轉(zhuǎn)錄組測序輔助預(yù)測甘藍(lán)型油菜黃籽基因
發(fā)布時間:2021-10-26 16:40
油菜的抗逆性強(qiáng),適應(yīng)范圍廣,是我國區(qū)域分布最廣的油料作物。與黑籽相比,黃籽油菜具有含油量高、蛋白質(zhì)含量高、纖維素和多酚含量低、油質(zhì)清亮等優(yōu)點(diǎn)。油菜的種皮顏色受多基因控制,黑籽一般為顯性,多個位點(diǎn)都為隱性純合時才表現(xiàn)為黃籽,所以選育高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)的黃籽甘藍(lán)型油菜品種非常困難。人工合成的甘藍(lán)型油菜品系No.2127-17的籽粒純黃,其黃籽性狀受一對不完全顯性基因控制,這種遺傳模式明顯不同于油菜中的其它黃籽材料。前期的研究中,我們完成了顯性黃籽基因的精細(xì)定位。本研究中,我們對黃籽材料NO.2127-17和黑籽材料ZY821以及黃籽近等基因系ZY821(Y)進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測序,旨在闡明該基因控制的代謝途徑及其調(diào)控規(guī)律,并結(jié)合定位結(jié)果、qRT-PCR結(jié)果以及BAC序列鑒定黃籽候選基因,為最終克隆到該黃籽基因提供依據(jù)。本研究主要結(jié)果如下:1.對黃籽材料NO.2127-17和黑籽材料ZY821以及黃籽近等基因系ZY821(Y)開花后12天(12DAP)、19天(19DAP)、26天(26DAP)和33天(33DAP)的種皮進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。分析發(fā)現(xiàn),各個時間點(diǎn)的差異表達(dá)基因都極特異的聚類在類黃酮合成相關(guān)通路中...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
珠被在甘藍(lán)型油菜種子發(fā)育過程中的分化(Nesietal2009)
轉(zhuǎn)錄組測序輔助預(yù)測甘藍(lán)型油菜黃籽基因種皮顏色有很大影響,而棕色種皮中不含山奈酚。唐志東(2013)通過CMS-IT-TOF定性檢測四川黃籽及其黑籽近等基因系種皮中類黃酮提取物的種,發(fā)現(xiàn)楊梅酮、茶黃素、山奈酚-3-葡萄糖苷、槲皮素某種衍生物和表兒茶素5種類黃酮只存在于黑籽種皮中,表明這幾種物質(zhì)可能是黑籽與黃籽間種皮差異形成的決定性色素。雖然對于影響種皮顏色的色素物質(zhì)仍有爭論,但現(xiàn)在研究人員普遍認(rèn)為影皮顏色形成的主要是類黃酮類化合物,并且對油菜種子發(fā)育時期類黃酮代謝究主要集中在PA的積累。
圖 2-2 植株材料表型Fig. 2-2 The phenotype of plant material試劑試劑: 連接酶(New England Biolabs)s 高保真酶(TOYOBO)aster Mix(Vazyme)(Monad)取試劑盒(Tiangen)劑盒(Qiagene)劑盒(Thermo Fisher Scientific)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腫瘤抑制因子CYLD與泛素化及相關(guān)疾病研究進(jìn)展[J]. 蔣佳純,張澄,葉孟. 現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué). 2014(01)
[2]依托科技創(chuàng)新與服務(wù)加快油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展方式轉(zhuǎn)變[J]. 官春云. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(社會科學(xué)版). 2010(04)
[3]我國油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展的歷史回顧與展望[J]. 王漢中. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2010(02)
[4]甘藍(lán)型油菜粒色與含油量的研究[J]. 薛漢軍,孫利軍,梁升平,白紅濤,董振生,蘇波. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2010(01)
[5]芥菜型油菜黃黑種皮色澤特征的分析化學(xué)研究[J]. 曾盔,劉忠松,嚴(yán)明理,曾笑. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2006(04)
