發(fā)布時(shí)間：2021-04-14 22:55

　　蛋白質(zhì)是生物機(jī)體內(nèi)重要的物質(zhì),它是生命活動(dòng)的主要承擔(dān)者。絕大多數(shù)藥物進(jìn)入機(jī)體后都是通過(guò)與蛋白質(zhì)發(fā)生相互作用進(jìn)而對(duì)人體產(chǎn)生作用。藥物與生物大分子相互結(jié)合、作用的部位稱為藥物靶點(diǎn)。根據(jù)多向藥理學(xué)可知,藥物可能存在多個(gè)藥物靶點(diǎn),而且多數(shù)的藥物靶點(diǎn)都是由蛋白質(zhì)組成的,因此對(duì)藥物與蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測(cè)的研究,有利于藥物重定位、縮短藥物的開(kāi)發(fā)時(shí)間。傳統(tǒng)的藥物靶向蛋白質(zhì)作用研究采用生物實(shí)驗(yàn)方法確認(rèn)藥物與蛋白質(zhì)是否會(huì)發(fā)生相互作用,這種方式需要耗費(fèi)大量的成本與時(shí)間。由于基于計(jì)算方法的藥物與蛋白質(zhì)的相互作用預(yù)測(cè)方法可以極大地降低預(yù)測(cè)成本,所以使用計(jì)算機(jī)模擬、模式識(shí)別等手段預(yù)測(cè)藥物與蛋白質(zhì)的相互作用成了一項(xiàng)重要的研究工作。目前已有大量的基于計(jì)算方法的藥物與蛋白質(zhì)的相互作用預(yù)測(cè)方法的研究。本文提出了一種基于深度置信網(wǎng)絡(luò)的藥物-蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測(cè)算法:從藥物的分子結(jié)構(gòu)出發(fā),提取藥物的擴(kuò)展連通指紋,從蛋白質(zhì)的氨基酸序列出發(fā),提取了蛋白質(zhì)的三肽結(jié)構(gòu)特征,將藥物的擴(kuò)展連通指紋和蛋白質(zhì)的三肽結(jié)構(gòu)特征兩兩拼接,構(gòu)成一個(gè)藥物-蛋白質(zhì)特征向量,之后輸入到深度置信網(wǎng)絡(luò)中進(jìn)行訓(xùn)練,網(wǎng)絡(luò)的輸出為網(wǎng)絡(luò)輸入的藥物-蛋白質(zhì)對(duì)發(fā)生相互作用的... 

【文章來(lái)源】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】：58 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

論文組織結(jié)構(gòu)

、偏好和物品內(nèi)容進(jìn)行推薦，傳統(tǒng)的推薦技術(shù)存開(kāi)始出現(xiàn)將推薦技術(shù)和深度學(xué)習(xí)相互結(jié)合以提測(cè)主要使用光譜法、平衡透析法等實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的方計(jì)算機(jī)技術(shù)與生物信息技術(shù)的不斷發(fā)展，兩者計(jì)算機(jī)技術(shù)輔助以解決生物學(xué)的問(wèn)題的研究。，基于計(jì)算方法的 DTI 預(yù)測(cè)可以分為兩大類：基薦技術(shù)具有相似性，都是利用物體間的相互關(guān)聯(lián)戶評(píng)分進(jìn)行預(yù)測(cè)，因此目前已有大量的利用推薦深度學(xué)習(xí)的 DTI 預(yù)測(cè)的研究則是伴隨著深度學(xué)基于藥物和蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)信息而展開(kāi)相關(guān)研究進(jìn)行 DTI 預(yù)測(cè)。

問(wèn)題本質(zhì)與推薦技術(shù)相似，推薦技術(shù)在用戶和物品兩個(gè)實(shí)體下是在藥物和蛋白質(zhì)兩個(gè)實(shí)體下進(jìn)行預(yù)測(cè)，它們都是在已知的已知的作用關(guān)系下進(jìn)行的。因此推薦技術(shù)已經(jīng)開(kāi)始用在 DTI 可以劃分為三個(gè)方向：基于協(xié)同過(guò)濾、隱語(yǔ)義模型和網(wǎng)絡(luò)的方測(cè)研究方法都是基于隱語(yǔ)義模型和網(wǎng)絡(luò)的方法。濾（Collaborative Filtering，CF）算法是最常見(jiàn)且常用的推薦算的不同，可以劃分為基于用戶和基于物品的 CF 算法。對(duì)于 D戶、物品替換為藥物、蛋白質(zhì)（林耀進(jìn)等，2015）。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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