基于FSRAP標記的四倍體小麥遺傳圖譜構建及株高與其相關性狀QTL定位
發(fā)布時間:2021-10-29 01:23
小麥是重要的糧食作物。部分小麥品種易倒伏、抗病蟲害能力弱,限制了糧食的生產,難以滿足人類的需求。矮稈小麥具有抗倒伏、抗病蟲害、耐干旱、耐鹽堿地、提高收獲指數等優(yōu)點,因而具有育種潛力!熬G色革命”以來,由于矮稈小麥和矮稈基因的利用,世界范圍內小麥產量大幅度提升。目前共發(fā)現(xiàn)25個Rht矮稈基因(Rht1~Rht25),僅有Rht1、Rht2和Rht8被廣泛應用于育種實踐?梢,矮稈基因利用十分欠缺,矮稈小麥資源仍然不足,特別是籽粒營養(yǎng)價值較高的四倍體矮稈小麥,在實際育種中應用較少。因此,尋找新的矮稈資源,鑒定新的矮源基因,加強現(xiàn)有矮源和矮稈基因的研究是必要的工作。硬粒小麥ANW16G攜帶矮稈基因Rht18,是重要的四倍體矮稈資源。目前關于ANW16G的研究利用較少。為加強四倍體矮稈小麥的研究和應用,開發(fā)具有育種價值的矮稈基因,本研究將矮稈小麥ANW16G和高稈小麥LD222進行雜交,共獲得210株F2群體,對F2群體株高及各莖節(jié)間長度進行主基因+多基因數量遺傳分析,繪制基于FSRAP標記和SSR標記的遺傳圖譜并進行QTL定位,主要結果如下:1、F...
【文章來源】:西華師范大學四川省
【文章頁數】:69 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
FSRAP正向引物結構
tyofmajorgenes.分子標記分析結果FSRAP多態(tài)性分析使用親本材料ANW16G和LD222篩選所有44×44隨機組合的FSRAP引物共1936對,其中262對引物在親本間具有多態(tài)性。使用親本材料在這262對引物中重復篩選一次,以此驗證FSRAP引物的穩(wěn)定性,最終篩選出170對在親本間具有明顯差異和較強重復性的FSRAP引物,且多態(tài)性位點較為豐富,平均每對引物能檢測出1~6個多態(tài)性位點,少數引物能檢測出10個左右的多態(tài)性位點,總共統(tǒng)計到明顯的多態(tài)性位點245個。使用F2群體對這170對多態(tài)性引物進行基因型篩選,檢測F2群體與親本的連鎖情況。圖3-4、圖3-5為引物Me30Em24和引物Me34Em1對部分F2群體和親本PCR擴增電泳結果?梢钥闯鰯U增條帶整齊清晰。從圖3-4可以看出,F(xiàn)215個矮稈植株中有11個與矮稈親本P1的條帶相同,15個高稈植株中有13個與高稈親本P2一樣沒有條帶,說明Me30Em24引物產生的標記與株高性狀有著較強的遺傳連鎖。圖3-5中15個矮稈植株中同樣有11個與矮稈親本P1條帶相同,但15個高稈植株中卻僅有7個與高稈親本P2一樣沒有條帶,其余8個則與矮稈親本P1條帶相同,說明這些位置發(fā)生了交換,證明引物Me34Em1擴增的標記與株高性狀之間的連鎖性不高。圖3-4引物Me30Em24擴增部分F2群體結果Fig.3-4ResultsofpartialF2populationamplifiedbyprimersMe30Em243.23.2.1
第3章結果與分析27注:紅色箭頭:指示雙親具有多態(tài)性的位置;P1:表示矮稈親本ANW16G;P2:代表高稈親本LD222;數字1~15:表示部分矮稈性狀的F2群體;數字16~30:表示部分高稈性狀的F2群體。Note:Theredarrowindicatesthepositionwheretheparentshavepolymorphism;P1:IndicatesthedwarfparentANW16G;P2:RepresentsthetallparentLD222;Numbers1~15:IndicatessomeF2populationofdwarfcharacters;Numbers16~30:IndicatessomeF2populationoftallcharacters.