谷胱甘肽s-轉(zhuǎn)移酶(Glutathione S-transferases, GSTs)是一組廣泛存在于動(dòng)物、植物和微生物等各種生物體內(nèi)的多功能同工酶，其主要功能是催化生物體內(nèi)的谷胱甘肽與外源化合物如有毒異源物或氧化產(chǎn)物的結(jié)合，從而發(fā)揮其解毒及抗氧化作用，由此來(lái)保護(hù)生物體免受損害。條斑紫菜是我國(guó)大面積養(yǎng)殖的重要經(jīng)濟(jì)海藻之一，對(duì)其基因克隆、遺傳變異、抗逆性的分子機(jī)制及進(jìn)化分析等方面的研究具有代表性意義。 為了更深入的了解藻類(lèi)對(duì)于有毒物質(zhì)等的抗性原理，為進(jìn)一步了解GST在藻類(lèi)等低等植物中的功能及抗逆的分子機(jī)制，本實(shí)驗(yàn)首先在KDRI的DNA數(shù)據(jù)庫(kù)中查找到條斑紫菜GST的63條EST序列，采用DNAMAN軟件和NCBI中的BLAST拼接所獲得的EST序列，最終得到三條拼接的EST序列。經(jīng)BLAST比對(duì)后，將其中一條在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中找不到同源序列的EST片段確定為研究對(duì)象，命名為PyGST。通過(guò)設(shè)計(jì)引物并利用3’RACE-PCR技術(shù)擴(kuò)增PyGST基因，最終得到含有完整ORF的PyGST序列。此序列長(zhǎng)度為915bp。運(yùn)用MEGA4.0程序、Protparam、ProtScal、TMpred Ser...

【文章頁(yè)數(shù)】：51 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
引言
第一章 概述
    1.1 紫菜的生物學(xué)特性
        1.1.1 名稱(chēng)及分類(lèi)地位
        1.1.2 形態(tài)結(jié)構(gòu)及生活史
        1.1.3 應(yīng)用價(jià)值和研究?jī)r(jià)值
    1.2 谷胱甘肽 S-轉(zhuǎn)移酶基因的研究概述
        1.2.1 分類(lèi)
        1.2.2 結(jié)構(gòu)
        1.2.3 功能
    1.3 生物信息學(xué)
    1.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)
    1.5 本實(shí)驗(yàn)研究目的、內(nèi)容及意義
第二章 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料的來(lái)源與處理
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)主要儀器及試劑來(lái)源
        2.1.3 相關(guān)溶液及培養(yǎng)基的配制
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 條斑紫菜 RNA 的提取與純化
        2.2.2 PyGST 基因 cDNA 的 3’ RACE-PCR 擴(kuò)增
        2.2.3 生物信息學(xué)分析方法
        2.2.4 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
第三章 結(jié)果與討論
    3.1 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
        3.1.1 條斑紫菜的 RNA 電泳檢測(cè)
        3.1.2 PyGST 基因的 3′RACE-PCR 擴(kuò)增電泳檢測(cè)
        3.1.3 菌液 PCR 電泳檢測(cè)
        3.1.4 序列分析
    3.2 生物信息學(xué)分析
        3.2.1 蛋白質(zhì)序列的理化性質(zhì)分析
        3.2.2 疏水性分析
        3.2.3 跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        3.2.4 信號(hào)肽預(yù)測(cè)
        3.2.5 亞細(xì)胞定位
        3.2.6 蛋白質(zhì)卷曲螺旋結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)
        3.2.7 磷酸化位點(diǎn)的預(yù)測(cè)
        3.2.8 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        3.2.9 結(jié)構(gòu)域分析
        3.2.10 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    3.3 系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的構(gòu)建
    3.4 討論
第四章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文情況
致謝



本文編號(hào)：3852202