高通量測(cè)序分析老年血液透析患者腸道菌群的改變
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【摘要】:目的:了解老年血液透析(hemodialysis,HD)患者腸道菌群分布和豐度的變化規(guī)律。方法:采集51例HD患者作為疾病(Case)組,53例血肌酐正常的健康志愿者作為對(duì)照(Control)組;采集研究對(duì)象晨起新鮮糞便樣品,抽提其中微生物總基因組DNA,采用Ⅱ代基因測(cè)序技術(shù)對(duì)糞便樣品16S r DNA V3高變區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增測(cè)序;劃分可操作分類單元(operational taxonomic unit,OTU),使用QIIME分析平臺(tái)對(duì)所有OTU進(jìn)行物種注釋、多樣性分析、主坐標(biāo)分析及腸型分析;采用PICRUSt法預(yù)測(cè)腸道微生物基因功能及其在KEGG通路上的豐度差異,運(yùn)用R Studio軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。結(jié)果:兩組樣品檢測(cè)出腸道菌群分屬14個(gè)門和252個(gè)屬;厚壁菌門和擬桿菌門在Case組和Control組均為最優(yōu)勢(shì)菌門,豐度和分別為88.50(±13)%和93.55(±8.8)%,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;Case組厚壁菌門的豐度下降顯著(P0.01),擬桿菌門的豐度升高顯著(P0.01),厚壁/擬桿比值明顯減低;Case組有27個(gè)菌屬的豐度與Control組相比差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.01),分別屬于厚壁菌門(21個(gè))、擬桿菌門(3個(gè))以及變形菌門(3個(gè)),其中10個(gè)菌屬的豐度升高,以擬桿菌屬升高最為顯著,17個(gè)菌屬的豐度降低,以柔嫩梭菌、羅斯菌屬、巨單胞菌屬等腸道益生菌減少為主;Case組腸型分析為擬桿菌腸型,三大營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)分解代謝相關(guān)的基因表達(dá)明顯增強(qiáng),與Control組的柔嫩梭菌腸型差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.01)。結(jié)論:老年HD患者腸道菌群呈門結(jié)構(gòu)組成和菌屬豐度紊亂,提示血肌酐升高和血液透析可能影響腸道菌群的生存環(huán)境,主要表現(xiàn)為厚壁菌門細(xì)菌減少,擬桿菌門細(xì)菌適應(yīng)性繁殖,引起擬桿菌屬豐度增加以及糖代謝、脂肪代謝和氨基酸代謝相關(guān)的基因表達(dá)增強(qiáng),機(jī)體能量缺乏超出腸道菌群的代償能力導(dǎo)致能量代謝失衡,最終導(dǎo)致PEW(protein-energy wasting,PEW)的發(fā)生、發(fā)展。
【作者單位】: 廣東省廣州市紅十字會(huì)醫(yī)院/暨南大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬?gòu)V州紅十字會(huì)醫(yī)院腎內(nèi)科 廣州臨床病態(tài)營(yíng)養(yǎng)研究所;
【基金】:廣東省省級(jí)科技計(jì)劃項(xiàng)目(No.2016A020215023) 廣州市臨床醫(yī)學(xué)研究與轉(zhuǎn)化中心基金資助項(xiàng)目(No.2060404)
【分類號(hào)】:R459.5
【正文快照】: 超過(guò)100萬(wàn)億的微生物棲息在人體腸道內(nèi),影響著宿主的營(yíng)養(yǎng)、代謝、生理和免疫功能[1,2]。腸道菌群紊亂可牽涉到許多慢性疾病的發(fā)病機(jī)制,譬如肥胖、2型糖尿病、炎癥性腸病、肝硬化等[3,4]。初步研究顯示[5,6],5/6腎切除大鼠腸道菌群的豐度明顯下降,慢性腎臟病患者腸道菌群也會(huì)發(fā)
【相似文獻(xiàn)】
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2 王保紅;李e,
本文編號(hào):1183215
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