基于數(shù)據(jù)分析的癌癥標(biāo)志物識(shí)別及腫瘤進(jìn)展階段分類(lèi)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-07-20 20:13
癌癥種類(lèi)繁多,日益頻發(fā),嚴(yán)重威脅了人類(lèi)的生命健康.它的致病原因復(fù)雜多變,難以識(shí)別,治愈情況也不理想.早診斷早治療可以提高癌癥患者的生存率,但是受多方面因素的影響,很多癌癥患者確診時(shí)已處于中晚期,5年生存率很低.隨著機(jī)器學(xué)習(xí)算法以及生物信息學(xué)的不斷發(fā)展,利用基因表達(dá)數(shù)據(jù)對(duì)癌癥診斷標(biāo)志物的識(shí)別以及腫瘤進(jìn)展階段的研究,逐漸成為人們關(guān)注的熱點(diǎn)之一,也對(duì)癌癥早期診斷有著積極深遠(yuǎn)的意義.本研究旨在通過(guò)對(duì)大量芯片數(shù)據(jù)的分析,高通量篩選出癌癥的特異性表達(dá)的基因,鑒定早期非小細(xì)胞肺癌的診斷標(biāo)志物,同時(shí)研究腫瘤進(jìn)展階段的有效分類(lèi),提高癌癥分期的分類(lèi)精度.針對(duì)這兩個(gè)方面,本文通過(guò)大量的文獻(xiàn)研究,進(jìn)行了如下工作:(1)對(duì)從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中下載的76例早期非小細(xì)胞肺癌的重要基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行了一系列的生物信息學(xué)分析,其中包括腺癌樣本40例,鱗狀細(xì)胞癌樣本16例,健康樣本20例.為了確定診斷的特異性標(biāo)志物,我們將兩種亞型分別與正常樣本進(jìn)行比較,以確定基因表達(dá)特征.通過(guò)無(wú)監(jiān)督的多維定標(biāo)分類(lèi)分析,我們發(fā)現(xiàn)樣本按照疾病亞型很好地聚類(lèi).基于分類(lèi)結(jié)果,通過(guò)線性模型擬合和經(jīng)驗(yàn)貝葉斯方法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)推斷,共分析篩選出486個(gè)與該癌癥相...
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 研究背景
1.2 研究現(xiàn)狀
1.3 本文結(jié)構(gòu)安排及創(chuàng)新點(diǎn)
第2章 基礎(chǔ)理論知識(shí)
2.1 基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)
2.2 基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)
2.3 生物信息學(xué)
2.4 特征選擇
2.5 分類(lèi)分析
第3章 關(guān)于早期非小細(xì)胞肺癌患者潛在診斷標(biāo)志物的研究
3.1 材料與方法
3.2 結(jié)論
3.3 討論
第4章 基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)的特征選擇和分類(lèi)方法在腫瘤進(jìn)展階段的研究
4.1 材料與方法
4.2 結(jié)論
4.3 數(shù)據(jù)驗(yàn)證
4.4 討論
第5章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間的科研成果
致謝
本文編號(hào):3664688
【文章頁(yè)數(shù)】:66 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第1章 緒論
1.1 研究背景
1.2 研究現(xiàn)狀
1.3 本文結(jié)構(gòu)安排及創(chuàng)新點(diǎn)
第2章 基礎(chǔ)理論知識(shí)
2.1 基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)
2.2 基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)
2.3 生物信息學(xué)
2.4 特征選擇
2.5 分類(lèi)分析
第3章 關(guān)于早期非小細(xì)胞肺癌患者潛在診斷標(biāo)志物的研究
3.1 材料與方法
3.2 結(jié)論
3.3 討論
第4章 基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)的特征選擇和分類(lèi)方法在腫瘤進(jìn)展階段的研究
4.1 材料與方法
4.2 結(jié)論
4.3 數(shù)據(jù)驗(yàn)證
4.4 討論
第5章 總結(jié)與展望
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間的科研成果
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