馬尾松（Pinus massoniana Lamb.）是我國(guó)主要產(chǎn)脂樹(shù)種之一,近些年來(lái)由于其森林面積和產(chǎn)脂樹(shù)木的減少,導(dǎo)致松脂產(chǎn)量降低;采用經(jīng)典的輪回育種策略對(duì)馬尾松高產(chǎn)脂進(jìn)行遺傳改良所需周期較長(zhǎng),短時(shí)間內(nèi)難以滿足市場(chǎng)對(duì)馬尾松高產(chǎn)脂良種的需求。運(yùn)用基因組關(guān)聯(lián)分析方法,通過(guò)篩選出與產(chǎn)脂性狀顯著關(guān)聯(lián)的分子標(biāo)記,開(kāi)展分子標(biāo)記輔助選擇研究,對(duì)馬尾松高產(chǎn)脂良種快速選育,縮短育種周期具有重要意義。而對(duì)于顯著性關(guān)聯(lián)標(biāo)記所在基因序列進(jìn)行深度挖掘,是發(fā)現(xiàn)控制目標(biāo)性狀重要基因的有效途徑,對(duì)于深層次探究并最終揭示馬尾松產(chǎn)脂量性狀遺傳調(diào)控機(jī)理具有重要意義。本研究基于馬尾松產(chǎn)脂性狀候選基因組關(guān)聯(lián)分析和簡(jiǎn)化基因組關(guān)聯(lián)分析研究所得到的3個(gè)顯著性關(guān)聯(lián)分子標(biāo)記（1個(gè)SSR標(biāo)記和2個(gè)SNP標(biāo)記）,開(kāi)展相關(guān)基因序列深度挖掘工作。研究的主要內(nèi)容包括:（1）基于高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果對(duì)SSR-PCZ90標(biāo)記所在基因序列進(jìn)行追溯,并通過(guò)生物信息學(xué)軟件分析SSR-PCZ90標(biāo)記所在的mRNA序列,包括同源序列比對(duì)、蛋白結(jié)構(gòu)（包括一級(jí)、二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)）和功能基因的預(yù)測(cè);（2）基于通過(guò)簡(jiǎn)化基因組測(cè)序獲得的SNP-M181697、SNP-... 

【文章頁(yè)數(shù)】：55 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 前言
    1.1 研究背景與目的意義
    1.2 國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
        1.2.1 針葉樹(shù)產(chǎn)脂機(jī)理的研究
        1.2.2 谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶(GST)的概述
        1.2.3 關(guān)聯(lián)分析
        1.2.4 關(guān)聯(lián)分析中常用的分子標(biāo)記
        1.2.5 染色體步移
    1.3 研究?jī)?nèi)容與路線
        1.3.1 研究?jī)?nèi)容
        1.3.2 技術(shù)路線
        1.3.3 項(xiàng)目來(lái)源和經(jīng)費(fèi)支持
第2章 馬尾松SSR-PCZ90 標(biāo)記相關(guān)基因挖掘及其生物信息學(xué)
    2.1 材料和方法
        2.1.1 馬尾松SSR-PCZ90 標(biāo)記所在基因序列的追溯
        2.1.2 基于第3 代高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的SSR-PCZ90 相關(guān)序列獲取
        2.1.3 生物信息學(xué)分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 SSR-PCZ90 相關(guān)序列獲取
        2.2.2 序列比對(duì)分析
        2.2.3 SSR-PCZ90 相關(guān)基因的ORF預(yù)測(cè)
        2.2.4 蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.2.5 蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
        2.2.6 蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
    2.3 討論
第3章 SNP-M181697和SNP-M249970 標(biāo)記相關(guān)序列挖掘
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料與設(shè)備
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 主要試劑
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 總DNA提取
        3.2.2 中間片段的克隆
        3.2.3 染色體步移
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 DNA質(zhì)量檢測(cè)
        3.3.2 181697克隆結(jié)果分析
        3.3.3 249970克隆結(jié)果分析
    3.4 討論
第4章 結(jié)果和展望
    4.1 結(jié)果
    4.2 討論
    4.3 展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表論文情況
致謝



本文編號(hào)：3678812