[6]甘藍(lán)型黑籽和黃籽油菜種子發(fā)育過程中種皮色澤差異研究 Ⅱ.黑色素、酪氨酸和酪氨酸酶的變化及相關(guān)性[J]. 葉小利,李加納,唐章林,諶利. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2001(03)
[7]甘藍(lán)型油菜黃籽和黑籽皮殼中花色素、多酚、苯丙烯酸含量和PAL酶活性的變異[J]. 王漢中,劉后利. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1996(06)
[8]甘藍(lán)型油菜種子發(fā)育過程中種皮顏色變化[J]. 陳玉萍,劉后利. 中國油料. 1995(02)
[9]甘藍(lán)型黃籽油菜的遺傳研究[J]. 劉后利. 作物學(xué)報(bào). 1992(04)
[10]油菜皮殼中多酚氧化酶活性的組織化學(xué)檢定及其與粒色的關(guān)系[J]. 王漢中,劉后利. 中國油料. 1991(01)
博士論文
[1]基于RNAi揭示BnTT1參與油菜種子發(fā)育與代謝的功能特征[D]. 練劍平.西南大學(xué) 2017
[2]甘藍(lán)籽粒色澤的遺傳及其與甘藍(lán)型油菜的比較[D]. 唐章林.西南大學(xué) 2012
碩士論文
[1]基于高通量表型檢測平臺解析甘藍(lán)型油菜表型性狀的遺傳基礎(chǔ)[D]. 楊山井.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]延邊黃牛和韓延牛血液外胞體中miRNA的差異表達(dá)分析[D]. 張睿.延邊大學(xué) 2018
[3]芥菜型油菜黃籽基因定位及其功能驗(yàn)證[D]. 王陽.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[4]BnaA.BAN.a調(diào)控甘藍(lán)型油菜種皮色素成分的研究[D]. 朱寶.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[5]人工合成甘藍(lán)型油菜的創(chuàng)建及其表觀遺傳分析[D]. 孔月琴.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[6]油菜莢果轉(zhuǎn)錄組測序分析及油分相關(guān)候選基因的鑒別[D]. 孔祥東.浙江大學(xué) 2015
[7]油菜種皮顏色與含油量、色素含量的關(guān)系研究[D]. 唐志東.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]人工合成甘藍(lán)型黃籽油菜No.2127-17粒色基因差異表達(dá)研究[D]. 陳麗.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]甘藍(lán)型油菜及其親本物種TT12基因家族的克隆與比較基因組學(xué)研究[D]. 黃華磊.西南大學(xué) 2007
[10]甘藍(lán)型油菜編碼WIP-鋅指蛋白的TT1基因家族的克隆及在黃、黑籽之間的差異表達(dá)[D]. 路小春.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
本文編號:3459844
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:74 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
珠被在甘藍(lán)型油菜種子發(fā)育過程中的分化(Nesietal2009)
轉(zhuǎn)錄組測序輔助預(yù)測甘藍(lán)型油菜黃籽基因種皮顏色有很大影響,而棕色種皮中不含山奈酚。唐志東(2013)通過CMS-IT-TOF定性檢測四川黃籽及其黑籽近等基因系種皮中類黃酮提取物的種,發(fā)現(xiàn)楊梅酮、茶黃素、山奈酚-3-葡萄糖苷、槲皮素某種衍生物和表兒茶素5種類黃酮只存在于黑籽種皮中,表明這幾種物質(zhì)可能是黑籽與黃籽間種皮差異形成的決定性色素。雖然對于影響種皮顏色的色素物質(zhì)仍有爭論,但現(xiàn)在研究人員普遍認(rèn)為影皮顏色形成的主要是類黃酮類化合物,并且對油菜種子發(fā)育時期類黃酮代謝究主要集中在PA的積累。
圖 2-2 植株材料表型Fig. 2-2 The phenotype of plant material試劑試劑: 連接酶(New England Biolabs)s 高保真酶(TOYOBO)aster Mix(Vazyme)(Monad)取試劑盒(Tiangen)劑盒(Qiagene)劑盒(Thermo Fisher Scientific)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]腫瘤抑制因子CYLD與泛素化及相關(guān)疾病研究進(jìn)展[J]. 蔣佳純,張澄,葉孟. 現(xiàn)代實(shí)用醫(yī)學(xué). 2014(01)
