棉花染色體細(xì)胞學(xué)標(biāo)記的開發(fā)及其著絲粒DNA序列的分析
發(fā)布時(shí)間:2021-03-12 04:29
棉花是世界上重要的纖維作物,同時(shí)也是研究植物多倍化演化的模式材料。由于四倍體陸地棉染色體數(shù)目多(2n=52)且染色體長(zhǎng)度較短,缺乏明顯的表型區(qū)別,因此,難以開展染色體的識(shí)別與深入的核型分析。本研究通過篩選人工染色體BAC克隆,獲得了一套位于異源四倍體陸地棉26條染色體不同臂的特異BAC。在此基礎(chǔ)上,結(jié)合著絲粒特異的BAC 97G20和擬南芥端粒特異的序列標(biāo)記,對(duì)陸地棉進(jìn)行了染色體的精細(xì)識(shí)別。結(jié)果發(fā)現(xiàn):最長(zhǎng)染色體是A亞組的10號(hào)染色體,長(zhǎng)度是3.51 μm(131.0Mb)占比是5.40%。最短的染色體是D亞組的4號(hào)染色體,長(zhǎng)度是1.59μm(59.4Mb)占比是2.45%。除了A亞組的四號(hào)染色體比它同源的D亞組的染色體短,A亞組的染色體都長(zhǎng)于D亞組相對(duì)應(yīng)的同源染色體。同時(shí),在棉屬的不同種間,使用陸地棉核型分析的BAC做探針,其結(jié)果顯示,這一套標(biāo)記適用于棉屬不同種間的染色體核型分析。以上的這些實(shí)驗(yàn)結(jié)果對(duì)陸地棉在染色體水平和棉花基因結(jié)構(gòu)方面進(jìn)行了詳細(xì)的分析,擴(kuò)大了棉花基因組結(jié)構(gòu)的認(rèn)識(shí),同時(shí)為植物細(xì)胞遺傳學(xué)的研究提供有力的工具。在大多數(shù)的真核植物中著絲粒染色質(zhì)是由高度重復(fù)的著絲粒反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子...
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
縮略詞表
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 棉屬的分類
2 陸地棉的特征
3 熒光原位雜交技術(shù)
3.1 熒光原位雜交技術(shù)簡(jiǎn)介
3.2 熒光原位雜交的基本原理
3.3 原位雜交技術(shù)的發(fā)展
4 熒光原位雜交技術(shù)的應(yīng)用
4.1 染色體作圖
4.2 比較染色體作圖
4.3 單拷貝基因比較染色體作圖
4.4 轉(zhuǎn)基因植物鑒定中的應(yīng)用
4.5 植物重復(fù)序列的研究
5 植物著絲粒的研究進(jìn)展
5.1 植物著絲粒的DNA序列
5.1.1 衛(wèi)星DNA序列
5.1.2 反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子
5.2 植物著絲粒特異組蛋白
5.3 植物著絲粒DNA序列的進(jìn)化
6 本研究的目的和內(nèi)容
6.1 目的和意義
6.2 主要研究?jī)?nèi)容
第二章 陸地棉染色體的細(xì)胞學(xué)研究
1 材料
2 方法
2.1 熒光原位雜交
2.1.1 靶染色體制備
2.1.2 探針的制備
2.1.3 原位雜交
2.2 信號(hào)檢測(cè)與圖像分析
2.3 棉花特異BAC的提取
3 結(jié)果與分析
3.1 陸地棉染色體臂特異BAC克隆的篩選
3.2 陸地棉的核型分析
3.2.1 使用陸地棉著絲粒特異的BAC序列和端粒序列進(jìn)行分析
3.2.2 陸地棉染色體的測(cè)量
3.3 陸地棉近緣種間染色體長(zhǎng)度的分析
3.3.1 陸地棉AD亞組染色體長(zhǎng)度的比較
3.3.2 陸地棉A亞組的6號(hào)和8號(hào)染色體與其祖先染色體比較的研究
3.4 陸地棉45S rDNA和5S rDNA位點(diǎn)
3.5 陸地棉特異BACs在棉屬不同種適用性分析
4 討論
4.1 染色體BAC在測(cè)序中的應(yīng)用
4.2 陸地棉AD亞組染色體測(cè)量長(zhǎng)度不同的討論
4.3 陸地棉AD亞組染色體重復(fù)序列在非編碼區(qū)域的擴(kuò)增
第三章 棉花著絲粒DNA序列的進(jìn)化分析
1 材料
2 方法
2.1 棉花基因組DNA的提取
2.2 膠回收
2.3 染色質(zhì)免疫共沉淀
3 結(jié)果與分析
3.1 雷蒙德氏棉著絲粒序列的挖掘與分析
3.1.1 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的挖掘
