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甘蔗屬割手密種NBS-LRR家族基因的演化與表達(dá)分析

發(fā)布時間:2024-05-20 01:30
  甘蔗是全世界最重要的糖料和能源作物。在自然栽培條件下,病蟲害是影響甘蔗產(chǎn)量的重要因素。目前世界上已知的甘蔗病害已達(dá)160多種,我國發(fā)現(xiàn)的有60多種。其中大陸蔗區(qū)發(fā)生的大約50種,常見的甘蔗病害有宿根矮化病、鳳梨病、線蟲病等。一般為了控制植物疾病的發(fā)生和提高作物產(chǎn)量,人們會直接采用噴灑農(nóng)藥的方式,但農(nóng)藥的使用不僅會使病原體的耐藥性增強(qiáng),而且藥物的累積,會造成土壤、水源以及空氣污染,最終會對人體健康造成威脅。植物本身就有一系列抵御外界病原體侵害的系統(tǒng),植物疾病抵抗基因可以編碼抵抗蛋白用來阻止外源病原體入侵。這類基因中最為重要的便是NBS-LRR基因,F(xiàn)代甘蔗栽培種是由熱帶種和割手密種雜交而來,這些雜交栽培種的高糖特性來自于熱帶種,而抗病蟲害等抗逆性的遺傳屬性來自于割手密。因此本研究選擇抗逆性和抗病性較強(qiáng)的甘蔗割手密種為研究材料,綜合應(yīng)用生物信息學(xué)手段對甘蔗割手密種全基因組的NBS-LRR基因家族進(jìn)行分類與演化分析,并與單雙子葉代表性的植物,擬南芥、菠蘿、無油樟、水稻、玉米和高粱進(jìn)行聚類分析與結(jié)構(gòu)比較。研究的結(jié)果將為甘蔗抗病基因的分子機(jī)制和分子育種提供重要的理論參考。本研究獲得的主要結(jié)果如下...

【文章頁數(shù)】:105 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖3兩種主要的植物R蛋白結(jié)構(gòu)示意圖[44]??

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福建師范大學(xué)陳陽碩士學(xué)位論文??結(jié)合位點(diǎn)-D?(RNBS-D)和[32,33]。在ARC1亞結(jié)構(gòu)域中的兩個主要基序是,GLPL??GxP和VII,二者都參與核苷酸結(jié)合[26,35,36]。分布在ARC2亞結(jié)構(gòu)域的基序?yàn)榛??VIII、RNBS-D、基序X和MHD[24-26]。M....


圖1.1無油樟IVBS基因系統(tǒng)演化關(guān)系(CNL",CN",TNL},TNT,NL",N)

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福建師范大學(xué)陳陽碩士學(xué)位論文???根據(jù)NBS結(jié)構(gòu)域的同源性,可以通過序列比對和繪制系統(tǒng)發(fā)生樹,來研究其演化過??程。通過對無油樟全基因組序列鑒定的結(jié)果,共得到了具有NBS結(jié)構(gòu)域的抗病基??因51個,對分析得出的51個無油樟NBS類型抗病基因蛋白質(zhì)序列中的TNL??(TIR-NBS....


圖1.2甘蔗割手密種NBS類型蛋白質(zhì)系統(tǒng)發(fā)生樹(CNL",CNo,NL和N")

圖1.2甘蔗割手密種NBS類型蛋白質(zhì)系統(tǒng)發(fā)生樹(CNL",CNo,NL和N")

CN?I^NL#和cted?proteins?f


圖I.3甘蔗割手密種全基因組NBS-LRR類型蛋白質(zhì)系統(tǒng)發(fā)生樹(CNL▲和NL1)

圖I.3甘蔗割手密種全基因組NBS-LRR類型蛋白質(zhì)系統(tǒng)發(fā)生樹(CNL▲和NL1)

第一章甘蔗NBS-LRR家族基因的鑒定與演化分析??=??



本文編號:3978751

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