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超級稻春優(yōu)84重組自交系遺傳圖譜構建及其籽粒和葉片性狀QTL定位

發(fā)布時間:2021-12-30 20:29
  水稻(Oryza sativa L.)是世界主要糧食作物之一,世界上一半以上的人口以此為主食。開展水稻農(nóng)藝性狀QTL(Quantitative trait loci)研究,對克隆調(diào)控水稻農(nóng)藝性狀關鍵基因、揭示產(chǎn)量構成、探索株型、粒型與稻米產(chǎn)量相關性具有重要的理論意義和應用價值。本研究利用超級雜交稻春優(yōu)84的兩個植株及籽粒形態(tài)差異較大的親本,晚粳保持系春江16B(CJ16B)和中秈恢復系C84進行雜交,利用單粒傳法連續(xù)自交7代構建了188個株系組成的重組自交系群體(Recombinant inbred lines,RILs),利用158對在雙親中存在多態(tài)性差異的分子標記,構建了一套水稻遺傳連鎖圖譜。對植株葉片形態(tài)和籽粒形態(tài)性狀進行相關性分析及兩地的表型值考察,用于水稻主要株型及粒型農(nóng)藝性狀的初定位分析。主要研究結果如下:1.利用CJ16B和C84為親本構建的含188個單株的RILs,選擇在染色體上分布均勻且多態(tài)性好的分子標記158個,構建了一張水稻分子連鎖遺傳圖譜。該圖譜總遺傳距離為1428.40 cM,標記間距平均為9.04 cM,圖距介于0.2 cM-43.3 cM之間;各標記位置及... 

【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學院北京市

【文章頁數(shù)】:81 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
abstract
英文縮略表
第一章 引言
    1.1 水稻遺傳圖譜構建
        1.1.1 DNA分子標記分類與選擇
        1.1.2 常用QTL作圖群體類型選擇及群體大小
        1.1.3 作圖群體的構建
        1.1.4 水稻分子遺傳圖譜研究進展
    1.2 QTL定位
        1.2.1 QTL定位原理及方法
        1.2.2 水稻QTL定位
        1.2.3 QTL精細定位與克隆
    1.3 水稻重要株型性狀遺傳研究
    1.4 水稻粒型性狀遺傳研究
    1.5 研究的目的及意義
第二章 水稻分子遺傳連鎖圖譜構建
    2.1 實驗材料
        2.1.1 RIL遺傳群體構建
        2.1.2 實驗涉及試劑與相關儀器設備
        2.1.3 實驗材料田間種植與管理
    2.2 試驗方法
        2.2.1 水稻葉片DNA提取
        2.2.2 PCR擴增反應及凝膠電泳檢測
        2.2.3 SDS-PAGE(聚丙烯酰胺凝膠)電泳檢測
        2.2.4 多態(tài)性篩選及基因分型
        2.2.5 遺傳圖譜構建與分析
        2.2.6 遺傳連鎖圖譜作圖
    2.3 結果及分析
        2.3.1 2016 年杭州、海南兩地雙親及RIL群體重要株型性狀分析
        2.3.2 2016 年杭州、海南兩地雙親及RIL群體粒型相關性狀比較
        2.3.3 雙親多態(tài)性分析
        2.3.4 基因型數(shù)據(jù)分析
        2.3.5 RIL分子遺傳連鎖圖譜構建
    2.4 結論與討論
        2.4.1 結論
        2.4.2 討論
第三章 水稻粒型性狀QTL定位
    3.1 實驗材料
        3.1.1 供試材料
        3.1.2 實驗涉及試劑與相關儀器設備
        3.1.3 材料種植及處理
    3.2 實驗方法
        3.2.1 農(nóng)藝性狀調(diào)查
        3.2.2 QTL定位方法
        3.2.3 差異位點dCAPs分子標記引物設計
    3.3 結果與分析
        3.3.1 2016 年杭州、海南兩地RIL群體粒型性狀分布
        3.3.2 2016 年杭州、海南兩地RIL群體粒型性狀相關性分析
        3.3.3 粒型相關性狀QTL檢測
        3.3.4 雙親已克隆粒型主效QTL等位基因序列差異分析及分子標記驗證
    3.4 結論與討論
        3.4.1 結論
        3.4.2 討論
第四章 水稻株型和葉片形態(tài)QTL定位及葉長調(diào)控基因qLL9的精細定位
    4.1 實驗材料
        4.1.1 供試材料
        4.1.2 實驗涉及試劑與相關儀器設備
        4.1.3 材料種植及處理
    4.2 實驗方法
        4.2.1 農(nóng)藝性狀調(diào)查
        4.2.2 Indel標記引物設計
        4.2.3 RNA的提取
        4.2.4 水稻葉片RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA
        4.2.5 實時定量PCR(RT-PCR)檢測候選基因的表達量
    4.3 結果與分析
        4.3.1 2016年杭州、海南兩地RIL群體株型性狀分布
        4.3.2 2016年杭州、海南兩地RIL群體株型性狀相關性分析
        4.3.3 株型相關性狀的QTL檢測
        4.3.4 葉長主效QTLqLL9的精細定位
        4.3.5 候選基因的預測
    4.4 結論與討論
第五章 全文結論
    5.1 水稻分子遺傳連鎖圖譜構建
    5.2 水稻粒型性狀QTL定位
    5.3 水稻株型和葉片形態(tài)QTL定位
    5.4 葉長主效QTLqLL9的精細定位
參考文獻
附錄
致謝
作者簡歷


