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森林草莓基因組中DNA甲基化修飾酶基因的鑒定及初步研究

發(fā)布時(shí)間:2021-04-05 23:52
  DNA甲基化是植物重要的表觀遺傳修飾之一。目前,已發(fā)現(xiàn)DNA甲基化與植物的生長發(fā)育、形態(tài)建成等方面有著密切的聯(lián)系,但是關(guān)于DNA甲基化對植物果實(shí)發(fā)育的影響,尤其是對非呼吸躍變型果實(shí)發(fā)育影響的研究很少。在本研究中,我們首先對森林草毒(Fragaria vesca)等作物中的DNA甲基化修飾基因進(jìn)行了鑒定,發(fā)現(xiàn)森林草莓中有9個含DNA甲基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域的基因(包括8個DNA甲基化酶基因,1個tRNA甲基化酶基因),以及4個DNA去甲基化酶基因。對鑒定出的這些基因進(jìn)行進(jìn)化分析、結(jié)構(gòu)域分析、motif結(jié)構(gòu)、外顯子結(jié)構(gòu)等分析,發(fā)現(xiàn)也可分為與之前研究相一致的幾類。森林草莓的甲基化酶分為四類,其中CMT3家族有3個,MET1家族有1個,DRM1/2家族有4個,甲基化tRNA的DNMT2家族有1個;DNA去甲基化酶有兩類,其中DME家族有1個,DML(ROS1、DML2、DML3)家族有3個。前人研究表明,森林草莓從薔薇科分化出來后,近期并未發(fā)生明顯的基因復(fù)制事件,我們的Mcscan結(jié)果也發(fā)現(xiàn):森林草莓中已鑒定出的這些基因,近期并未涉及全基因組擴(kuò)張事件(Whole-genome duplications... 

【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:79 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

森林草莓基因組中DNA甲基化修飾酶基因的鑒定及初步研究


DNA甲基化酶和去甲基化酶基因在15個物種中的分布數(shù)目Figure2-1NumbersofinvestigatedgenesencodingDNAmethyltransferaseanddemethylaseinthe15species

修飾基因,甲基化,甲基化酶,轉(zhuǎn)色


2.2?DNA甲基化修飾酶基因在森林草莓果實(shí)發(fā)育后期的表達(dá)情況分析??我們選取了草莓果實(shí)發(fā)育及成熟過程中的五個關(guān)鍵時(shí)期:大綠果期、白果期、轉(zhuǎn)??色前期、粉果期、紅果期(圖3-2),并用qRT-RCR檢測了草莓果實(shí)發(fā)育及成熟過程??中幾個關(guān)鍵時(shí)期,DNA甲基化酶基因和DNA去甲基化酶基因的表達(dá)情況(圖3-3)。??觀察果實(shí)發(fā)育后期的表達(dá)情況(圖3-3),發(fā)現(xiàn)八個DNA甲基化酶中有三種??(抑-艦/辦/〇從2,?Fv-we/Z^/os#,Fv-wcY/y/teeP)在轉(zhuǎn)色前期表達(dá)量最高,三種??(Fv-嫌/%/os’e7,jPv-we/Z^/as^,/^-艦 ̄/似65)在粉果期表達(dá)量最高。四個DNA??去甲基化酶基因中有兩個(Fv-Jeme/Z^/ave/,?Fv-tfewe//2_y/osx,J)是在轉(zhuǎn)色前期表達(dá)量??最高。從RT-qRCR結(jié)果整體來看,有很多DNA甲基化酶和DNA去甲基化酶基因都??是在轉(zhuǎn)色前期或粉果期表達(dá)量最高

森林,甲基化酶,去甲基化,酶基因


Fv-demethylase1??Fv:dIml。樱。幔桑澹?DME-丨?ike(DML)??圖3-3?DNA甲基化酶基因和DNA去甲基化酶基因在果實(shí)不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)情況??Figure3-3?Expression?proiles?of?DNA?methylase?genes?and?DNA?demethylase?genes??during?fr

【參考文獻(xiàn)】:
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博士論文
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碩士論文
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本文編號:3120338

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