卵形鯧鲹（Trachinotus ovatus）肉質鮮美,生長速度快,可攝食人工配合飼料,是我國熱帶、亞熱帶海域重要的網(wǎng)箱養(yǎng)殖魚類之一。然而近年來由于病害頻發(fā),給卵形鯧鲹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)造成了極大的經(jīng)濟損失。因此,研究卵形鯧鲹免疫基因與抗病性狀關聯(lián)性,確定免疫分子標記,建立免疫防控技術,對支撐卵形鯧鲹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展具有重要意義。本研究從實驗室前期測序獲得的卵形鯧鲹基因組和轉錄組數(shù)據(jù)庫中獲取了主要組織相容性復合體Ⅱβ（majorhistocompatibility complexⅡβ,MHCⅡβ）和γ-干擾素誘導的溶酶體巰基還原酶（interferon-γ-inducible lysosomal thiol reductase,GILT）的部分序列,利用RACE技術克隆獲得MHCⅡβ和GILT基因cDNA全序列,以此為基礎比對基因組數(shù)據(jù)庫,獲得了MHCⅡβ和GILT基因組全序列,分析了其組織表達和細菌感染前后表達譜特征,篩選了基因多態(tài)性位點,分析了基因多態(tài)性與抗菌性狀的相關性,取得的主要結果如下:一、卵形鯧鲹MHCⅡβ表達調控及其基因多態(tài)性與抗菌性狀的關聯(lián)分析結論:ToMHCⅡβcDNA全長... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】：90 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
前言
    1.1 卵形鯧鲹簡介
        1.1.1 卵形鯧鲹形態(tài)特征及生活習性簡介
        1.1.2 卵形鯧鲹研究進展
    1.2 魚類的免疫防御
        1.2.1 免疫器官和組織
        1.2.2 免疫細胞
        1.2.3 體液免疫因子
    1.3 主要組織相容性復合體(MHC)
        1.3.1 主要組織相容性復合體簡介
        1.3.2 MHC基因功能結構
    1.4 MHC基因的遺傳變異與魚類抗病性
        1.4.1 MHC基因的遺傳變異
    1.5 Γ-干擾素誘導的溶酶體巰基還原酶(GILT)
        1.5.1 溶酵體簡介
        1.5.2 Γ-干擾素簡介
        1.5.3 GILT的發(fā)現(xiàn)
        1.5.4 GILT在MHCⅡ類抗原加工中的作用
        1.5.5 GILT的活性特征
        1.5.6 GILT研究概況和發(fā)展趨勢
    1.6 研究目的、意義及技術路線
        1.6.1 研究目的與意義
        1.6.2 技術方案
第二章 卵形鯧鲹MHCⅡB基因的表達調控及其多態(tài)性與抗菌性狀的關聯(lián)分析
    2.1 實驗材料
        2.1.1 實驗菌種
        2.1.2 實驗用魚
        2.1.3 實驗儀器
        2.1.4 實驗試劑與配制
    2.2 實驗用品預處理
        2.2.1 實驗動物處理及取樣
        2.2.2 卵形鯧鲹總RNA提取
        2.2.3 卵形鯧鲹CDNA的合成
        2.2.4 TOMHCⅡB基因CDNA全長的克隆
        2.2.5 TOMHCⅡΒ 基因序列分析
        2.2.6 TOMHCⅡΒ 基因表達分析
    2.3 TOMHCⅡΒ 基因多態(tài)性
        2.3.1 卵形鯧鲹基因組DNA的提取
        2.3.2 基因克隆鏈接轉化
    2.4 結果與分析
        2.4.1 TOMHCⅡΒ 的CDNA序列特征
        2.4.2 TOMHCⅡΒ 基因系統(tǒng)進化分析
        2.4.3 MHCⅡΒ 基因組結構比較
        2.4.4 TOMHCⅡΒMRNA組織表達分析
        2.4.5 TOMHCⅡΒ MRNA的時空表達
        2.4.6 美人魚發(fā)光桿菌感染卵形鯧鲹
        2.4.7 DNA提取結果和測序分析
        2.4.8 TOMHCⅡΒ 基因的多態(tài)性分析
        2.4.9 TOMHCⅡΒ 基因與美人魚發(fā)光桿菌易感性/抗性的關聯(lián)性分析
    2.5 討論
第三章 卵形鯧鲹GILT基因的表達調控及其多態(tài)性與抗菌性狀的關聯(lián)分析
    3.1 實驗材料
        3.1.1 實驗菌種
        3.1.2 實驗用魚
        3.1.3 實驗儀器
        3.1.4 實驗試劑與配制
    3.2 實驗用品預處理
        3.2.1 實驗動物處理及取樣
        3.2.2 總RNA提取卵形鯧鲹RNA的提取
        3.2.3 卵形鯧鲹CDNA的合成
        3.2.4 TOGILT基因CDNA全長的克隆
        3.2.5 TOGILT基因序列分析
        3.2.6 TOGILT基因表達分析
    3.3 結果與分析
        3.3.1 TOGILT的DNA序列特征
        3.3.2 TOGILT基因系統(tǒng)進化分析
        3.3.3 TOGILT基因組結構比較
        3.3.4 TOGILT MRNA組織表達分析
        3.3.5 TOGILT MRNA的時空表達
        3.3.6 美人魚發(fā)光桿菌感染卵形鯧鲹
        3.3.7 DNA提取結果和測序分析
        3.3.8 TOGILT基因SNP位點分析
        3.3.9 TOGILT基因型與美人魚發(fā)光桿菌易感性/抗性的關聯(lián)性分析
    3.4 討論
小結
參考文獻
附錄
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]亞麻酸對卵形鯧鲹幼魚生長性能、消化酶活性及抗氧化能力的影響[J]. 戚常樂,林黑著,黃忠,周傳朋,楊育凱,虞為,趙書燕.  南方水產(chǎn)科學. 2016(06)
[2]不同糖源飼料對卵形鯧鲹（Trachinotus ovatus）生長、體組成、血糖水平和肝臟糖酵解酶活力的影響[J]. 董蘭芳,張琴,程光平,許明珠,童潼,熊向英.  漁業(yè)科學進展. 2016(05)
[3]石斑魚（Epinephelus coioides）MHC基因多態(tài)性及其與虹彩病毒抗性的關聯(lián)分析（英文）[J]. 楊敏,魏京廣,李鵬飛,魏世娜,黃友華,秦啟偉.  Science Bulletin. 2016(09)
[4]金錢魚MHC Ⅱ β基因結構、多態(tài)性與組織表達分析[J]. 王曉冰,劉至治,李強,張璐菲,張俊彬.  中國水產(chǎn)科學. 2016(01)
[5]大黃魚在感染刺激隱核蟲后MHC IIB基因的表達[J]. 陳健,張東玲,葉坤,王志勇.  安徽農(nóng)業(yè)科學. 2015(07)
[6]尼羅羅非魚MHC Ⅰα全長cDNA的克隆、多態(tài)性及組織表達特征[J]. 黎建平,高風英,盧邁新,曹建萌,朱華平,可小麗,劉志剛.  中國水產(chǎn)科學. 2014(06)
[7]卵形鯧鲹尾部骨骼胚后發(fā)育研究[J]. 鄭攀龍,馬振華,郭華陽,李有寧,張殿昌,江世貴.  南方水產(chǎn)科學. 2014(05)
[8]飼料中硒酵母添加水平對卵形鯧鲹生長、食物利用及魚體組成的影響[J]. 吳玉波,韓華,王巖.  飼料工業(yè). 2013(12)
[9]卵形鯧鲹的營養(yǎng)需求研究及其配合飼料研發(fā)[J]. 唐媛媛,張蕉南,艾春香,胡兵.  飼料工業(yè). 2013(08)
[10]卵形鯧鲹主要病害及其研究進展[J]. 夏立群,黃郁蔥,魯義善.  安徽農(nóng)學通報(上半月刊). 2012(23)