[2]依托科技創(chuàng)新與服務(wù)加快油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展方式轉(zhuǎn)變[J]. 官春云. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(社會科學(xué)版). 2010(04)
[3]我國油菜產(chǎn)業(yè)發(fā)展的歷史回顧與展望[J]. 王漢中. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2010(02)
[4]甘藍(lán)型油菜粒色與含油量的研究[J]. 薛漢軍,孫利軍,梁升平,白紅濤,董振生,蘇波. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2010(01)
[5]芥菜型油菜黃黑種皮色澤特征的分析化學(xué)研究[J]. 曾盔,劉忠松,嚴(yán)明理,曾笑. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2006(04)
[6]甘藍(lán)型黑籽和黃籽油菜種子發(fā)育過程中種皮色澤差異研究 Ⅱ.黑色素、酪氨酸和酪氨酸酶的變化及相關(guān)性[J]. 葉小利,李加納,唐章林,諶利. 中國油料作物學(xué)報(bào). 2001(03)
[7]甘藍(lán)型油菜黃籽和黑籽皮殼中花色素、多酚、苯丙烯酸含量和PAL酶活性的變異[J]. 王漢中,劉后利. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 1996(06)
[8]甘藍(lán)型油菜種子發(fā)育過程中種皮顏色變化[J]. 陳玉萍,劉后利. 中國油料. 1995(02)
[9]甘藍(lán)型黃籽油菜的遺傳研究[J]. 劉后利. 作物學(xué)報(bào). 1992(04)
[10]油菜皮殼中多酚氧化酶活性的組織化學(xué)檢定及其與粒色的關(guān)系[J]. 王漢中,劉后利. 中國油料. 1991(01)
博士論文
[1]基于RNAi揭示BnTT1參與油菜種子發(fā)育與代謝的功能特征[D]. 練劍平.西南大學(xué) 2017
[2]甘藍(lán)籽粒色澤的遺傳及其與甘藍(lán)型油菜的比較[D]. 唐章林.西南大學(xué) 2012
碩士論文
[1]基于高通量表型檢測平臺解析甘藍(lán)型油菜表型性狀的遺傳基礎(chǔ)[D]. 楊山井.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]延邊黃牛和韓延牛血液外胞體中miRNA的差異表達(dá)分析[D]. 張睿.延邊大學(xué) 2018
[3]芥菜型油菜黃籽基因定位及其功能驗(yàn)證[D]. 王陽.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2018
[4]BnaA.BAN.a調(diào)控甘藍(lán)型油菜種皮色素成分的研究[D]. 朱寶.揚(yáng)州大學(xué) 2016
[5]人工合成甘藍(lán)型油菜的創(chuàng)建及其表觀遺傳分析[D]. 孔月琴.揚(yáng)州大學(xué) 2015
[6]油菜莢果轉(zhuǎn)錄組測序分析及油分相關(guān)候選基因的鑒別[D]. 孔祥東.浙江大學(xué) 2015
[7]油菜種皮顏色與含油量、色素含量的關(guān)系研究[D]. 唐志東.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[8]人工合成甘藍(lán)型黃籽油菜No.2127-17粒色基因差異表達(dá)研究[D]. 陳麗.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[9]甘藍(lán)型油菜及其親本物種TT12基因家族的克隆與比較基因組學(xué)研究[D]. 黃華磊.西南大學(xué) 2007
[10]甘藍(lán)型油菜編碼WIP-鋅指蛋白的TT1基因家族的克隆及在黃、黑籽之間的差異表達(dá)[D]. 路小春.云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2006
本文編號:3459844
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