甘藍顯性蠟質(zhì)缺失基因BoGL-3的精細定位與候選基因分析
發(fā)布時間:2021-05-24 13:58
結球甘藍(Brassica oleracea L.var.capitata L.)簡稱甘藍,屬于十字花科蕓薹屬植物,其營養(yǎng)豐富、適應性強,是一種重要的栽培蔬菜。葉球顏色是甘藍重要的品質(zhì)性狀,甘藍蠟質(zhì)缺失突變體由于表皮蠟質(zhì)的缺失,球葉表現(xiàn)為亮綠色,具有較好的商品性。蠟質(zhì)缺失突變體研究對于深入理解植物蠟質(zhì)合成調(diào)控途徑和亮綠甘藍種質(zhì)創(chuàng)新具有重要的意義。本研究以甘藍顯性蠟質(zhì)缺失突變體cgl-3為材料,對顯性蠟質(zhì)缺失基因BoGL-3進行了精細定位,并對定位區(qū)段內(nèi)的基因進行了分析,為BoGL-3的克隆和功能驗證奠定了基礎。研究結果如下:1.以蠟質(zhì)缺失甘藍cgl-3和普通芥藍DH系939為雙親構建六世代群體,F1和BC1P1植株全部表現(xiàn)為蠟質(zhì)缺失;F2群體和BC1P2群體中的蠟質(zhì)缺失植株與正常植株分別符合3:1和1:1的分離比,進一步證明突變體cgl-3的蠟質(zhì)缺失性狀為單基因顯性遺傳。2.根據(jù)BSA法篩選多態(tài)性標記并利用F2群體的隱性單株對蠟質(zhì)缺失...
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
英文縮略表
第一章 引言
1.1 植物表皮蠟質(zhì)研究進展
1.1.1 表皮蠟質(zhì)功能
1.1.2 植物蠟質(zhì)結構
1.1.3 植物蠟質(zhì)的化學組成與含量
1.1.4 植物蠟質(zhì)的生物合成
1.1.5 植物蠟質(zhì)的調(diào)控
1.2 蕓薹屬植物蠟質(zhì)缺失突變體研究進展
1.3 RNA-seq在蕓薹屬植物研究中的應用
1.3.1 分子標記的開發(fā)及輔助育種
1.3.2 探索植物發(fā)育的分子調(diào)控機理
1.3.3 基因發(fā)掘
1.4 本研究目的意義
第二章 蠟質(zhì)缺失基因的定位
2.1 試驗材料與方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 DNA提取
2.1.3 基因定位
2.2 結果與分析
2.2.1 引物篩選
2.2.2 基因定位
2.3 討論
第三章 蠟質(zhì)缺失突變體的轉(zhuǎn)錄組分析
3.1 試驗方法
3.1.1 參考基因組分析
3.1.2 RNA-seq分析
3.2 試驗結果與分析
3.2.1 參考基因組注釋結果
3.2.2 RNA提取和檢測結果
3.2.3 轉(zhuǎn)錄組測序結果
3.3 討論
第四章 顯性蠟質(zhì)缺失體候選基因分析
4.1 實驗材料
4.2 實驗方法
4.2.1 候選基因亞細胞定位分析
4.2.2 候選基因編碼蛋白的性質(zhì)分析
4.2.3 候選基因熒光定量PCR以及PCR檢測
4.3 實驗結果
4.3.1 候選基因編碼蛋白的亞細胞定位結果
4.3.2 候選基因編碼蛋白的分析
4.3.3 熒光定量PCR以及PCR檢測
4.4 討論
第五章 全文結論
參考文獻
附錄
致謝
作者簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組分析挖掘油菜耐旱基因[J]. 王冰,王勤方,唐天向,唐偉杰,李麗萍,隋麗波,孫超,張慧,夏張婷,林良斌. 基因組學與應用生物學. 2018(11)
[2]植物蠟質(zhì)研究進展[J]. 王春語,張麗霞,高國珍. 遼寧農(nóng)業(yè)科學. 2018(05)
[3]花椰菜轉(zhuǎn)錄組SSR位點分析及其分子標記開發(fā)[J]. 林琿,李永平,薛珠政,陳敏氡,朱海生,溫慶放. 西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版). 2019(03)
[4]小麥不同器官表皮蠟質(zhì)的組分及晶體結構分析[J]. 趙帥,羅文巧,王聰,吳洪啟,汪勇,王中華,權力. 麥類作物學報. 2018(08)
[5]基于高通量測序的青花菜早期發(fā)育小孢子轉(zhuǎn)錄組分析與基因功能注釋[J]. 張振超,姚悅梅,毛忠良,孫國勝,秦文斌,戴忠良. 核農(nóng)學報. 2018(05)
[6]甘藍型油菜種子發(fā)育灌漿后期的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 熊輝巖,段瑞君,王瑞生,孟慶志. 分子植物育種. 2018(15)
[7]草地早熟禾葉表皮蠟質(zhì)及其對海拔變化的響應[J]. 姚露花,倪郁,郭娜,和玉吉,高建花,郭彥軍. 草業(yè)學報. 2018(01)
[8]新型紫色大白菜15NG28后代的鑒別及其轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 張德雙,趙泓,張鳳蘭,余陽俊,趙岫云,于拴倉,汪維紅,蘇同兵,盧桂香. 華北農(nóng)學報. 2017(06)
[9]大白菜花發(fā)育不同時期的轉(zhuǎn)錄組研究[J]. 李改珍,齊仙惠,李梅蘭,趙軍良,王秀英,巫東堂. 山西農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2017(10)