【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于重組自交系群體的水稻粒形QTL定位[J]. 方先文,張云輝,肖西林,張所兵,林靜,汪迎節(jié).  江蘇農(nóng)業(yè)學報. 2017(02)
[2]水稻遺傳圖譜構建及粒形相關性狀的QTL定位[J]. 李孝瓊,韋宇,高國慶,鄧國富,郭嗣斌.  南方農(nóng)業(yè)學報. 2014(07)
[3]利用染色體單片段代換系定位水稻株高QTL[J]. 朱金燕,嵇朝球,周勇,王軍,王中德,楊杰,范方軍,梁國華,仲維功.  植物學報. 2011(06)
[4]培矮64S/93-11重組自交系分子圖譜構建及千粒重QTL檢測[J]. 徐小颯,劉喜,趙志剛,周裕軍,吳盛陽,周蓉,張俊杰,江玲,萬建民.  南京農(nóng)業(yè)大學學報. 2011(01)
[5]水稻QTL定位研究進展[J]. 田翠,張濤,蔣開鋒,楊莉,鄭家奎.  基因組學與應用生物學. 2009(03)
[6]水稻株高的遺傳與育種研究進展[J]. 馬玉銀,王如平,李磊,左示敏,殷躍軍,陳宗祥.  河南農(nóng)業(yè)科學. 2008(11)
[7]超級雜交稻協(xié)優(yōu)9308重組自交系的分子遺傳圖譜構建[J]. 沈希宏,陳深廣,曹立勇,占小登,陳代波,吳偉明,程式華.  分子植物育種. 2008(05)
[8]DNA分子標記的研究進展及幾種新型分子標記技術[J]. 關強,張月學,徐香玲,孫德全,李綏艷,林紅,潘麗艷,馬延華.  黑龍江農(nóng)業(yè)科學. 2008(01)
[9]水稻顯性小粒基因Mi3(t)的遺傳定位[J]. 劉明偉,劉勇,王世全,鄧其明,李平.  中國水稻科學. 2005(06)
[10]用(培矮64s/Nipponbare)F2群體對水稻產(chǎn)量構成性狀的QTL定位分析[J]. 葉少平,張啟軍,李杰勤,趙兵,李平.  作物學報. 2005(12)

博士論文
[1]高密度小麥遺傳連鎖圖譜構建及產(chǎn)量相關性狀QTL定位[D]. 崔法.山東農(nóng)業(yè)大學 2011
[2]分子標記遺傳圖譜構建和稻米品質(zhì)性狀的遺傳分析[D]. 王令強.華中農(nóng)業(yè)大學 2007



本文編號:3558917

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