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‘培矮64S’與其eui突變體‘長(zhǎng)選3S’穗頸節(jié)間蛋白質(zhì)組差異分析

發(fā)布時(shí)間:2021-11-16 12:40
  為從蛋白質(zhì)表達(dá)水平了解長(zhǎng)穗頸溫敏核不育水稻穗頸節(jié)間伸長(zhǎng)機(jī)理,該研究以長(zhǎng)穗頸(EUI)溫敏核不育水稻‘長(zhǎng)選3S’為材料,溫敏核不育水稻‘培矮64S’為對(duì)照,采用固相pH梯度雙向凝膠電泳和質(zhì)譜分析方法,對(duì)2個(gè)水稻材料抽穗前2 d的穗頸節(jié)間蛋白質(zhì)進(jìn)行分離,并進(jìn)行差異蛋白質(zhì)組學(xué)的比較研究。結(jié)果表明:(1)獲得了分辨率和重復(fù)性較好的雙向凝膠電泳圖譜。(2)對(duì)40個(gè)差異蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行MALDI-TOF-TOF-MS肽質(zhì)譜指紋圖譜分析,成功鑒定其中27個(gè)差異蛋白質(zhì)點(diǎn);與‘培矮64S’相比,‘長(zhǎng)選3S’中有17個(gè)上調(diào)表達(dá)和10個(gè)下調(diào)表達(dá)的蛋白質(zhì)。(3)差異蛋白質(zhì)按照其功能可分為6類(lèi),其中主要是與細(xì)胞代謝相關(guān)蛋白,其次是與細(xì)胞壁重建相關(guān)蛋白;并且這些差異蛋白質(zhì)可能與‘長(zhǎng)選3S’抽穗期穗頸節(jié)間劇烈伸長(zhǎng)生長(zhǎng)有關(guān),尤其是細(xì)胞壁重建相關(guān)蛋白與細(xì)胞的伸長(zhǎng)密切相關(guān)。(4)實(shí)時(shí)熒光定量PCR對(duì)隨機(jī)挑選的蛋白點(diǎn)2、7、8、24、35和36所對(duì)應(yīng)的基因在兩個(gè)材料最上節(jié)間的表達(dá)結(jié)果顯示,‘長(zhǎng)選3S’的2(Os10g08550)、7(Os12g42876)、8(Os01g55830)基因的表達(dá)量較‘培矮64S’明顯下調(diào),而24... 

【文章來(lái)源】:西北植物學(xué)報(bào). 2020,40(06)北大核心CSCD

【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)

【部分圖文】:

‘培矮64S’與其eui突變體‘長(zhǎng)選3S’穗頸節(jié)間蛋白質(zhì)組差異分析


鑒定的蛋白質(zhì)點(diǎn)2-DE放大圖

熒光定量PCR,基因,相關(guān)蛋白,蛋白質(zhì)


為深入解析eui突變體‘長(zhǎng)選3S’的抽穗性狀與差異表達(dá)蛋白質(zhì)之間的內(nèi)在聯(lián)系,將鑒定的蛋白質(zhì)在Mascot (http://www.matrixscience.com)網(wǎng)站對(duì)本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行檢索,并根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道對(duì)這些蛋白質(zhì)按照功能進(jìn)行分類(lèi)(表3)。由表3可知,這些得到成功鑒定的蛋白質(zhì)可分為6類(lèi):(1) 碳水化合物與能量代謝相關(guān)蛋白,占鑒定蛋白數(shù)的33.33% (下同); (2) 氨基酸代謝相關(guān)蛋白,占11.11%;(3) 細(xì)胞壁重建相關(guān)蛋白,占25.93%; (4) 細(xì)胞解毒相關(guān)蛋白,占18.52%; (5) 基因表達(dá)調(diào)控相關(guān)蛋白,占7.41%和(6) 細(xì)胞骨架相關(guān)蛋白,占3.70%。其中與代謝(如碳水化合物與能量代謝、氨基酸代謝及細(xì)胞解毒等)相關(guān)的蛋白質(zhì)較多,占鑒定蛋白數(shù)的62.96%,其次是細(xì)胞壁重建相關(guān)蛋白。2.5 實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析

形態(tài)圖,蛋白質(zhì),植株,條件


根據(jù)差異蛋白質(zhì)的表達(dá)質(zhì)量,對(duì)40個(gè)差異蛋白質(zhì)點(diǎn)進(jìn)行了肽質(zhì)量指紋圖譜分析及數(shù)據(jù)庫(kù)檢索,最終有27個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)得到成功鑒定(表3),占總差異蛋白質(zhì)點(diǎn)的67.5%。與‘培矮64S’相比,這些鑒定的蛋白質(zhì)中,有10個(gè)在‘長(zhǎng)選3S’穗頸節(jié)中表達(dá)下調(diào)的蛋白質(zhì)(圖3,A)和17個(gè)表達(dá)上調(diào)的蛋白質(zhì)(圖3,B)。其余13個(gè)蛋白質(zhì)點(diǎn)未能得到鑒定,這可能是由于目標(biāo)蛋白質(zhì)含量較少,在MALDI-TOF-TOF-MS分析中不易得到較高質(zhì)量的肽質(zhì)譜指紋圖,或者因?yàn)槠ヅ渎屎透采w率較低等原因,增加了解譜難度,最終影響蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索鑒定的成功率。表2 20 ℃條件下‘長(zhǎng)選3S’與‘培矮64S’性狀比較Table 2 Comparison of morphological traits between ‘Changxuan 3S’ and ‘Peiai 64S’ at 20 ℃ 材料Material 稈高Culm length/cm 劍葉鞘長(zhǎng)Leaf sheath/cm 最上節(jié)間長(zhǎng)度Uppermost internode/cm 穗頸伸出度Panicle extension/cm 花粉可染Stainable pollen/% 自交結(jié)實(shí)率Selfed seeds/% 長(zhǎng)選3S Changxuan 3S 89.46±0.43** 34.84±1.87** 47.53±2.57** 12.65±1.77** 85.32±0.57 33.74±1.57 培矮64S Peiai 64S 68.37±0.52 30.57±1.54 24.64±2.15 -5.93±1.18 87.88±0.57 34.71±2.64 注:**為t測(cè)驗(yàn)0.01顯著水平Note: ** is t test 0.01 level significance

【參考文獻(xiàn)】:
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博士論文
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本文編號(hào):3498909

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