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煙蚜繭蜂滯育關(guān)聯(lián)基因表達(dá)及肌鈣蛋白C基因的克隆

發(fā)布時(shí)間:2021-10-13 07:05
  煙蚜繭蜂Aphidius gifuensis Ashmead是一種優(yōu)良的內(nèi)寄生性天敵昆蟲,可有效控制桃蚜等多種蚜蟲危害。但在實(shí)際生產(chǎn)應(yīng)用中,存在生產(chǎn)周期長、貯存時(shí)間短、供求脫節(jié)等問題,使得天敵產(chǎn)品難以在害蟲爆發(fā)時(shí)發(fā)揮最大作用。滯育能通過特定基因表達(dá)模式為昆蟲提供可選擇性的發(fā)育途徑,使滯育個(gè)體產(chǎn)生營養(yǎng)物質(zhì)積累、新陳代謝抑制、生長發(fā)育減緩或停滯等表型,還可提高其對(duì)低溫、干旱等逆境抗性。這一特性在煙蚜繭蜂擴(kuò)繁應(yīng)用中具有重要作用,不僅能提升子代煙蚜繭蜂的適應(yīng)能力和寄生能力,而且能顯著延長天敵產(chǎn)品的貨架期,促進(jìn)煙蚜繭蜂的大規(guī)模擴(kuò)繁和應(yīng)用。近年來,煙蚜繭蜂滯育的環(huán)境調(diào)控、生理生化機(jī)制等已有深入研究,但其滯育的分子調(diào)控機(jī)制尚不明確;诖,本研究以煙蚜繭蜂為研究對(duì)象,測定了正常發(fā)育、滯育和滯育解除個(gè)體的轉(zhuǎn)錄組全序列,改進(jìn)了以往僅對(duì)正常組和處理組進(jìn)行分析的常規(guī)做法;分析比較了三組測序結(jié)果,獲得大量差異表達(dá)基因,篩選出了僅在滯育期間特異表達(dá)的滯育關(guān)聯(lián)基因;測定了9個(gè)候選基因的相對(duì)表達(dá)量,進(jìn)一步驗(yàn)證了測序結(jié)果的可靠性;克隆了滯育關(guān)聯(lián)基因肌鈣蛋白C基因全長cDNA序列,并對(duì)其序列進(jìn)行了全面的生物信息學(xué)分析,... 

【文章來源】:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】:87 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

煙蚜繭蜂滯育關(guān)聯(lián)基因表達(dá)及肌鈣蛋白C基因的克隆


文庫構(gòu)建流程圖

長度分布,長度分布,數(shù)值數(shù)據(jù)庫


圖 2.2 unigene 長度分布Figure 2.2 The length distribution of unigenes2.2.4 基因功能注釋及分析2.2.4.1 unigene E-value 分布將 unigene 序列與 UniProt 和 Nr 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對(duì),共獲取 unigene 47,077 個(gè),其中 61.4%得到注(表 2.4)。經(jīng)過 E-value<1e-5 的篩選,獲得 24,431 個(gè)可讀序列,獲得同源序列在 1e-50以下的占 65.52% (圖 2.3)。表 2.4 unigene 注釋情況Table 2.4 Annotation of unigene數(shù)目類型 數(shù)值數(shù)據(jù)庫比對(duì)注釋注釋總數(shù) 24,839 個(gè)Nr 注釋數(shù)目 24,475 個(gè)

序列,值分布,占比,序列


圖 2.3 E 值分布Figure 2.3 The distribution of E-value2.2.4.2 unigene 物種歸類由于煙蚜繭蜂基因組未知,unigene 序列校準(zhǔn)只能通過比對(duì)其他已測基因組的物種。結(jié)果顯示,unigene 序列比對(duì)結(jié)果與意大利蜜蜂同源性最高,共有 4486 個(gè)序列,占比約 19.03%,其次是蠅蛹金小蜂 4486 個(gè)序列(占比約 18.36%),行軍蟻 2589 個(gè)序列(占比約 10.6%),印度跳蟻 2314 個(gè)序列(占比約 9.47%);弓背蟻 2044 個(gè)序列(占比約 8.37%)等(表 2.5)。表 2.5 unigene 物種歸類Table 2 .5 Classification species of unigene拉丁學(xué)名Latin name種名Specific nameunigene 數(shù)量Number of unigeneApis mellifera 意大利蜜蜂 4649Nasonia vitripennis 蠅蛹金小蜂 4486Cerapachys biroi 行軍蟻 2589Harpegnathos saltator 印度跳蟻 2314

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于iTRAQ技術(shù)篩選肝癌轉(zhuǎn)移相關(guān)差異蛋白[J]. 宋琳嵐,楊敏,蔣小燕,陳瑜,湯慧,顏亮,廖勇.  重慶醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(10)
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[3]人心肌肌鈣蛋白在臨床應(yīng)用中的研究進(jìn)展[J]. 李磊,劉路路,惠崗,齊超,王珺楠.  中國實(shí)驗(yàn)診斷學(xué). 2016(05)
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[5]七星瓢蟲滯育關(guān)聯(lián)基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[J]. 齊曉陽,任小云,安濤,陳紅印,黃建,張禮生.  環(huán)境昆蟲學(xué)報(bào). 2016(02)
[6]基于轉(zhuǎn)錄組的蔥蠅表皮蛋白基因家族的鑒定及在非滯育和冬滯育條件下的表達(dá)分析[J]. 付丹影,司風(fēng)玲,陳斌,徐燕玲,郝友進(jìn).  昆蟲學(xué)報(bào). 2016(02)
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[8]我國寄生蜂調(diào)控寄主生理的研究進(jìn)展[J]. 時(shí)敏,陳學(xué)新.  中國生物防治學(xué)報(bào). 2015(05)
[9]心肌肌鈣蛋白在臨床應(yīng)用中的應(yīng)用[J]. 傅明暉.  生物技術(shù)世界. 2015(03)
[10]松墨天牛肌鈣蛋白T基因全長cDNA克隆及分析[J]. 吳華俊,許雯,林同.  福建農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(01)

博士論文
[1]滯育麥紅吸漿蟲的化學(xué)物質(zhì)變化與分子機(jī)理研究[D]. 王洪亮.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
[2]麥紅吸漿蟲滯育與化學(xué)物質(zhì)變化研究[D]. 仵均祥.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2002

碩士論文
[1]煙蚜繭蜂滯育誘導(dǎo)的溫光周期反應(yīng)及滯育生理研究[D]. 李玉艷.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2011
[2]野桑蠶肌原纖維鈣結(jié)合蛋白及相關(guān)蛋白的基因分析[D]. 許西奎.蘇州大學(xué) 2009



本文編號(hào):3434185

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