圖3-5引物Me34Em1擴增部分F2群體結果Fig.3-5ResultsofpartialF2populationamplifiedbyprimersMe34Em1注:紅色箭頭:指向雙親的多態(tài)性位置;P1:代表矮稈親本ANW16G;P2:代表高稈親本LD222;數字1~15:表示部分矮稈性狀的F2群體;數字16~30:表示部分高稈性狀的F2群體。Note:Theredarrowindicatesthepositionwheretheparentshavepolymorphism;P1:IndicatesthedwarfparentANW16G;P2:RepresentsthetallparentLD222;Numbers1~15:IndicatessomeF2populationofdwarfcharacters;Numbers16~30:IndicatessomeF2populationoftallcharacters.SSR多態(tài)性分析使用親本ANW16G和LD222篩選397對小麥SSR引物,SSR引物分布于小麥1~7號A、B組染色體上,其中118對SSR引物在親本間具有多態(tài)性。再次使用親本篩選這118對引物,驗證SSR引物可重復性,最終篩選出87對在親本間有明顯差異和高可重復性的SSR引物,平均每對引物檢測的多態(tài)性位點在1~3個之間。結合網站https://wheat.pw.usda.gov/GG3/給出的SSR標記的大小,以及電泳圖中多態(tài)性位點的明顯程度,選擇最優(yōu)的多態(tài)性位點進行統(tǒng)計,每對引物只統(tǒng)計一個。每對染色體上挑選1~5對SSR引物對F2群體進行擴增,總共挑選32對親本間差異最為明顯
【參考文獻】:
期刊論文
[1]小麥株高及其構成因子QTL定位研究[J]. 余馬,張洪,左文松,李明,侯大斌. 四川農業(yè)大學學報. 2017(04)
[2]四倍體矮稈小麥拔節(jié)期赤霉素合成途徑中關鍵酶基因表達分析[J]. 胡召杉,巫有霞,楊在君,王清海,彭正松. 種子. 2016(01)
[3]四倍體小麥地方品種矮藍麥矮稈性狀的遺傳分析[J]. 周強,袁中偉,張連全,甯順腙,任勇,陶軍,李生榮,劉登才. 作物學報. 2015(12)
[4]四倍體小麥矮稈基因的赤霉素敏感性及對農藝性狀的影響[J]. 王清海,楊在君,魏淑紅,廖明莉,蘇瑾,楊宇鳳,楊會,王育偉,彭正松. 華北農學報. 2015(02)
[5]鹽脅迫下水稻苗高和分蘗數的發(fā)育動態(tài)QTL分析[J]. 孫健,王敬國,劉化龍,謝冬微,鄭洪亮,趙宏偉,鄒德堂,欒非時. 核農學報. 2015(02)
[6]矮稈糯小麥株高及各節(jié)間長度與產量性狀遺傳研究[J]. 歐俊梅,王治斌,李生榮,任勇,周強,陶軍. 華北農學報. 2014(S1)
[7]小麥重組自交系群體9個重要農藝性狀的遺傳分析[J]. 李法計,常鑫,王宇娟,宋全昊,田芳慧,孫道杰. 麥類作物學報. 2013(01)
[8]小麥植株節(jié)間長度分析[J]. 陸博,張萬芹,張清山,茹振鋼,馮素偉,王云霞,楊小剛,吳增寶. 數學的實踐與認識. 2012(23)
[9]小麥單株穗數的遺傳分析及基于QTL定位的最優(yōu)基因型預測[J]. 王培,李曉林,楊林,吳青霞,楊子博,白志元,李立群,李學軍. 麥類作物學報. 2012(05)
[10]利用永久F2群體定位小麥株高的QTL[J]. 王巖,李卓坤,田紀春. 作物學報. 2009(06)
博士論文
[1]河北省冬小麥品種遺傳分析和超高產特征研究[D]. 李瑞奇.河北農業(yè)大學 2014
碩士論文
[1]四倍體矮稈小麥ANW16G和高稈小麥LD222代謝組學比較研究[D]. 胡文涵.西華師范大學 2019
