大鱗副泥鰍是鰍科經濟魚類，也是我國出口韓國的重要淡水魚類之一。本研究采用第二代高通量測序平臺對大鱗副泥鰍進行轉錄組測序分析，批量開發(fā)并驗證了大鱗副泥鰍微衛(wèi)星分子標記；分析了中國四大湖泊野生大鱗副泥鰍群體的遺傳結構，并利用建成的大鱗副泥鰍全同胞家系進行生長性狀與微衛(wèi)星分子標記的相關分析，以期為大鱗副泥鰍種質資源保護和良種選育提供一定的參考和理論基礎。1、基于第二代測序的大鱗副泥鰍轉錄組數據分析及微衛(wèi)星分子標記的開發(fā)通過Illumina（2×100HiSeq2000）高通量測序平臺對大鱗副泥鰍進行轉錄組測序，序列組裝后得到71,887條非冗余轉錄組序列，平均長度1464.58bp�；蜃⑨尠l(fā)現與Nr和Sting數據庫有同源性的序列分別有38,733和17,434；對所有序列進行GO （gene ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes andGenomes Pathway database）功能注釋，其中22,102（31.14%）條序列成功注釋到302條代謝通路上。為進一步評價轉錄組測序深度，將本數據庫序列與斑馬魚cDNA數據庫做序列同源性比對... 

【文章來源】：蘇州大學江蘇省 211工程院校

【文章頁數】：79 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

組裝后的序列長度分布

不同長度可變剪接體與Nr數據庫有同源性的比例Figure1-2Comparisonofisogenelengthwithhits.(Longercontigsweremorelikelyto

大鱗副泥鰍可變剪接體的GO功能分類Figure1-3GeneontologyclassificationofParamisgurnusdabryanusisogenes

【參考文獻】：
期刊論文
[1]鯽體長和體高相關的EST-SSR標記的篩選[J]. 崔曉亮,鄭先虎,匡友誼,郭薇,曹頂臣,孫效文.  水產學雜志. 2013(03)
[2]Transcriptome Sequencing and de novo Analysis for Oviductus Ranae of Rana chensinensis Using Illumina RNA-Seq Technology[J]. Mei Zhang,Yuntong Li,Baojin Yao,Minying Sun,Zhiwu Wang,Yu Zhao.  遺傳學報. 2013(03)
[3]馬氏珠母貝生長性狀與EST-SSR標記的關聯分析[J]. 鄧岳文,高遠鎮(zhèn),王學穎,杜曉東.  農業(yè)生物技術學報. 2013(01)
[4]高通量測序技術在動植物研究領域中的應用[J]. 岳桂東,高強,羅龍海,王軍一,許姣卉,尹燁.  中國科學:生命科學. 2012(02)
[5]大鱗副泥鰍7個群體遺傳變異的微衛(wèi)星分析[J]. 游翠紅,童金茍,俞小牧.  水生態(tài)學雜志. 2012(01)
[6]電子標記輔助虹鱒家系建立及快速生長家系篩選[J]. 戶國,谷偉,王鵬,白慶利,王炳謙.  中國水產科學. 2012(01)
[7]蘇州地區(qū)泥鰍與大鱗副泥鰍肌肉微量元素含量比較[J]. 吳焱,時月,凌去非,汪務誠,喬宗禮.  水產養(yǎng)殖. 2011(10)
[8]單細胞凝膠電泳檢測百草枯對大鱗副泥鰍血細胞DNA的損傷[J]. 黨炳俊,王君,杜啟艷,常重杰.  水生態(tài)學雜志. 2011(05)
[9]草魚Ⅰ型微衛(wèi)星標記的發(fā)掘及其多態(tài)性檢測[J]. 李偲,劉航,黃容,李華英,石米娟,廖蘭杰,朱作言,汪亞平.  水生生物學報. 2011(04)
[10]油煙機清潔劑對大鱗副泥鰍胚胎和仔魚的毒性研究[J]. 常重杰,吳小華,楊棟,杜啟艷.  湖北農業(yè)科學. 2011(05)

碩士論文
[1]日糧中不同硒水平對大鱗副泥鰍生理生化指標及肌肉品質的影響[D]. 郝小鳳.蘇州大學 2013
[2]家蠶RAPD-SSR-AFLP三種分子標記綜合連鎖圖譜的構建及圖譜整合[D]. 姜振.蘇州大學 2010



本文編號：3572709