紅鰭東方鲀卵巢與精巢的蛋白質組比較分析
發(fā)布時間:2021-07-27 17:34
為研究紅鰭東方鲀Takifugu rubripes性腺發(fā)生的相關機制,選擇3齡體質量約2.0 kg的紅鰭東方鲀成熟卵巢與精巢組織,利用非標記定量技術(Lable-free)對卵巢與精巢兩種組織蛋白質組進行定性與定量分析,并運用GO、KEGG分析等方法對差異表達的蛋白進行富集分析。結果表明:非標記定量顯示,在兩組織間卵巢中特有的蛋白為150個,精巢中特有的蛋白為132個,有172個在卵巢中表達較高的蛋白及161個在精巢中表達較高的蛋白,在卵巢中存在與卵巢發(fā)育相關的高表達蛋白ELAVL2、RNA helicase、LSM4和FRUYP1,而在精巢中特異表達蛋白GSDF影響精巢發(fā)育;經GO分析發(fā)現,RNA結合(RNA binding)可能影響卵巢發(fā)育,兩組織差異蛋白在膜組成部分(Integral component of membrane)具有最大差值;GO功能顯著性富集分析得出,轉移酶活性(Transferase activity)在兩組織之間差異最顯著;KEGG通路分析顯示,核糖體通路(Ribosome)在兩組織間差異蛋白最多,該通路也可能與性腺發(fā)育相關,通路中核糖體蛋白L10A被證實與...
【文章來源】:大連海洋大學學報. 2020,35(06)北大核心CSCD
【文章頁數】:10 頁
【部分圖文】:
鑒定蛋白對應肽段分布圖
對差異蛋白進行KEGG通路分析顯示,僅有126 個差異蛋白富集到KEGG通路上。確定差異蛋白參與的最主要生化代謝通路和信號轉導通路為核糖體(Ribosome)、吞噬體(Phagosome)、亨廷頓氏病(Huntington’s disease)等,其中,核糖體通路中差異蛋白最多(見電子版附錄A圖A3)。核糖體通路中注釋到的蛋白如圖6所示,該通路在兩組之間的差異可從GO富集分析中反映出來,其大部分差異蛋白發(fā)生在卵巢。而吞噬體通路有10個差異蛋白,其中7個差異蛋白在精巢中高表達或特有,這些富集大量差異蛋白的通路有可能是引起組織差異的某些生物過程。圖3 細胞組分中差異蛋白的GO富集
細胞組分中差異蛋白的GO富集
【參考文獻】:
期刊論文
[1]紅鰭東方鲀不同家系群體的形態(tài)性狀差異與相關性分析[J]. 茍盼盼,王秀利,竇冬雨,荊笛,劉圣聰,劉福君,劉海金,楊君,孟雪松,仇雪梅. 大連海洋大學學報. 2019(05)
[2]河鲀營養(yǎng)研究進展及展望[J]. 廖章斌,徐后國,衛(wèi)育良,梁萌青. 動物營養(yǎng)學報. 2018(04)
[3]河鲀“解禁” 規(guī)模化養(yǎng)殖將成主流[J]. 劉延正,徐承旭. 水產科技情報. 2017(05)
[4]紅鰭東方鲀gsdf基因的克隆及表達模式分析[J]. 閆紅偉,田雨順,姜麗楠,王連順,劉洋,劉奇,劉圣聰. 大連海洋大學學報. 2016(02)
[5]溫度對紅鰭東方鲀早期生長和性別分化的影響[J]. 劉永新,周勤,張紅濤,姜長波,張福崇. 南方水產科學. 2014(05)
本文編號:3306234
【文章來源】:大連海洋大學學報. 2020,35(06)北大核心CSCD
【文章頁數】:10 頁
【部分圖文】:
鑒定蛋白對應肽段分布圖
對差異蛋白進行KEGG通路分析顯示,僅有126 個差異蛋白富集到KEGG通路上。確定差異蛋白參與的最主要生化代謝通路和信號轉導通路為核糖體(Ribosome)、吞噬體(Phagosome)、亨廷頓氏病(Huntington’s disease)等,其中,核糖體通路中差異蛋白最多(見電子版附錄A圖A3)。核糖體通路中注釋到的蛋白如圖6所示,該通路在兩組之間的差異可從GO富集分析中反映出來,其大部分差異蛋白發(fā)生在卵巢。而吞噬體通路有10個差異蛋白,其中7個差異蛋白在精巢中高表達或特有,這些富集大量差異蛋白的通路有可能是引起組織差異的某些生物過程。圖3 細胞組分中差異蛋白的GO富集
細胞組分中差異蛋白的GO富集
【參考文獻】:
期刊論文
[1]紅鰭東方鲀不同家系群體的形態(tài)性狀差異與相關性分析[J]. 茍盼盼,王秀利,竇冬雨,荊笛,劉圣聰,劉福君,劉海金,楊君,孟雪松,仇雪梅. 大連海洋大學學報. 2019(05)
[2]河鲀營養(yǎng)研究進展及展望[J]. 廖章斌,徐后國,衛(wèi)育良,梁萌青. 動物營養(yǎng)學報. 2018(04)
[3]河鲀“解禁” 規(guī)模化養(yǎng)殖將成主流[J]. 劉延正,徐承旭. 水產科技情報. 2017(05)
[4]紅鰭東方鲀gsdf基因的克隆及表達模式分析[J]. 閆紅偉,田雨順,姜麗楠,王連順,劉洋,劉奇,劉圣聰. 大連海洋大學學報. 2016(02)
[5]溫度對紅鰭東方鲀早期生長和性別分化的影響[J]. 劉永新,周勤,張紅濤,姜長波,張福崇. 南方水產科學. 2014(05)
本文編號:3306234
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