博士論文
[1]草魚MHC相關多肽與腫瘤壞死因子受體相關因子的克隆及其表達分析[D]. 徐在言.中國科學院研究生院（水生生物研究所） 2007
[2]重要海水養(yǎng)殖魚類MHCⅡ基因克隆、表達及多態(tài)性分析[D]. 張玉喜.中國海洋大學 2006

碩士論文
[1]卵形鯧鲹ToPrx1和ToTrx1基因的特征和功能研究[D]. 王龍.上海海洋大學 2015
[2]興國紅鯉和荷包紅鯉MHC Ⅱ類基因多態(tài)性、表達及其與魚體抗病力關系的分析[D]. 劉俊.上海海洋大學 2014
[3]草魚MHC II B和組織蛋白酶D基因的克隆、表達及多態(tài)性分析[D]. 董忠典.山東農(nóng)業(yè)大學 2013
[4]尼羅羅非魚MHCII類基因的克隆與表達特征及多態(tài)性研究[D]. 龐紀彩.上海海洋大學 2013
[5]羅非魚T淋巴細胞幾種標志基因的克隆及表達研究[D]. 劉冬.西南大學 2012
[6]建鯉MHC基因的克隆與序列分析[D]. 周凱.南京農(nóng)業(yè)大學 2010
[7]大菱鲆受哈維氏弧菌感染后的基因差異表達研究[D]. 王傳娟.中國海洋大學 2007



本文編號：3255284