王海平,沈鏑,王大江,韓月澎. 園藝學(xué)報. 2014(02)
博士論文
[1]蘋果紅肉位點基因MdMYB10調(diào)控硝酸鹽吸收和分配的機理研究[D]. 劉鑫.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]棉花衰老相關(guān)WRKY基因的克隆與功能分析[D]. 竇玲玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]旱地棉(Gossypium aridum)耐鹽相關(guān)WRKY轉(zhuǎn)錄因子的全基因組鑒定、克隆及功能分析[D]. 范昕琦.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]黃瓜低溫脅迫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄因子CsWRKY46和CsWRKY21的表達(dá)特征與功能分析[D]. 張穎.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[5]草莓和蘋果DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因分離及表達(dá)分析[D]. 常琳琳.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]蘋果葉片離體再生不定芽及遺傳轉(zhuǎn)化的研究[D]. 張志宏.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 1996
碩士論文
[1]蘋果MdWRKY33基因的克隆與功能分析[D]. 張遠(yuǎn)嬿.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]百合體胚發(fā)生過程中miR171及其靶基因SCL6的鑒定與表達(dá)分析[D]. 賈娜娜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]番茄果實后熟與葉片衰老相關(guān)的S1WRKY轉(zhuǎn)錄因子功能分析[D]. 王璐.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]蘋果高效遺傳轉(zhuǎn)化體系建立及轉(zhuǎn)miR156和rSPL9基因的研究[D]. 李文然.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]玉米ZmWRKY4參與ZmMPK5調(diào)節(jié)的抗氧化防護[D]. 洪長勇.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號:3210423
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:106 頁
【學(xué)位級別】:博士
【部分圖文】:
RNA-seq實驗流程(祁云霞等,2011)
Fig.2 Process of RNA-seq2.2.14.3 生物信息學(xué)分析生物信息學(xué)分析流程如圖3所示:獲得高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)之后,利用各種軟件的分析獲得Unigene的注釋信息;之后運用WEGO軟件(http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl)進行GO基因功能分類;采用DE-Seq進行樣品組間的差異表達(dá)分析,獲得樣品之間的差異表達(dá)基因(Differentially Expressed Gene,DEG)集;采用Benjamini-Hochberg方法進行校正。
圖 4 ‘寒富’蘋果及其同源四倍體植株形態(tài)差異A:一年生‘寒富’蘋果及其同源四倍體幼苗;B:二年生‘寒富’蘋果及其同源四倍體幼苗Fig.4 The morphological differences of plants in diploid and autotetraploid ‘Hanfu’ apple One-year old diploid and autotetraploid ‘Hanfu’apple seedlings; B:Two-year old diploid and autotetraploid ‘Hanfu’aplants1.2 ‘寒富’蘋果及其同源四倍體葉片的形態(tài)差異‘寒富’蘋果及其同源四倍體幼苗在葉片形態(tài)上表現(xiàn)出明顯的不同。如圖1所示,與體相比,‘寒富’蘋果同源四倍體植株的葉片寬厚,葉色深綠。如表9所示,與二倍體
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米轉(zhuǎn)錄因子ZmSPL16的克隆與功能鑒定[J]. 崔揚,馮彥輝,陳眾峰,王曉敏,王云鵬,杜賢章. 分子植物育種. 2019(20)
[2]NaCl對旱柳生長發(fā)育及部分生理特性的影響[J]. 李斌彬,歐陽潔,王嘉玥,吳航楓,劉祥君,鄒金華. 天津師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2017(06)
[3]蘋果‘長富2號’開花調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子基因MdSPL6的克隆及表達(dá)分析[J]. 樊勝,張嵐清,劉柯,雷超,陳欣,姚殿城,張東,韓明玉. 園藝學(xué)報. 2016(11)
[4]蘋果MdSBP20基因抗非生物脅迫的研究[J]. 沙婷,侯鴻敏,孟祥娜,柏素花,周愛琴,沙廣利,戴洪義,祝軍. 華北農(nóng)學(xué)報. 2016(03)
[5]蘋果WRKY基因家族生物信息學(xué)及表達(dá)分析[J]. 谷彥冰,冀志蕊,遲福梅,喬壯,徐成楠,張俊祥,董慶龍,周宗山. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(16)
[6]植物轉(zhuǎn)錄因子家族在耐鹽抗旱調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的作用[J]. 李田,孫景寬,劉京濤. 生命科學(xué). 2015(02)
[7]鹽脅迫下氮素形態(tài)對油菜和水稻幼苗離子運輸和分布的影響[J]. 劉梅,鄭青松,劉兆普,郭世偉. 植物營養(yǎng)與肥料學(xué)報. 2015(01)
[8]水稻OsWRKY轉(zhuǎn)錄因子對非生物脅迫響應(yīng)的重疊表達(dá)特性分析[J]. 孫利軍,黃磊,李大勇,張慧娟,宋鳳鳴. 植物生理學(xué)報. 2014(11)
[9]果樹耐鹽性研究進展[J]. 靳娟,魯曉燕,王依. 園藝學(xué)報. 2014(09)
[10]蘋果全基因組SBP-box基因家族分析及代表成員的分子克隆[J]. 張曉輝,魏小春,李錫香,孫玉燕,王冠,常兆晶,劉冠群,邱楊,宋江萍,王海平,沈鏑,王大江,韓月澎. 園藝學(xué)報. 2014(02)
博士論文
[1]蘋果紅肉位點基因MdMYB10調(diào)控硝酸鹽吸收和分配的機理研究[D]. 劉鑫.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]棉花衰老相關(guān)WRKY基因的克隆與功能分析[D]. 竇玲玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]旱地棉(Gossypium aridum)耐鹽相關(guān)WRKY轉(zhuǎn)錄因子的全基因組鑒定、克隆及功能分析[D]. 范昕琦.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]黃瓜低溫脅迫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄因子CsWRKY46和CsWRKY21的表達(dá)特征與功能分析[D]. 張穎.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2012
[5]草莓和蘋果DNA甲基轉(zhuǎn)移酶基因分離及表達(dá)分析[D]. 常琳琳.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
[6]蘋果葉片離體再生不定芽及遺傳轉(zhuǎn)化的研究[D]. 張志宏.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 1996
碩士論文
[1]蘋果MdWRKY33基因的克隆與功能分析[D]. 張遠(yuǎn)嬿.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]百合體胚發(fā)生過程中miR171及其靶基因SCL6的鑒定與表達(dá)分析[D]. 賈娜娜.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]番茄果實后熟與葉片衰老相關(guān)的S1WRKY轉(zhuǎn)錄因子功能分析[D]. 王璐.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[4]蘋果高效遺傳轉(zhuǎn)化體系建立及轉(zhuǎn)miR156和rSPL9基因的研究[D]. 李文然.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]玉米ZmWRKY4參與ZmMPK5調(diào)節(jié)的抗氧化防護[D]. 洪長勇.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號:3210423
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