[2]利用EST-SSR分子標記構建小麥遺傳圖譜[D]. 代暢.西華師范大學 2018
[3]小麥三雌蕊基因Pis1的精細定位[D]. 羅琴.西華師范大學 2018
[4]帶熒光標簽的SRAP標記(FSRAP)開發(fā)及在小麥遺傳圖譜中的應用[D]. 張莉.西華師范大學 2017
[5]大白菜連鎖圖譜的構建和重要農藝性狀的QTL定位[D]. 張立陽.揚州大學 2005
[6]小麥莖稈強度及其相關性狀的QTL分析[D]. 郭會君.中國農業(yè)科學院 2002
本文編號:3463690
【文章來源】:西華師范大學四川省
【文章頁數】:69 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
FSRAP正向引物結構
tyofmajorgenes.分子標記分析結果FSRAP多態(tài)性分析使用親本材料ANW16G和LD222篩選所有44×44隨機組合的FSRAP引物共1936對,其中262對引物在親本間具有多態(tài)性。使用親本材料在這262對引物中重復篩選一次,以此驗證FSRAP引物的穩(wěn)定性,最終篩選出170對在親本間具有明顯差異和較強重復性的FSRAP引物,且多態(tài)性位點較為豐富,平均每對引物能檢測出1~6個多態(tài)性位點,少數引物能檢測出10個左右的多態(tài)性位點,總共統(tǒng)計到明顯的多態(tài)性位點245個。使用F2群體對這170對多態(tài)性引物進行基因型篩選,檢測F2群體與親本的連鎖情況。圖3-4、圖3-5為引物Me30Em24和引物Me34Em1對部分F2群體和親本PCR擴增電泳結果?梢钥闯鰯U增條帶整齊清晰。從圖3-4可以看出,F(xiàn)215個矮稈植株中有11個與矮稈親本P1的條帶相同,15個高稈植株中有13個與高稈親本P2一樣沒有條帶,說明Me30Em24引物產生的標記與株高性狀有著較強的遺傳連鎖。圖3-5中15個矮稈植株中同樣有11個與矮稈親本P1條帶相同,但15個高稈植株中卻僅有7個與高稈親本P2一樣沒有條帶,其余8個則與矮稈親本P1條帶相同,說明這些位置發(fā)生了交換,證明引物Me34Em1擴增的標記與株高性狀之間的連鎖性不高。圖3-4引物Me30Em24擴增部分F2群體結果Fig.3-4ResultsofpartialF2populationamplifiedbyprimersMe30Em243.23.2.1
第3章結果與分析27注:紅色箭頭:指示雙親具有多態(tài)性的位置;P1:表示矮稈親本ANW16G;P2:代表高稈親本LD222;數字1~15:表示部分矮稈性狀的F2群體;數字16~30:表示部分高稈性狀的F2群體。Note:Theredarrowindicatesthepositionwheretheparentshavepolymorphism;P1:IndicatesthedwarfparentANW16G;P2:RepresentsthetallparentLD222;Numbers1~15:IndicatessomeF2populationofdwarfcharacters;Numbers16~30:IndicatessomeF2populationoftallcharacters.圖3-5引物Me34Em1擴增部分F2群體結果Fig.3-5ResultsofpartialF2populationamplifiedbyprimersMe34Em1注:紅色箭頭:指向雙親的多態(tài)性位置;P1:代表矮稈親本ANW16G;P2:代表高稈親本LD222;數字1~15:表示部分矮稈性狀的F2群體;數字16~30:表示部分高稈性狀的F2群體。