3.1.2 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的分析
3.2 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的fiber-FISH分析
3.3 雷蒙德氏棉著絲粒序列在棉屬間的演化模式
4 討論
4.1 陸地棉中呈擴(kuò)大趨勢(shì)的反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子
4.2 關(guān)于Gr298,Gr359和Gr334序列的進(jìn)一步推論
第四章 小結(jié)與展望
1 小結(jié)
2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號(hào):3077681
【文章來源】:福建農(nóng)林大學(xué)福建省
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
縮略詞表
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 棉屬的分類
2 陸地棉的特征
3 熒光原位雜交技術(shù)
3.1 熒光原位雜交技術(shù)簡(jiǎn)介
3.2 熒光原位雜交的基本原理
3.3 原位雜交技術(shù)的發(fā)展
4 熒光原位雜交技術(shù)的應(yīng)用
4.1 染色體作圖
4.2 比較染色體作圖
4.3 單拷貝基因比較染色體作圖
4.4 轉(zhuǎn)基因植物鑒定中的應(yīng)用
4.5 植物重復(fù)序列的研究
5 植物著絲粒的研究進(jìn)展
5.1 植物著絲粒的DNA序列
5.1.1 衛(wèi)星DNA序列
5.1.2 反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子
5.2 植物著絲粒特異組蛋白
5.3 植物著絲粒DNA序列的進(jìn)化
6 本研究的目的和內(nèi)容
6.1 目的和意義
6.2 主要研究?jī)?nèi)容
第二章 陸地棉染色體的細(xì)胞學(xué)研究
1 材料
2 方法
2.1 熒光原位雜交
2.1.1 靶染色體制備
2.1.2 探針的制備
2.1.3 原位雜交
2.2 信號(hào)檢測(cè)與圖像分析
2.3 棉花特異BAC的提取
3 結(jié)果與分析
3.1 陸地棉染色體臂特異BAC克隆的篩選
3.2 陸地棉的核型分析
3.2.1 使用陸地棉著絲粒特異的BAC序列和端粒序列進(jìn)行分析
3.2.2 陸地棉染色體的測(cè)量
3.3 陸地棉近緣種間染色體長(zhǎng)度的分析
3.3.1 陸地棉AD亞組染色體長(zhǎng)度的比較
3.3.2 陸地棉A亞組的6號(hào)和8號(hào)染色體與其祖先染色體比較的研究
3.4 陸地棉45S rDNA和5S rDNA位點(diǎn)
3.5 陸地棉特異BACs在棉屬不同種適用性分析
4 討論
4.1 染色體BAC在測(cè)序中的應(yīng)用
4.2 陸地棉AD亞組染色體測(cè)量長(zhǎng)度不同的討論
4.3 陸地棉AD亞組染色體重復(fù)序列在非編碼區(qū)域的擴(kuò)增
第三章 棉花著絲粒DNA序列的進(jìn)化分析
1 材料
2 方法
2.1 棉花基因組DNA的提取
2.2 膠回收
2.3 染色質(zhì)免疫共沉淀
3 結(jié)果與分析
3.1 雷蒙德氏棉著絲粒序列的挖掘與分析
3.1.1 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的挖掘
3.1.2 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的分析
3.2 雷蒙德氏棉著絲粒特異序列的fiber-FISH分析
3.3 雷蒙德氏棉著絲粒序列在棉屬間的演化模式
4 討論
4.1 陸地棉中呈擴(kuò)大趨勢(shì)的反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子
4.2 關(guān)于Gr298,Gr359和Gr334序列的進(jìn)一步推論
第四章 小結(jié)與展望
1 小結(jié)
2 展望
參考文獻(xiàn)
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本文編號(hào):3077681
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