玉米穗型和粒型性狀的GWAS及其關(guān)聯(lián)位點(diǎn)馴化和改良分析
發(fā)布時(shí)間:2022-05-02 22:03
以32份大芻草、68份玉米地方品種和來(lái)源廣泛的294份玉米自交系為材料,在對(duì)294份玉米自交系進(jìn)行簡(jiǎn)化基因組測(cè)序的基礎(chǔ)上,采用GWAS方法對(duì)11個(gè)玉米穗型和粒型性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果表明,11個(gè)性狀共檢測(cè)到44個(gè)關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn),其中,28個(gè)位點(diǎn)與6個(gè)穗型性狀相關(guān)聯(lián),16個(gè)位點(diǎn)與3個(gè)粒型性狀相關(guān)聯(lián)。進(jìn)一步整合32份大芻草和68份地方品種相應(yīng)位點(diǎn)的序列數(shù)據(jù),44個(gè)關(guān)聯(lián)位點(diǎn)中共發(fā)現(xiàn)29個(gè)SNP在3類群體間共有。通過(guò)Fisher的精確檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn),7個(gè)SNP的等位基因頻率在大芻草到地方品種中發(fā)生了顯著變化,14個(gè)SNP的等位基因頻率在地方品種到自交系中發(fā)生了顯著變化,3個(gè)SNP的等位基因頻率則在大芻草到地方品種以及地方品種到自交系中均發(fā)生了顯著變化,表明這些位點(diǎn)可能經(jīng)歷了馴化或/和人工改良。
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
1.3 描述性統(tǒng)計(jì)分析
1.4 全基因組關(guān)聯(lián)分析
1.5 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的馴化和改良信號(hào)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 玉米穗型和粒型性狀的描述性統(tǒng)計(jì)分析
2.2 玉米穗型和粒型性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.3 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的馴化和改良信號(hào)分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米農(nóng)藝性狀、穗部性狀與產(chǎn)量關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 谷月. 上海蔬菜. 2019(02)
[2]玉米產(chǎn)量相關(guān)性狀定位和Meta-QTL整合[J]. 馬娟,王浩,王利鋒,曹言勇,李晶晶,Thomas Lubberstedt,王麗艷,李會(huì)勇. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(01)
[3]玉米行粒數(shù)的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 吳律,代力強(qiáng),董青松,施婷婷,王丕武. 作物學(xué)報(bào). 2017(10)
[4]作物馴化和品種改良所選擇的關(guān)鍵基因及其特點(diǎn)[J]. 張學(xué)勇,馬琳,鄭軍. 作物學(xué)報(bào). 2017(02)
[5]玉米穗行數(shù)全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 張煥欣,翁建峰,張曉聰,劉昌林,雍洪軍,郝轉(zhuǎn)芳,李新海. 作物學(xué)報(bào). 2014(01)
[6]我國(guó)玉米育種科技創(chuàng)新問(wèn)題的幾點(diǎn)思考[J]. 戴景瑞,鄂立柱. 玉米科學(xué). 2010(01)
碩士論文
[1]玉米株型和穗部相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 劉坤.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號(hào):3650042
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
1.3 描述性統(tǒng)計(jì)分析
1.4 全基因組關(guān)聯(lián)分析
1.5 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的馴化和改良信號(hào)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 玉米穗型和粒型性狀的描述性統(tǒng)計(jì)分析
2.2 玉米穗型和粒型性狀的全基因組關(guān)聯(lián)分析
2.3 關(guān)聯(lián)位點(diǎn)的馴化和改良信號(hào)分析
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米農(nóng)藝性狀、穗部性狀與產(chǎn)量關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 谷月. 上海蔬菜. 2019(02)
[2]玉米產(chǎn)量相關(guān)性狀定位和Meta-QTL整合[J]. 馬娟,王浩,王利鋒,曹言勇,李晶晶,Thomas Lubberstedt,王麗艷,李會(huì)勇. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2019(01)
[3]玉米行粒數(shù)的全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 吳律,代力強(qiáng),董青松,施婷婷,王丕武. 作物學(xué)報(bào). 2017(10)
[4]作物馴化和品種改良所選擇的關(guān)鍵基因及其特點(diǎn)[J]. 張學(xué)勇,馬琳,鄭軍. 作物學(xué)報(bào). 2017(02)
[5]玉米穗行數(shù)全基因組關(guān)聯(lián)分析[J]. 張煥欣,翁建峰,張曉聰,劉昌林,雍洪軍,郝轉(zhuǎn)芳,李新海. 作物學(xué)報(bào). 2014(01)
[6]我國(guó)玉米育種科技創(chuàng)新問(wèn)題的幾點(diǎn)思考[J]. 戴景瑞,鄂立柱. 玉米科學(xué). 2010(01)
碩士論文
[1]玉米株型和穗部相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 劉坤.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
本文編號(hào):3650042
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