魚類是脊椎動(dòng)物中最原始且種屬數(shù)量最多的類群,分布極為廣泛,它的起源復(fù)雜,多樣性程度高、且遺傳多樣性十分豐富,因此其系統(tǒng)進(jìn)化和遺傳多樣性研究是長(zhǎng)期熱點(diǎn)。青鳉屬具有體型小、易繁殖等特點(diǎn),研究深入的日本青鳉等物種已被開發(fā)為重要模式生物。然而,該屬魚類屬于非食用魚類,分布于東南亞和中國(guó)的多個(gè)物種研究滯后。其中,西里伯斯青鳉尚缺少線粒體全序列數(shù)據(jù),而中華青鳉尚缺少群體遺傳學(xué)研究。本研究利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)測(cè)定并注釋了親本源自新加坡的西里伯斯青鳉的線粒體基因組全序列,結(jié)果表明:西里伯斯青鳉線粒體基因組序列全長(zhǎng)為16493bp(Genbank登錄號(hào)為MN064715),堿基組成和基因結(jié)構(gòu)與其他硬骨魚類基本相似,包含37個(gè)基因和1個(gè)控制區(qū)。13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因中,除了COⅠ基因的起始密碼子為GTG外,其余均為ATG。22個(gè)t RNA基因,均能形成完整的三葉草型二級(jí)結(jié)構(gòu)(除t RNA-ser)�；趍t DNA構(gòu)建的青鳉屬進(jìn)化樹顯示,其與薩拉青鳉和花斑青鳉的親緣關(guān)系較近,在系統(tǒng)發(fā)育上屬于較晚分化出來(lái)的物種。本研究獲取了云南保山青華海、吉林莫莫格、云南大理劍湖、云南昆明花紅園、云南麗江拉市海、云南香格里拉納帕海...

【文章頁(yè)數(shù)】：51 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 魚類線粒體基因組研究進(jìn)展
        1.1.1 魚類mtDNA的結(jié)構(gòu)及特征
        1.1.2 魚類線粒體在系統(tǒng)進(jìn)化及遺傳多樣分析中的應(yīng)用
    1.2 青鳉屬魚類研究進(jìn)展
        1.2.1 國(guó)外對(duì)青鳉魚研究現(xiàn)狀
        1.2.2 國(guó)內(nèi)對(duì)青鳉魚研究現(xiàn)狀
        1.2.3 青鳉屬魚類系統(tǒng)發(fā)育分析
    1.3 研究目的及意義
2 西里伯斯青鳉(Oryzias celebensis)線粒體基因組全序列測(cè)定
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 RNA的提取
        2.1.3 序列注釋及分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 西里伯斯青鳉線粒體基因組組成與排列
        2.2.2 堿基組成
        2.2.3 蛋白質(zhì)編碼基因
        2.2.4 轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(tRNA)基因和核糖體RNA(rRNA)基因
        2.2.5 非編碼區(qū)
        2.2.6 以mtDNA基因組為基礎(chǔ)的分子系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
    2.3 討論
3 基于COⅠ基因分析比較不同地理群體中華青鳉(Oryzias sinensis)遺傳多樣性
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 樣本DNA提取
        3.1.3 COⅠ序列擴(kuò)增
        3.1.4 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析
    3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.2.1 堿基組成
        3.2.2 遺傳距離及中性進(jìn)化分析
    3.3 討論
4 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介



本文編號(hào)：3795810