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大豆轉(zhuǎn)座子Tgm9的轉(zhuǎn)座酶與非自主轉(zhuǎn)座子相互作用的研究

發(fā)布時間:2021-08-12 19:03
  大豆花色素的合成過程中是由許多基因控制的,其中W4基因控制了大豆花和下胚軸的顏色,編碼二氫黃酮還原酶。大豆植株含有野生型的W4基因時,大豆植株開紫色花,下胚軸也是紫色。W4基因突變?yōu)榧兒想[型w4基因時,大豆植株開白色花,下胚軸是綠色。在大豆不穩(wěn)定系發(fā)現(xiàn)大豆花色和下胚軸的顏色是雜斑(葉片有白色和紫色斑點)。后來證明是由于大豆中的活性轉(zhuǎn)座子Tgm9(Transposon Glycine max)插入DFR2基因?qū)е碌。大豆轉(zhuǎn)座子Tgm9的全長約為20 kb,屬于CACTA型的活性轉(zhuǎn)座子。由包含有末端反向重復(fù)序列的非自主轉(zhuǎn)座子元件和轉(zhuǎn)座酶元件構(gòu)成。Tgm9有27個外顯子以及2個開放閱讀框ORF1和ORF2,分別編碼轉(zhuǎn)座酶GmTNP2(1060 aa)和GmTNP1(750 aa)。其結(jié)構(gòu)完整,序列明確,但是其轉(zhuǎn)座機制仍然不清楚。將轉(zhuǎn)座酶GmTNP2保守的蛋白序列進行對比發(fā)現(xiàn),GmTNP2與金魚草Tam1的TNP2有32%的相似性,與玉米En/Spm的TNPD有46%的相似性。因此推測大豆轉(zhuǎn)座子Tgm9的轉(zhuǎn)... 

【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:114 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

大豆轉(zhuǎn)座子Tgm9的轉(zhuǎn)座酶與非自主轉(zhuǎn)座子相互作用的研究


轉(zhuǎn)座子的分類

序列,轉(zhuǎn)座子,大豆


西北大學(xué)碩士學(xué)位論文6元件的拷貝數(shù)不超過10。因此Tgm9像大多數(shù)CACTA型的轉(zhuǎn)座子一樣,是低拷貝的轉(zhuǎn)座元件[45];钴S的低拷貝的內(nèi)源性轉(zhuǎn)座子在基因克隆以及功能基因組學(xué)研究等方面是有用的工具[59]。遺傳數(shù)據(jù)表明,根壞死(necroticroot,rn),雄性不育和雌性不育(st8)等遺傳突變[60][61][62]很可能是由于轉(zhuǎn)座子Tgm9的插入導(dǎo)致[63]。因此高度活躍的大豆轉(zhuǎn)座子Tgm9促進了大豆功能基因組學(xué)的研究。圖1-2Tgm9轉(zhuǎn)座子的結(jié)構(gòu)Fig.1-2StructureoftheTgm9element1.3本課題研究的目的意義大豆是世界上主要的農(nóng)作物之一,含有豐富的蛋白質(zhì)(大約40%)和油脂(大約20%),因此大豆是人類營養(yǎng)以及牲口和水產(chǎn)養(yǎng)殖飼料的重要來源[64]。近幾年,在開發(fā)大豆基因組資源方面取得了很大的進步,包括對大豆全基因組的測序,F(xiàn)在已經(jīng)確定了大豆中許多的基因,但是其功能還有很多是未知的。T-DNA插入構(gòu)建突變體庫以及轉(zhuǎn)座子標簽是研究未知基因功能的重要手段,目前T-DNA插入構(gòu)建突變體庫在擬南芥中已經(jīng)被有效的利用[65]。來自玉米(Ac/Ds)、水稻(mPing)、煙草(Tn1)中活躍的外源轉(zhuǎn)座子目前也被用來研究大豆的基因功能[66][67][68]。但是T-DNA插入構(gòu)建突變體庫以及轉(zhuǎn)座子標簽這些技術(shù)都需要基因的轉(zhuǎn)化,然而大豆中基因轉(zhuǎn)化的效率很低。在大豆中已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一些內(nèi)源性的轉(zhuǎn)座子[45]。在這些轉(zhuǎn)座子中,Tgm9是唯一發(fā)現(xiàn)的具有活性的內(nèi)源性的大豆轉(zhuǎn)座子,利用大豆內(nèi)源轉(zhuǎn)座子構(gòu)建大豆轉(zhuǎn)座子突變體庫是分析大豆基因功能的強有力手段[69][70]。Tgm9具有完整的結(jié)構(gòu),并且其序列也比較清楚。但是到目前為止,其轉(zhuǎn)座機制還不清楚,將轉(zhuǎn)座酶的保守序列進行對比發(fā)現(xiàn)其與玉米En/Spm具有很高的相似性。因此我們推測他們的轉(zhuǎn)座機制類似。轉(zhuǎn)座機制如下圖1-3所示。

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第一章前言7圖1-3Tgm9轉(zhuǎn)座子的切除機制Fig.1-3ModelforexcisionofTgm91.4實驗設(shè)計了解大豆轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)座元件之間的相互作用,首先通過將轉(zhuǎn)座元件轉(zhuǎn)入擬南芥突變體(im以及gun5)中來了解其活性。選擇以擬南芥im和gun5植株作為研究材料,主要的原因有1、植株表型容易觀察。2、擬南芥的遺傳轉(zhuǎn)化比較容易。沒有選擇大豆植株作為材料的主要原因是大豆的轉(zhuǎn)基因比較困難。我們預(yù)期是想要建立一個以PTOX或Gun5作為報告基因來檢測轉(zhuǎn)座子是否跳走的系統(tǒng),為在大豆中研究轉(zhuǎn)座子的機制建立基矗其次通過煙草瞬時表達來探究轉(zhuǎn)座元件之間的相互作用。目前我們實驗室已經(jīng)通過雙分子熒光互補實驗(bimolecularfluorescencecomplementation,BiFC)探究了轉(zhuǎn)座酶TNP1與TNP2的相互作用,本研究主要通過煙草瞬時表達探究轉(zhuǎn)座酶與非自主轉(zhuǎn)座子的相互作用機制。實驗設(shè)計如圖1-4所示。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]玉米Mu轉(zhuǎn)座因子及其應(yīng)用[J]. 高友軍,劉文婷,陶勇生,鄭用璉.  作物學(xué)報. 2006(08)
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[3]玉米轉(zhuǎn)座子spm的分子遺傳學(xué)的概述[J]. 史桂榮,祁永紅,齊玫馨.  黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué). 1993(05)



本文編號:3338894

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