春玉米自交系籽粒品質相關性狀的全基因組關聯(lián)分析
發(fā)布時間:2024-03-08 17:55
當今玉米育種的主要目標是為了達到高產、穩(wěn)產、優(yōu)質,而籽粒是品質和產量的最終的體現(xiàn)方式。為了達到優(yōu)質的育種目標就必須對玉米籽粒的品質性狀進行研究,利用分子標記對調控玉米籽粒品質的關鍵基因進行定位,并從分子水平上闡明其遺傳機理,有助于提高玉米品質育種的效率。本試驗采用80份吉林省玉米核心自交系作為研究材料,于2014和2015年在吉林農業(yè)大學試驗地進行田間試驗,采用隨機區(qū)組試驗設計,試驗田管理與大田相同。每年將自交收獲的試驗材料晾曬脫粒后用瑞士BUCHI公司生產的NIRFlex N-500傅里葉變換近紅外光譜儀測定其籽粒蛋白質含量、脂肪含量和淀粉含量。同時采用第二代測序技術對80份玉米自交系材料進行全基因組重測序,共獲得1,490,007個高質量SNP用于后續(xù)的關聯(lián)分析。主要研究結果如下:1、進行描述性統(tǒng)計分析發(fā)現(xiàn)籽粒的蛋白質、脂肪和淀粉含量的變異范圍均較大,具有較大的表型差異,說明不同自交系間這3種性狀的差異較大,離散程度較高。方差分析結果顯示3個性狀在兩年間的F值均達到極顯著程度。Pearson相關分析表明,蛋白質和脂肪在2014年和2015年分別達到極顯著水平,淀粉的表型數(shù)據(jù)達到顯著...
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3922173
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圖3.2系統(tǒng)進化樹
其中還包含少量熱帶玉米血緣自交系、亞群3為Lancaster和歐洲種質(圖3.1圖3.2)。圖3.1基因型數(shù)據(jù)的主成分分析Figure3.1Principalcomponentanalysisofthegenotypedate圖3.2系統(tǒng)進化....
圖3.1基因型數(shù)據(jù)的主成分分析
第三章結果與分析群體結構分析用重測序中所得到的SNP標記數(shù)據(jù),應用MEGA6.0軟件和EIGENSOFT軟米自交系材料進行遺傳結構分析,作圖分析結果顯示,80份玉米核心自交系分為三個亞群五大主成分,分別為亞群1為Reid種質、亞群2為塘四平頭其中還包含....
圖3.32014年蛋白質含量曼哈頓圖
圖3.32014年蛋白質含量曼哈頓圖Figure3.32014Proteincontentmanhattanplot圖3.42015年蛋白質含量曼哈頓圖Figure3.42015Proteincontentmanhattanplot注:曼哈頓圖....
圖3.52014年蛋白質含量QQ圖
Figure3.32014Proteincontentmanhattanplot圖3.42015年蛋白質含量曼哈頓圖Figure3.42015Proteincontentmanhattanplot注:曼哈頓圖中黑色虛線表示顯著性水平閾值(P<0.00....
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