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三疣梭子蟹分子標(biāo)記與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性分析

發(fā)布時(shí)間:2025-01-11 02:36
  為了改進(jìn)三疣梭子蟹人工養(yǎng)殖及遺傳育種工作,本文利用公共數(shù)據(jù)庫(kù)法開發(fā)了三疣梭子蟹多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記,并通過(guò)這些微衛(wèi)星標(biāo)記及AFLP技術(shù)對(duì)其生長(zhǎng)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析,利用分子標(biāo)記輔助選育提高三疣梭子蟹養(yǎng)殖產(chǎn)量。 本研究通過(guò)公共數(shù)據(jù)庫(kù)法篩選三疣梭子蟹多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn),首先通過(guò)軟件SRHUNTER13.0查找含有微衛(wèi)星的序列,最終得到1578條含有微衛(wèi)星的EST序列。選取150條EST序列使用Primer5.0設(shè)計(jì)微衛(wèi)星引物,其中27個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)具有豐富的多態(tài)性。遺傳多樣性分析結(jié)果表明每個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)目從3-14個(gè)不等,等位基因平均數(shù)目為6.8個(gè),觀測(cè)雜合度(Ho)的范圍從0.233-1.000,期望雜合度(He)的范圍從0.160-0.789,PIC值的范圍為0.222-0.875。 利用本研究開發(fā)的微衛(wèi)星位點(diǎn)以及AFLP技術(shù),對(duì)三疣梭子蟹Y1單對(duì)家系的F1代進(jìn)行生長(zhǎng)性狀進(jìn)行相關(guān)性分析。經(jīng)過(guò)多態(tài)性檢測(cè),有10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)在F1代中表現(xiàn)出多態(tài)性,AFLP技術(shù)中篩選出13對(duì)多態(tài)性位點(diǎn)清晰的引物組合,并得到85個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)。采用軟件SPSS19.0分析10個(gè)SSR位點(diǎn)及85個(gè)AFLP位...

【文章頁(yè)數(shù)】:55 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

圖2.1三疣梭子蟹基因組DNA電泳結(jié)果

圖2.1三疣梭子蟹基因組DNA電泳結(jié)果

放入上述三洗的蒸餾水中洗5m干燥后,用掃描儀進(jìn)行掃描并統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。胺凝膠電泳(PAGE)條帶擴(kuò)增的情況,以下實(shí)驗(yàn)結(jié)果。先將實(shí)驗(yàn)結(jié)果分別轉(zhuǎn)化格式,分別進(jìn)行每個(gè)SSR位點(diǎn)的等位基因PIC值以及HEW(Hardy-Weinbergequilibrium取結(jié)果DNA的提取是....


圖2.234號(hào)引物PCR瓊脂糖擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.2.2Theagarosepictureofprimersscreeningof34

圖2.234號(hào)引物PCR瓊脂糖擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.2.2Theagarosepictureofprimersscreeningof34

物PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果驗(yàn)以篩選的含有微衛(wèi)星的EST序列,共249條,其中150條適于用來(lái)設(shè)用Primer5.0(http://www.premierbiosoft.com/)對(duì)這150條EST序列分別設(shè)計(jì)衛(wèi)星引物。首先以8個(gè)三疣梭子蟹的D....


圖2.3130號(hào)引物三疣梭子蟹變性聚丙烯酰胺凝膠電泳引物多態(tài)性檢測(cè)Fig.2.3ElectrophoreticpatternofP.trituberculatusmicrosatelliteprimerof130

圖2.3130號(hào)引物三疣梭子蟹變性聚丙烯酰胺凝膠電泳引物多態(tài)性檢測(cè)Fig.2.3ElectrophoreticpatternofP.trituberculatusmicrosatelliteprimerof130

錄每個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)性,經(jīng)過(guò)GENEPOP4.0和CERVERS3.0處理計(jì)算遺傳參數(shù)(表2.2)遺傳多樣性分析結(jié)果表明每個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)目從3-14個(gè)不等,平均等位基因數(shù)為6.8個(gè),觀測(cè)雜合度(Ho)的范圍從0.233-1.000,期望雜合度(He)的范圍從....


圖2.589號(hào)引物三疣梭子蟹變性聚丙烯酰胺凝膠電泳引物多態(tài)性檢測(cè)Fig.2.5ElectrophoreticpatternofP.trituberculatusmicrosatelliteprimerof89

圖2.589號(hào)引物三疣梭子蟹變性聚丙烯酰胺凝膠電泳引物多態(tài)性檢測(cè)Fig.2.5ElectrophoreticpatternofP.trituberculatusmicrosatelliteprimerof89

錄每個(gè)位點(diǎn)的多態(tài)性,經(jīng)過(guò)GENEPOP4.0和CERVERS3.0處理計(jì)算遺傳參數(shù)(表2.2)遺傳多樣性分析結(jié)果表明每個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)目從3-14個(gè)不等,平均等位基因數(shù)為6.8個(gè),觀測(cè)雜合度(Ho)的范圍從0.233-1.000,期望雜合度(He)的范圍從....



本文編號(hào):4025805

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