Note:Theredarrowindicatesthepositionwheretheparentshavepolymorphism;P1:IndicatesthedwarfparentANW16G;P2:RepresentsthetallparentLD222;Numbers1~15:IndicatessomeF2populationofdwarfcharacters;Numbers16~30:IndicatessomeF2populationoftallcharacters.SSR多態(tài)性分析使用親本ANW16G和LD222篩選397對小麥SSR引物,SSR引物分布于小麥1~7號A、B組染色體上,其中118對SSR引物在親本間具有多態(tài)性。再次使用親本篩選這118對引物,驗證SSR引物可重復性,最終篩選出87對在親本間有明顯差異和高可重復性的SSR引物,平均每對引物檢測的多態(tài)性位點在1~3個之間。結合網站https://wheat.pw.usda.gov/GG3/給出的SSR標記的大小,以及電泳圖中多態(tài)性位點的明顯程度,選擇最優(yōu)的多態(tài)性位點進行統(tǒng)計,每對引物只統(tǒng)計一個。每對染色體上挑選1~5對SSR引物對F2群體進行擴增,總共挑選32對親本間差異最為明顯
【參考文獻】:
期刊論文
[1]小麥株高及其構成因子QTL定位研究[J]. 余馬,張洪,左文松,李明,侯大斌. 四川農業(yè)大學學報. 2017(04)
[2]四倍體矮稈小麥拔節(jié)期赤霉素合成途徑中關鍵酶基因表達分析[J]. 胡召杉,巫有霞,楊在君,王清海,彭正松. 種子. 2016(01)
[3]四倍體小麥地方品種矮藍麥矮稈性狀的遺傳分析[J]. 周強,袁中偉,張連全,甯順腙,任勇,陶軍,李生榮,劉登才. 作物學報. 2015(12)
[4]四倍體小麥矮稈基因的赤霉素敏感性及對農藝性狀的影響[J]. 王清海,楊在君,魏淑紅,廖明莉,蘇瑾,楊宇鳳,楊會,王育偉,彭正松. 華北農學報. 2015(02)
[5]鹽脅迫下水稻苗高和分蘗數的發(fā)育動態(tài)QTL分析[J]. 孫健,王敬國,劉化龍,謝冬微,鄭洪亮,趙宏偉,鄒德堂,欒非時. 核農學報. 2015(02)
[6]矮稈糯小麥株高及各節(jié)間長度與產量性狀遺傳研究[J]. 歐俊梅,王治斌,李生榮,任勇,周強,陶軍. 華北農學報. 2014(S1)
[7]小麥重組自交系群體9個重要農藝性狀的遺傳分析[J]. 李法計,常鑫,王宇娟,宋全昊,田芳慧,孫道杰. 麥類作物學報. 2013(01)
[8]小麥植株節(jié)間長度分析[J]. 陸博,張萬芹,張清山,茹振鋼,馮素偉,王云霞,楊小剛,吳增寶. 數學的實踐與認識. 2012(23)
[9]小麥單株穗數的遺傳分析及基于QTL定位的最優(yōu)基因型預測[J]. 王培,李曉林,楊林,吳青霞,楊子博,白志元,李立群,李學軍. 麥類作物學報. 2012(05)
[10]利用永久F2群體定位小麥株高的QTL[J]. 王巖,李卓坤,田紀春. 作物學報. 2009(06)
博士論文
[1]河北省冬小麥品種遺傳分析和超高產特征研究[D]. 李瑞奇.河北農業(yè)大學 2014
碩士論文
[1]四倍體矮稈小麥ANW16G和高稈小麥LD222代謝組學比較研究[D]. 胡文涵.西華師范大學 2019
[2]利用EST-SSR分子標記構建小麥遺傳圖譜[D]. 代暢.西華師范大學 2018
[3]小麥三雌蕊基因Pis1的精細定位[D]. 羅琴.西華師范大學 2018
[4]帶熒光標簽的SRAP標記(FSRAP)開發(fā)及在小麥遺傳圖譜中的應用[D]. 張莉.西華師范大學 2017
[5]大白菜連鎖圖譜的構建和重要農藝性狀的QTL定位[D]. 張立陽.揚州大學 2005
[6]小麥莖稈強度及其相關性狀的QTL分析[D]. 郭會君.中國農業(yè)科學院 2002
本文編號:3463690
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