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黃河流域特有種甘蒙檉柳和檉柳的譜系地理學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2022-07-03 14:05
  百萬年來青藏高原的強(qiáng)烈隆升不僅極大地改變了亞洲的地形地貌,黃河的形成和演化也與之密切相關(guān)。黃河是中華民族的母親河,也是影響物種地理分布的環(huán)境要素之一,對(duì)一些種子具毛或翅,能夠通過風(fēng)力或水力傳播的物種、水生植物及河岸帶植物的地理分布會(huì)產(chǎn)生重要影響。本研究中,我們以黃河流域廣泛分布的兩種檉柳屬植物,檉柳(Tamarix chinensis)和中國(guó)特有種甘蒙檉柳(T.austromongolica)為研究材料,通過葉綠體基因組非編碼區(qū)測(cè)序和SSR分子標(biāo)記,對(duì)兩種檉柳屬植物的親緣關(guān)系、譜系地理和種群遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究,并探討兩種檉柳種群歷史動(dòng)態(tài)與過去氣候變化和黃河形成的關(guān)系,得出以下主要結(jié)果:(1)檉柳科3屬9種植物的表型和rpl20-5’–rps12、rps16和trnL–trnF序列分析結(jié)果表明,檉柳和甘蒙檉柳為單系分支的近緣種。(2)通過21個(gè)甘蒙檉柳和24個(gè)檉柳群體共計(jì)382個(gè)個(gè)體的葉綠體基因組trn L–trnF、rps16測(cè)序和363個(gè)個(gè)體的核基因組ITS測(cè)序,共獲得1127條序列。我們對(duì)這些序列進(jìn)行了失配分布、中性檢驗(yàn)和擴(kuò)展貝葉斯天際圖分析,發(fā)現(xiàn)甘蒙檉柳種群大約在0.15Ma,檉柳... 

【文章頁(yè)數(shù)】:96 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【文章目錄】:
致謝
摘要
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 檉柳科植物研究進(jìn)展
        1.1.1 檉柳科系統(tǒng)學(xué)研究
        1.1.2 檉柳屬植物群體遺傳學(xué)研究
    1.2 我國(guó)檉柳屬植物地理分布概況及影響因素
        1.2.1 我國(guó)檉柳屬植物的地理分布
        1.2.2 黃河形成概況
        1.2.3 河流對(duì)物種分布的影響
        1.2.4 更新世氣候變化對(duì)物種分布的影響
    1.3 譜系地理學(xué)研究進(jìn)展
        1.3.1 譜系地理學(xué)概述
        1.3.2 譜系地理學(xué)主要研究?jī)?nèi)容
        1.3.3 譜系地理學(xué)研究成果
    1.4 本研究的目的與意義
    1.5 技術(shù)路線
第二章 中國(guó)檉柳屬植物不同種的地理分布
    2.1 材料與方法
        2.1.1 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
        2.1.2 研究方法
    2.2 結(jié)果及分析
        2.2.1 我國(guó)檉柳屬植物不同種的地理分布
        2.2.2 我國(guó)各省、自治區(qū)的檉柳種數(shù)
    2.3 小結(jié)
第三章 檉柳和甘蒙檉柳親緣關(guān)系分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 材料采集
        3.1.2 形態(tài)鑒別和性狀編碼
        3.1.3 基因組DNA的提取和PCR擴(kuò)增
        3.1.4 數(shù)據(jù)分析
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 表型聚類結(jié)果
        3.2.2 分子系統(tǒng)學(xué)分析
    3.3 討論
    3.4 小結(jié)
第四章 基于葉綠體DNA和核基因組的譜系地理學(xué)研究
    4.1 材料與方法
        4.1.1 采樣點(diǎn)及生境
        4.1.2 DNA提取、引物篩選和擴(kuò)增
        4.1.3 單倍型和核苷酸多態(tài)性統(tǒng)計(jì)
        4.1.4 種群遺傳結(jié)構(gòu)和種群間基因流水平
        4.1.5 cpDNA單倍型分歧時(shí)間
        4.1.6 種群歷史動(dòng)態(tài)
        4.1.7 種群擴(kuò)張演化推測(cè)
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 DNA和擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
        4.2.2 單倍型和核苷酸多態(tài)性統(tǒng)計(jì)結(jié)果
        4.2.3 種群遺傳結(jié)構(gòu)和基因流水平
        4.2.4 單倍型分歧時(shí)間估算結(jié)果
        4.2.5 種群歷史動(dòng)態(tài)分析結(jié)果
        4.2.6 種群擴(kuò)張演化方向
    4.3 討論
    4.4 小結(jié)
第五章 基于SSR的群體遺傳多樣性與遺傳結(jié)構(gòu)
    5.1 材料與方法
        5.1.1 供試材料
        5.1.2 基因組DNA提取、PCR擴(kuò)增和基因分型
        5.1.3 群體遺傳多樣性分析
        5.1.4 遺傳距離和地理距離相關(guān)性檢驗(yàn)
        5.1.5 種群遺傳結(jié)構(gòu)
        5.1.6 Bottleneck檢驗(yàn)
    5.2 結(jié)果與分析
        5.2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果
        5.2.2 遺傳多樣性分析結(jié)果
        5.2.3 種內(nèi)群體間遺傳分化
        5.2.4 遺傳距離和地理距離相關(guān)性檢驗(yàn)結(jié)果
        5.2.5 種群遺傳結(jié)構(gòu)
        5.2.6 種群Bottleneck檢驗(yàn)結(jié)果
    5.3 討論
    5.4 小結(jié)
第六章 檉柳和甘蒙檉柳生態(tài)位模型預(yù)測(cè)
    6.1 材料與方法
        6.1.1 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
        6.1.2 研究方法
    6.2 結(jié)果及分析
        6.2.1 兩種檉柳分布點(diǎn)的氣候條件
        6.2.2 模型預(yù)測(cè)效果評(píng)價(jià)
        6.2.3 模型預(yù)測(cè)結(jié)果
    6.3 討論
    6.4 小結(jié)
第七章 結(jié)論與展望
    7.1 結(jié)論
    7.2 展望
    7.3 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
英文摘要
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本文編號(hào):3655003

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