DNA甲基化作為表觀遺傳的主要修飾方式之一,參與細胞的許多生物學過程,在植物生長發(fā)育、基因組印記和對逆境脅迫的應答等方面發(fā)揮重要作用。本試驗利用玉米甲基化免疫共沉淀(MeDIP-seq)技術對玉米雜交種鄭單958吸脹0h和24h果穗上部、中部種子全基因組DNA甲基化進行了研究,利用McrBC-PCR對部分差異甲基化基因進行驗證,將MeDIP-seq數(shù)據和RNA-seq數(shù)據結合,對部分差異甲基化基因的表達水平進行檢測,從DNA甲基化角度研究影響玉米果穗不同部位種子萌發(fā)的調控機理。主要研究結果如下:1.通過MeDIP-seq技術對玉米果穗不同吸脹時間、不同部位種子的全基因組DNA甲基化進行分析,吸脹0h種子的差異甲基化基因數(shù)量遠多于吸脹24h種子;吸脹0h中部與上部種子相比,甲基化上調基因的數(shù)量多于下調基因的數(shù)量,而吸脹24h中部與上部的種子比較,甲基化下調基因的數(shù)量多于上調基因的數(shù)量。2.MeDIP-seq結果分析發(fā)現(xiàn)啟動子區(qū)的甲基化修飾要多于基因區(qū),基因區(qū)內含子的甲基化修飾多于外顯子。通過對吸脹0h和24h中部和上部種子的差異甲基化基因進行分析,在吸脹0h種子中共檢測到7264個差異甲基...

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色體上的分布

圖2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色體上的分布Fig.2DistributionofmethylationPeaksindifferentchromosomesinmaize圖3Peaks在基因不同區(qū)域上的分布統(tǒng)計Figure3Distr....

圖4Peaks差異甲基化統(tǒng)計分析結果

圖2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色體上的分布Fig.2DistributionofmethylationPeaksindifferentchromosomesinmaize圖3Peaks在基因不同區(qū)域上的分布統(tǒng)計Figure3Distr....

圖7吸脹0h、24h種子差異基因的DNA甲基化水平驗證D表示DNA經過McrBC酶切N表示DNA未經過McrBC酶切

圖7吸脹0h、24h種子差異基因的DNA甲基化水平驗證D表示DNA經過McrBC酶切N表示DNA未經過McrBC酶切Figure7Estimationofthemethylationleveloftheseedgerminat....

本文編號：4019688