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基于橄欖果實(shí)轉(zhuǎn)錄組的多酚代謝相關(guān)差異基因表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-03-09 02:22
  橄欖是中國(guó)南方的一種具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值和藥理作用的亞熱帶果樹,然而不同品種之間的多酚含量和口感風(fēng)味差異較大,且缺少基因組和轉(zhuǎn)錄組水平等遺傳信息,嚴(yán)重阻礙了優(yōu)質(zhì)橄欖品種的選育以及果實(shí)品質(zhì)特征的研究,比如多酚類物質(zhì)的代謝調(diào)控。本研究以普通‘長(zhǎng)營(yíng)’品種和它的芽變品種‘清欖’作為實(shí)驗(yàn)材料,測(cè)定其果實(shí)多酚和黃酮含量,并首次利用Illumina高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)技術(shù)來篩選兩種橄欖品種多酚代謝過程中差異表達(dá)的基因。主要研究結(jié)果如下:1.采用紫外分光光度法測(cè)定‘長(zhǎng)營(yíng)’和‘清欖’果實(shí)不同發(fā)育階段多酚和黃酮含量。結(jié)果表明,從花后40d開始,‘長(zhǎng)營(yíng)’和‘清欖’果實(shí)的多酚含量隨著生長(zhǎng)而逐漸升高,到130d左右達(dá)到最高峰,隨后開始降低;‘長(zhǎng)營(yíng)’的黃酮含量變化趨勢(shì)也是如此,雖然‘清欖’的黃酮含量在70d-100d階段稍微下降,但是總體含量依然呈上升趨勢(shì),均到130d左右達(dá)到最高峰,然后開始下降,且‘長(zhǎng)營(yíng)’果實(shí)的多酚和黃酮含量約是‘清欖’的2倍。2.針對(duì)橄欖果實(shí)富含酚類、多糖、蛋白質(zhì)等次生代謝物的特點(diǎn),本試驗(yàn)采用了百泰克總RNA抽提試劑盒法,Trizol法和CTAB法三種方法對(duì)橄欖果實(shí)總RNA進(jìn)行提取... 

【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省

【文章頁(yè)數(shù)】:86 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
縮略詞
摘要
Abstract
第一章 前言
    1 研究背景
    2 植物多酚代謝途徑相關(guān)研究進(jìn)展
    3 基因測(cè)序技術(shù)研究進(jìn)展
        3.1 第一代測(cè)序技術(shù)
        3.2 第二代測(cè)序技術(shù)
        3.3 第三代測(cè)序技術(shù)
        3.4 第二代測(cè)序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組研究
            3.4.1 RNA-seq技術(shù)的原理
            3.4.2 RNA-seq技術(shù)的標(biāo)準(zhǔn)分析流程
            3.4.3 RNA-seq技術(shù)的優(yōu)勢(shì)
    4 本研究的目的和意義
第二章 橄欖果實(shí)多酚和黃酮含量的測(cè)定
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 儀器與試劑
        1.3 方法
            1.3.1 多酚含量測(cè)定
            1.3.2 黃酮含量測(cè)定
    2 結(jié)果與分析
        2.1 多酚含量
        2.2 黃酮含量
第三章 橄欖多酚類物質(zhì)代謝途徑關(guān)鍵基因的篩選
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 儀器與試劑
        1.3 方法
            1.3.1 橄欖果實(shí)總RNA提取方法的比較
            1.3.2 cDNA文庫(kù)構(gòu)建
            1.3.3 De novo組裝和注釋
            1.3.4 差異表達(dá)基因的篩選
    2 結(jié)果與分析
        2.1 橄欖果實(shí)總RNA質(zhì)量分析
            2.1.1 凝膠電泳分析
            2.1.2 紫外分光光度計(jì)分析
        2.2 建庫(kù)及De novo組裝結(jié)果
        2.3 功能注釋
        2.4 功能分類及代謝通路富集分析
            2.4.1 KOG注釋
            2.4.2 GO注釋
            2.4.3 KEGG代謝通路富集分析
        2.5 候選差異表達(dá)基因的篩選與鑒定
            2.5.1 主成分分析(PCA)
            2.5.2 差異表達(dá)基因的篩選
            2.5.3 多酚類物質(zhì)代謝相關(guān)基因的鑒定
第四章 橄欖多酚類物質(zhì)代謝關(guān)鍵基因熒光定量PCR驗(yàn)證
    1 材料與方法
        1.1 材料
        1.2 儀器和試劑
        1.3 方法
            1.3.1 橄欖果實(shí)總RNA的提取
            1.3.2 cDNA的合成
            1.3.3 熒光定量PCR
    2 結(jié)果與分析
第五章 討論與結(jié)論
    1 討結(jié)
    2 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]橄欖果實(shí)過氧化物酶和多酚氧化酶酶學(xué)特性研究[J]. 謝倩,陳清西,王威,葉玲,黃麗娜,袁亞芳.  熱帶作物學(xué)報(bào). 2013(08)
[2]橄欖鮮食新品種“清欖1號(hào)”選育初報(bào)[J]. 許長(zhǎng)同,肖振林,朱宗良,楊文榮.  中國(guó)南方果樹. 2013(03)
[3]金絲桃苷藥理作用研究進(jìn)展[J]. 林萍,易宏偉,張斐.  中國(guó)現(xiàn)代中藥. 2012(10)
[4]MeJA處理對(duì)枇杷果實(shí)采后抗氧化活性的影響[J]. 陳偉,金文淵,楊震峰,曹士峰.  中國(guó)食品學(xué)報(bào). 2012(01)
[5]金絲桃苷藥理作用研究進(jìn)展[J]. 黃凱,楊新波,黃正明.  醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2009(08)
[6]橄欖果實(shí)膳食纖維含量及動(dòng)態(tài)變化研究[J]. 歐高政,陳清西.  福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2009(01)
[7]淺談橄欖栽培與管理技術(shù)[J]. 陳志松.  現(xiàn)代園藝. 2009(02)
[8]植物次生代謝途徑的遺傳修飾研究進(jìn)展[J]. 劉蓉蓉.  生物技術(shù)通報(bào). 2008(06)
[9]鞣花酸及其衍生物研究進(jìn)展[J]. 丁運(yùn)生,孫小虎,李有桂,朱凱.  合肥工業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2008(11)
[10]黃酮類化合物生理活性及合成研究進(jìn)展[J]. 延璽,劉會(huì)青,鄒永青,任占華.  有機(jī)化學(xué). 2008(09)

博士論文
[1]橄欖酚類化合物的分離純化和結(jié)構(gòu)研究[D]. 何志勇.江南大學(xué) 2007

碩士論文
[1]安吉白茶階段性返白期間酚類物質(zhì)代謝關(guān)鍵酶基因表達(dá)的動(dòng)態(tài)變化研究[D]. 熊立瑰.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]橄欖中多酚類物質(zhì)的分離純化及功能性研究[D]. 陳崗.西南大學(xué) 2009
[3]橄欖葉總黃酮代謝和提取工藝優(yōu)化及其抗氧化作用[D]. 林烽.福建農(nóng)林大學(xué) 2008



本文編號(hào):3072081

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