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陸海漸滲系纖維長度QTL(qFL-12-2)精細定位與候選基因鑒定

發(fā)布時間:2024-03-12 00:26
  棉花是重要的經濟作物,棉纖維是最大的天然纖維來源,重要的紡織工業(yè)原料,F代紡織工業(yè)的迅猛發(fā)展,對纖維品質的要求越來越高,使棉花育種的重點由單純提高產量向產量與品質同步提高發(fā)展。棉纖維長度是衡量纖維品質的重要指標,提高棉纖維長度已成為棉花育種的重要目標。在綜合評價課題組前期構建的以海1為供體親本,中棉所45為輪回親本構建的332個陸海漸滲系群體基礎上,選取纖維品質性狀突出、產量性狀與輪回親本接近的漸滲系MBI7747與中棉所45進一步構建F2群體,然后隨機分別挑選一定數量的單株種植于兩個環(huán)境。以覆蓋棉花全基因組的2292個SSR標記在親本間進行多態(tài)性篩查,然后以其中的多態(tài)性標記對F2群體進行遺傳檢測;結合表型檢測結果,利用Icimapping軟件挖掘MBI7747中的與纖維主要產量和品質性狀相關的QTL位點,在三個環(huán)境中共挖掘到與纖維產量與品質相關QTL共23個:1、與纖維產量相關的QTL有5個,包括衣分相關的4個,貢獻率為6.95-28.86%;鈴重有關的1個,貢獻率為14.65%。2、與纖維品質相關的QTL共18個,包括纖維長度相關的6個,貢獻率為2.05%-20.99%;纖維整齊度...

【文章頁數】:123 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

圖2-1棉花染色體片段代換系的培育方案??Fig.2.1?The?cultivating?program?of?the?CSSLs??2.1.4基因組DNA提取??

圖2-1棉花染色體片段代換系的培育方案??Fig.2.1?The?cultivating?program?of?the?CSSLs??2.1.4基因組DNA提取??

實驗的親本材料為優(yōu)質漸滲系MBI7747和中棉所45?(表2-1)。MBI7747??是以陸地棉中棉所45為受體和海島棉海1為供體構建的由332個染色體片??段漸滲系組成的群體(BC4F3:5)中選取的一個纖維品質優(yōu)異漸滲系(圖2.1)。??中棉所45抗蟲性強,產量高,纖維品質性....


圖4-1生物信息分析流程圖??Fig?4-1?The?flow?chart?of?bioinformatics?analysis??4.1.4.2差異表達基因分析??[184]

圖4-1生物信息分析流程圖??Fig?4-1?The?flow?chart?of?bioinformatics?analysis??4.1.4.2差異表達基因分析??[184]

4.1.4生物信息學分析??研宄用的實驗材料主要為陸地棉及陸地棉背景下的海陸漸滲系材料,故本研??宄后續(xù)分析以陸地棉基因組為參考基因組[157]。整個分析思路及流程見圖4-1。??4.1.4.1數據過濾與處理??利用Hiseq2000?v4測序平臺完成樣品的轉錄組測序,測序模式為....


圖4,3不同祥本間主成分分析

圖4,3不同祥本間主成分分析

Fig?4-3?The?principal?component?analysis?among?different?samples??結果顯示,在取樣的的6個時間點(7DPA、10DPA、15DPA、20DPA、25DPA),??2優(yōu)質漸滲系MBI7747與MBI7561更多的聚合....


圖4-5纖維伸長期4個階段差異基因交集

圖4-5纖維伸長期4個階段差異基因交集

XLOC_025348與XLOC_026944,全為?LncRNA,這?2?個?LncRN還需要進一步的研宄。另外,還可以看出,在纖維伸長期的各階特有的差異基因的數量明顯高于與其它階段共有的差異基因,這纖維伸長的調控是個動態(tài)變化的過程。??1QDPA?15DPA??^^""""^....



本文編號:3926254

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