多倍體是指包含超過(guò)兩套染色體組的細(xì)胞、組織或生物。多倍體在植物中很常見(jiàn),據(jù)估計(jì),目前的植物種類中有30-80%是多倍體,有證據(jù)顯示,許多二倍體植物的基因組曾經(jīng)歷過(guò)一次或多次古多倍體的過(guò)程,被子植物多樣性的大爆炸與許多植物同時(shí)發(fā)生的古基因組復(fù)制事件的時(shí)間正好吻合。此外,約有15%的被子植物和31%的蕨類植物物種形成事件伴隨著倍性增加的過(guò)程。多倍體植物可以通過(guò)幾種機(jī)制自發(fā)產(chǎn)生,包括減數(shù)分裂和有絲分裂失敗,未減數(shù)配子融合等。由于多倍體植物具有組織器官增大、生物學(xué)產(chǎn)量增加、抗逆性增強(qiáng)等特點(diǎn),因而廣泛應(yīng)用于作物育種領(lǐng)域。本研究所用材料SARII-628是一個(gè)能夠自然發(fā)生多胚苗的穩(wěn)定水稻品系,多胚苗包含單倍體、二倍體、三倍體和四倍體,以其中的單倍體、二倍體和三倍體為材料,通過(guò)分離其分蘗和合理的栽培管理形成三個(gè)倍性株系。用體細(xì)胞染色體計(jì)數(shù)確定倍性,并利用均勻分布于基因組上的6000個(gè)SNP標(biāo)記檢測(cè)發(fā)現(xiàn),三個(gè)倍性材料遺傳背景高度一致。進(jìn)一步評(píng)估它們的多種農(nóng)藝性狀,結(jié)果表明三個(gè)倍性水稻在株高、穎花大小、劍葉長(zhǎng)寬等性狀方面有較大差異,這意味著基因組加倍引起了巨大的表型變化,由此我們希望了解表觀基因組的變化對(duì)...

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖1.從深度測(cè)序文庫(kù)正確鑒定和注釋miRNA的大綱和步驟Fig.1AnoutlineofthecorrectprotocolforidentifyingandannotatingmiRNAsformdeepsequencinglibraries

15圖1.從深度測(cè)序文庫(kù)正確鑒定和注釋miRNA的大綱和步驟Fig.1AnoutlineofthecorrectprotocolforidentifyingandannotatingmiRNAsformdeepsequencinglibrar....

圖2PHB載體物理圖譜

GGTGGTGGGTAGTCTCTCTCTTATGGTGAACCCGTGATCATGTTACAGATATGTTGGTGGTTGTTGCTTGCAGGCTGCTATGGAATGGTGGAAGAAGGGGATCGACGCCAATTGTTTGGCGACCTCTACGATAGAATCGT....

圖41N和2N,2N和3N基因組SNP6K芯片檢測(cè)

個(gè)單堿基位點(diǎn)有多態(tài)度性。1N與2N僅在第11染色體的29753255bp和1151760bp四個(gè)位點(diǎn)具有單核苷酸多態(tài)度性，屬于純第11染色體291791bp位于基因LOC_Os11g01490上的CDS區(qū)表達(dá)蛋白，功能是外膜蛋....

圖5單倍體、二倍體和三倍體水稻MeDIP-seqreads在染色體上的分布

3.2倍性水稻全基因組甲基化方式具有高度相似性3.2.1單倍體、二倍體和三倍體水稻甲基化圖譜高度相似為了回答當(dāng)基因組復(fù)制發(fā)生后，甲基化方式是否會(huì)受影響的問(wèn)題，我們利MeDIP-seq分析了單倍體、二倍體和三倍體水稻全基因組甲基化譜。三個(gè)樣本MeDseq總計(jì)產(chǎn)生48.9....

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