[10]OsWR2-RNAi對水稻角質(zhì)層生物合成和耐旱性的影響[J]. 王莎,賀勇,羅光宇,姚敏,張旭,陳信波,周小云. 作物學報. 2017(03)
碩士論文
[1]高濃度CO2調(diào)控表皮蠟質(zhì)合成的研究[D]. 劉秀林.中國科學院武漢植物園 2017
[2]結球甘藍亮綠性狀遺傳與基因的精細定位[D]. 唐俊.中國農(nóng)業(yè)科學院 2015
[3]紅菜薹蠟粉性狀遺傳分析與基因初步定位[D]. 李紅蓮.華中農(nóng)業(yè)大學 2014
[4]結球甘藍無蠟粉亮綠性狀遺傳分析及分子標記研究[D]. 李景濤.中國農(nóng)業(yè)科學院 2012
本文編號:3204306
【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
英文縮略表
第一章 引言
1.1 植物表皮蠟質(zhì)研究進展
1.1.1 表皮蠟質(zhì)功能
1.1.2 植物蠟質(zhì)結構
1.1.3 植物蠟質(zhì)的化學組成與含量
1.1.4 植物蠟質(zhì)的生物合成
1.1.5 植物蠟質(zhì)的調(diào)控
1.2 蕓薹屬植物蠟質(zhì)缺失突變體研究進展
1.3 RNA-seq在蕓薹屬植物研究中的應用
1.3.1 分子標記的開發(fā)及輔助育種
1.3.2 探索植物發(fā)育的分子調(diào)控機理
1.3.3 基因發(fā)掘
1.4 本研究目的意義
第二章 蠟質(zhì)缺失基因的定位
2.1 試驗材料與方法
2.1.1 植物材料
2.1.2 DNA提取
2.1.3 基因定位
2.2 結果與分析
2.2.1 引物篩選
2.2.2 基因定位
2.3 討論
第三章 蠟質(zhì)缺失突變體的轉(zhuǎn)錄組分析
3.1 試驗方法
3.1.1 參考基因組分析
3.1.2 RNA-seq分析
3.2 試驗結果與分析
3.2.1 參考基因組注釋結果
3.2.2 RNA提取和檢測結果
3.2.3 轉(zhuǎn)錄組測序結果
3.3 討論
第四章 顯性蠟質(zhì)缺失體候選基因分析
4.1 實驗材料
4.2 實驗方法
4.2.1 候選基因亞細胞定位分析
4.2.2 候選基因編碼蛋白的性質(zhì)分析
4.2.3 候選基因熒光定量PCR以及PCR檢測
4.3 實驗結果
4.3.1 候選基因編碼蛋白的亞細胞定位結果
4.3.2 候選基因編碼蛋白的分析
4.3.3 熒光定量PCR以及PCR檢測
4.4 討論
第五章 全文結論
參考文獻
附錄
致謝
作者簡歷
【參考文獻】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組分析挖掘油菜耐旱基因[J]. 王冰,王勤方,唐天向,唐偉杰,李麗萍,隋麗波,孫超,張慧,夏張婷,林良斌. 基因組學與應用生物學. 2018(11)
[2]植物蠟質(zhì)研究進展[J]. 王春語,張麗霞,高國珍. 遼寧農(nóng)業(yè)科學. 2018(05)
[3]花椰菜轉(zhuǎn)錄組SSR位點分析及其分子標記開發(fā)[J]. 林琿,李永平,薛珠政,陳敏氡,朱海生,溫慶放. 西北農(nóng)林科技大學學報(自然科學版). 2019(03)
[4]小麥不同器官表皮蠟質(zhì)的組分及晶體結構分析[J]. 趙帥,羅文巧,王聰,吳洪啟,汪勇,王中華,權力. 麥類作物學報. 2018(08)
[5]基于高通量測序的青花菜早期發(fā)育小孢子轉(zhuǎn)錄組分析與基因功能注釋[J]. 張振超,姚悅梅,毛忠良,孫國勝,秦文斌,戴忠良. 核農(nóng)學報. 2018(05)
[6]甘藍型油菜種子發(fā)育灌漿后期的轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 熊輝巖,段瑞君,王瑞生,孟慶志. 分子植物育種. 2018(15)
[7]草地早熟禾葉表皮蠟質(zhì)及其對海拔變化的響應[J]. 姚露花,倪郁,郭娜,和玉吉,高建花,郭彥軍. 草業(yè)學報. 2018(01)
[8]新型紫色大白菜15NG28后代的鑒別及其轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 張德雙,趙泓,張鳳蘭,余陽俊,趙岫云,于拴倉,汪維紅,蘇同兵,盧桂香. 華北農(nóng)學報. 2017(06)
[9]大白菜花發(fā)育不同時期的轉(zhuǎn)錄組研究[J]. 李改珍,齊仙惠,李梅蘭,趙軍良,王秀英,巫東堂. 山西農(nóng)業(yè)大學學報(自然科學版). 2017(10)
[10]OsWR2-RNAi對水稻角質(zhì)層生物合成和耐旱性的影響[J]. 王莎,賀勇,羅光宇,姚敏,張旭,陳信波,周小云. 作物學報. 2017(03)
碩士論文
[1]高濃度CO2調(diào)控表皮蠟質(zhì)合成的研究[D]. 劉秀林.中國科學院武漢植物園 2017
[2]結球甘藍亮綠性狀遺傳與基因的精細定位[D]. 唐俊.中國農(nóng)業(yè)科學院 2015
[3]紅菜薹蠟粉性狀遺傳分析與基因初步定位[D]. 李紅蓮.華中農(nóng)業(yè)大學 2014
[4]結球甘藍無蠟粉亮綠性狀遺傳分析及分子標記研究[D]. 李景濤.中國農(nóng)業(yè)科學院 2012
本文編號:3204306
本文鏈接:http://www.sikaile.net/nykjlw/yylw/3204306.html
最近更新
教材專著