巴西橡膠樹乳管細胞中MYB轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與表達分析
【學位授予單位】:海南大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:S794.1
【圖文】:
邐巴西橡膠樹乳管細胞中MYB轉(zhuǎn)錄因子的鑒定與表達分析邐逡逑domain,包括激活結(jié)構(gòu)域和抑制結(jié)構(gòu)域)、寡聚化位點(Oligomerization邋site)以及核逡逑定位信號區(qū)(Nuclear邋localization邋signal,邋NLS)(孫麗芳等,2009;羅賽男等,2005)。逡逑一般依據(jù)DNA結(jié)構(gòu)域的保守性強度將轉(zhuǎn)錄因子分為Zinc-fmger邋(鋅指蛋白)、bHLH逡逑(堿性螺旋-環(huán)-螺旋)、bZIP邋(堿性亮氨酸拉鏈)、MADS-boxing蛋白、Homeodomain逡逑蛋白、HSP蛋白、MYB蛋白、MYC蛋白、AP2/REBP蛋白等不同類家族蛋白逡逑(Takatsuji邋et邋al.,1998;邋Riechmann邋et邋al.,2000)。Riechmann邋等證實各轉(zhuǎn)錄因子間既逡逑能相互協(xié)作又能相互影響(圖3)邋(Riechmannetal.,邋2000)。轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合特異性逡逑由DNA結(jié)構(gòu)域決定,而轉(zhuǎn)錄調(diào)控區(qū)則決定其與靶基因的作用強度。逡逑MYB邋(V-MY5邋avian邋myeloblastosis邋viral邋oncogene邋homolog)轉(zhuǎn)錄因子是高等植物逡逑轉(zhuǎn)錄因子中的一個超級家族,因其基因數(shù)量眾多,種類豐富和功能復(fù)雜,是當前植物逡逑轉(zhuǎn)錄因子功能研究的主要成員之一。逡逑
通常根據(jù)高度保守DNA結(jié)合域的重復(fù)區(qū)數(shù)量和種類將MYB類轉(zhuǎn)錄因子分成4逡逑類即邋lR-MYB/MYB-related邋類、R2R3-MYB邋類、R1R2R3-MYB邋類、4R-MYB邋類逡逑(圖4)邋(Dubosetal.,2010)。高等動物中主要存在3R-MYB類,而高等植物中是逡逑以R2R3-MYB類為主,由結(jié)構(gòu)域的不同導(dǎo)致MYB類轉(zhuǎn)錄因子的功能差異(Feller邋et逡逑al.,2011)。只含1個R單元的MYB蛋白通常是作為端粒結(jié)合蛋白,對染色體結(jié)構(gòu)逡逑的完整性具有支撐作用,如擬南芥的CPC1蛋白和玉米的IBP1蛋白。含有2個R結(jié)逡逑9逡逑
3.1.2邋Wb/MKSs結(jié)構(gòu)及同源性分析逡逑運用在線軟件GSDS邋(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)對你的結(jié)構(gòu)進行在線分逡逑析(圖5)。m/MF價所含外顯子數(shù)目差異明顯,其中:6個含有單外顯子,6個含逡逑有2個外顯子;17個含有3個外顯子;1個含有4個外顯子;其余的含外逡逑顯子數(shù)目均超過5個,其中外顯子數(shù)目高達15個。結(jié)合冊/MT價聚類分逡逑析發(fā)現(xiàn),所含外顯子數(shù)目相同或相近的/?/_,其親緣關(guān)系親近。推導(dǎo)的HblMYBs逡逑都含有高度保守的R單元,其中含有1個R單元的HblMYB有5個,含有2個R逡逑單元的HblMYB有33個,含有3個R單元的HblMYB有6個。以R單元數(shù)量為依逡逑據(jù)可以將HblMYBs分為3類
【參考文獻】
相關(guān)期刊論文 前10條
1 郭冬;李輝亮;楊子平;彭世清;;巴西橡膠樹一個新的法尼基焦磷酸合酶基因的克隆及表達分析[J];熱帶作物學報;2015年03期
2 祁棟靈;王秀全;張志揚;黃月球;;世界天然橡膠產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀及科技對其推動力分析[J];熱帶農(nóng)業(yè)科學;2013年01期
3 吳春太;李維國;黃華孫;;近年來國內(nèi)外橡膠樹育種研究新進展[J];廣西植物;2012年06期
4 左然;徐美玲;柴國華;周功克;;植物MYB轉(zhuǎn)錄因子功能及調(diào)控機制研究進展[J];生命科學;2012年10期
5 李輝亮;郭冬;彭世清;;巴西橡膠樹14-3-3蛋白基因的克隆及表達分析[J];熱帶作物學報;2010年09期
6 孫麗芳;邢少辰;張君;楊建福;王興智;董英山;;轉(zhuǎn)錄因子在植物進化和抗逆中的作用[J];基因組學與應(yīng)用生物學;2009年03期
7 羅明武;鄧柳紅;易小平;曾會才;肖蘇生;;巴西橡膠樹順式異戊烯基轉(zhuǎn)移酶基因cDNA克隆及其序列特征分析[J];熱帶亞熱帶植物學報;2009年03期
8 謝吉容;熊運海;程在全;黃興奇;;月季MYB基因cDNA全長克隆和表達分析[J];中國農(nóng)業(yè)科學;2008年12期
9 劉蕾;杜海;唐曉鳳;吳燕民;黃玉碧;唐益雄;;MYB轉(zhuǎn)錄因子在植物抗逆脅迫中的作用及其分子機理[J];遺傳;2008年10期
10 杜海;楊文杰;劉蕾;唐曉鳳;吳燕民;黃玉碧;唐益雄;;大豆MYB轉(zhuǎn)錄因子基因GmMYBJ6和GmMYBJ7的克隆及表達分析[J];作物學報;2008年07期
相關(guān)博士學位論文 前2條
1 王穎;調(diào)控橡膠樹HbSRPP的轉(zhuǎn)錄因子HbWRKY1的分離與功能分析[D];海南大學;2012年
2 楊文杰;大豆MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及其表達研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學;2007年
相關(guān)碩士學位論文 前4條
1 劉彤;橡膠樹木質(zhì)素合成相關(guān)MYB基因的功能鑒定[D];海南大學;2015年
2 王諾菡;棉花MYB轉(zhuǎn)錄因子的克隆與功能驗證[D];西北農(nóng)林科技大學;2014年
3 曹忠慧;蘋果MYB轉(zhuǎn)錄因子家族的生物信息學分析及MdMYB121和MdSIMYB1在非生物脅迫響應(yīng)中的作用[D];山東農(nóng)業(yè)大學;2013年
4 展薔;紅肉蘋果MYB類轉(zhuǎn)錄因子的克隆及功能分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學;2010年
本文編號:2788095
本文鏈接:http://www.sikaile.net/nykjlw/lylw/2788095.html