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七鰓鰻RIG-I和MAVS的分子特征及其在抗病毒免疫中的信號(hào)通路

發(fā)布時(shí)間:2020-05-18 19:39
【摘要】:目前,水產(chǎn)動(dòng)物的病毒性疾病給養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,嚴(yán)重影響我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。先天性免疫是魚類免疫系統(tǒng)的重要組成部分,是防御病毒入侵的第一道屏障,因而先天性免疫在水產(chǎn)動(dòng)物的病毒防御中發(fā)揮著重要的作用,而至今為止并未有七鰓鰻感染病毒的報(bào)道,因此,深入研究七鰓鰻的抗病毒免疫防御機(jī)制對(duì)探索魚類病毒防治的方法具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。此外,七鰓鰻(Lampetra japonica)是最原始的脊椎動(dòng)物之一,因此研究其先天性免疫對(duì)了解免疫系統(tǒng)的起源具有十分重要的意義。在先天性免疫系統(tǒng)中視黃酸(維甲酸)誘導(dǎo)基因蛋白I(retinoic acid-inducible gene-I,RIG-I)是識(shí)別雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)病毒核酸的主要模式受體之一,近年來(lái),研究人員已經(jīng)從多種低等脊椎動(dòng)物中克隆并鑒定了RIG-I受體及相關(guān)基因,極大的推動(dòng)了低等脊椎動(dòng)物抗病毒免疫領(lǐng)域發(fā)展。本文對(duì)七鰓鰻的RIG-I樣受體,相關(guān)基因及其抗病毒免疫信號(hào)通路進(jìn)行了初步研究。首先,七鰓鰻不僅對(duì)dsRNA病毒模擬物poly(I:C)(polyinosinic-polycytidylic acid)刺激具有免疫應(yīng)答反應(yīng),激活RIG-I樣受體及其信號(hào)通路相關(guān)分子。通過(guò)高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)對(duì)poly(I:C)刺激后的七鰓鰻進(jìn)行了數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),數(shù)量最多的基因集中于蛋白翻譯修飾和降解,通過(guò)KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集發(fā)現(xiàn)基因多集中在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)(signal transduction)、運(yùn)輸和分解代謝(transport and catabolism)和免疫系統(tǒng)(immune system)的信號(hào)通路上,說(shuō)明七鰓鰻對(duì)于poly(I:C)的刺激產(chǎn)生了免疫應(yīng)答;通過(guò)進(jìn)一步數(shù)據(jù)分析從中篩選出poly(I:C)刺激相關(guān)信號(hào)通路的19個(gè)基因,主要覆蓋于RIG-I樣受體信號(hào)通路,其中白細(xì)胞介素8(interleutin-8,IL-8)和核因子抑制因子α(NF-kappa-B inhibitor alpha,NFKBIA)在不同組別的比較中表達(dá)量均上調(diào);綜合分析可得出,七鰓鰻不僅對(duì)dsRNA病毒刺激能夠產(chǎn)生免疫應(yīng)答,同時(shí)存在RIG-I樣受體及其信號(hào)通路的相關(guān)分子,為后期七鰓鰻RIG-I受體及其抗病毒信號(hào)通路的研究奠定了基礎(chǔ)。其次,七鰓鰻在受poly(I:C)和草魚呼腸弧dsRNA病毒(Grass Carp Reovirus,GCRV)刺激能激活RIG-I/MAVS和TLR3/TRIF,啟動(dòng)核調(diào)控抗病毒免疫信號(hào)通路,從而產(chǎn)生IL-8和Mx效應(yīng)分子以抑制病毒增殖。通過(guò)GCRV感染過(guò)表達(dá)RIG-I或線粒體抗病毒信號(hào)蛋白(Mitochondrial Antiviral Signaling Protein,MAVS)的草魚卵巢細(xì)胞系(grass carp ovary cell line,CO),MTT法檢測(cè)證明七鰓鰻的RIG-I和MAVS的過(guò)表達(dá)能夠抵抗GCRV的感染;而且通過(guò)雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)檢測(cè),表明七鰓鰻的RIG-I或MAVS的過(guò)表達(dá)均能夠使HEK293細(xì)胞中NF-κB和干擾素激活反應(yīng)元件(interferon-sensitive responsive element,ISRE)表達(dá)上調(diào),從而激活干擾素(interferon,IFN)抗病毒信號(hào)通路;通過(guò)poly(I:C)體外刺激(轉(zhuǎn)染)七鰓鰻細(xì)胞和體內(nèi)GCRV腹腔注射免疫,并用QPCR方法檢測(cè)分析發(fā)現(xiàn),無(wú)論是體外刺激還是體內(nèi)刺激均激活七鰓鰻RIG-I/MAVS以及TLR3/TRIF依賴的核調(diào)控的抗病毒信號(hào)通路。同時(shí),七鰓鰻抗病毒免疫信號(hào)通路的激活同時(shí)也能誘導(dǎo)細(xì)胞發(fā)生線粒體依賴的細(xì)胞凋亡,從而發(fā)揮抗病毒作用。通過(guò)在細(xì)胞中過(guò)表達(dá)七鰓鰻MAVS蛋白,激光共聚焦觀察發(fā)現(xiàn)七鰓鰻MAVS定位于線粒體,同時(shí)高內(nèi)涵檢測(cè)發(fā)現(xiàn)伴隨活性氧(reactive oxygen species,ROS)的產(chǎn)生;同時(shí)通過(guò)QPCR檢測(cè),與對(duì)照組相比,Bax表達(dá)量顯著升高,Bcl-2表達(dá)量顯著下降,且與免疫印跡檢測(cè)結(jié)果一致,同時(shí)還發(fā)現(xiàn)伴隨有細(xì)胞色素C(Cytochrome C,Cyt C)的釋放,結(jié)果表明,七鰓鰻MAVS的過(guò)表達(dá)能激活細(xì)胞內(nèi)線粒體依賴的細(xì)胞凋亡,從而達(dá)到抑制病毒增殖的目的。本文研究結(jié)果初步闡明了七鰓鰻在受到體內(nèi)和體外刺激后不僅能激活RIG-I/MAVS和TLR3/TRIF啟動(dòng)核調(diào)控的抗病毒免疫信號(hào)通路,抑制病毒增殖,同時(shí)還可以激活細(xì)胞內(nèi)線粒體依賴的細(xì)胞凋亡信號(hào)通路,從而發(fā)揮抗病毒作用;本研究有利于人們對(duì)脊椎動(dòng)物抗病毒免疫進(jìn)化的認(rèn)識(shí),為后期無(wú)頜類脊椎動(dòng)物在該方面的研究提供了數(shù)據(jù)支持。
【圖文】:

結(jié)構(gòu)示意圖,結(jié)構(gòu)域,抗病毒免疫,螺旋酶


七鰓鰻RIG-I 和MAVS 的分子特征及其在抗病毒免疫中的信號(hào)通路 RLRs 含有與哺乳動(dòng)物 RLRS相似的結(jié)構(gòu)域。所有 RLRs 分旋酶結(jié)構(gòu)域(DEXDc)、螺旋酶結(jié)構(gòu)域(HELICc)、調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)、RIG-I 和 MDA5 的 N 端區(qū)域有 2 個(gè) caspase 激活和募集omain, CARD),但 LGP2 中沒(méi)有(圖 1),其中 CARD 在信號(hào)轉(zhuǎn)AVS 通過(guò) N 端 CARD 結(jié)構(gòu)域與 RIG-I 相互作用,從而傳遞。

流程圖,高通量,第二代,測(cè)序


七鰓鰻RIG-I 和MAVS 的分子特征及其在抗病毒免疫中的信號(hào)通路(β-defensin)、hepcidin、NK-lysin、piscidin 和肝表達(dá)抗菌肽-2 (liver-obial peptide-2, LEAP-2)。表 1 第二代測(cè)序技術(shù)的特點(diǎn)及檢測(cè)方法b. 1 Characteristics and detection methods of the second generation sequencing techno序技術(shù) 測(cè)序長(zhǎng)度 具體步驟 特點(diǎn)術(shù) 300-800 個(gè)bp1、構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)。片段兩端錨定接頭;2、乳液PCR擴(kuò)增,固定于磁珠后PCR;3、焦磷酸測(cè)序。讀長(zhǎng)長(zhǎng),但是準(zhǔn)確高。技術(shù) 100~200bp1、構(gòu)建測(cè)序文庫(kù)。兩端加接頭;2、橋式擴(kuò)增,解鏈后固定于芯片進(jìn)行PCR:3、測(cè)序。性價(jià)比最高、應(yīng)用技術(shù) 幾十個(gè)bp1、文庫(kù)制備;2、乳液 PCR/磁珠富集。3、微珠沉積4、連接測(cè)序。最高的通量,測(cè)序正。
【學(xué)位授予單位】:遼寧師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S941.41

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本文編號(hào):2670218

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