基于深度學(xué)習(xí)的人體椎骨分割
發(fā)布時間:2020-12-10 23:58
計算機斷層攝影術(shù)(CT)是一種常用的臨床醫(yī)學(xué)成像技術(shù)。CT可以很好的實現(xiàn)椎體骨折和不穩(wěn)定損傷檢測,因而廣泛應(yīng)用于臨床診斷。由于腰椎承受了身體大多數(shù)的力量,在遭遇較強外力時容易造成壓縮性骨折。在臨床診斷中,初期和中期的壓縮性骨折在椎骨形態(tài)上形變較小,大多數(shù)情況醫(yī)生會出現(xiàn)誤診以至于加重骨折程度,因此需要十分精確的分割結(jié)果才能更好的輔助醫(yī)生進行診斷。但是臨床中的手動分割耗時耗力且不同的醫(yī)生分割的結(jié)果不同,并沒有一個統(tǒng)一的分割標準。除了上述原因外,椎骨形態(tài)間的重復(fù)性、正常和病理間的解剖變異性、圖像采集的參數(shù)相異性(包括分辨率和可見視野等)等原因,使得單個椎骨的自動分節(jié)段分割存在極大的困難。目前已有的傳統(tǒng)分割算法以及機器學(xué)習(xí)算法,雖然能分割出人體椎骨,但是由于其精度太差,導(dǎo)致無法應(yīng)用于臨床。因此,迫切需要一種能自動完成椎骨節(jié)段分割的算法,從而大大減輕臨床醫(yī)生的工作負擔。針對這一問題,本文提出一種人體椎骨多類別分割算法,大大的提高了椎骨分割的精度,其中包括了以下三部分:1、CT圖像預(yù)處理。其中包括了限制對比度自適應(yīng)直方圖均衡化、基于HU值的閾值分割以及圖像膨脹等操作,提高了輸入圖像的質(zhì)量,增強了圖...
【文章來源】:電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1融合Normalized?cut算法的OTSU分割結(jié)果[25]??6??
?第二章相關(guān)研究及理論方法介紹???由圖2-1可以看出,雖然該分割算法可以較為完整的分割出完整的腰椎,但是??對于每一個椎骨的邊緣以及形狀都會有所確實,分割的精度并不高。在臨床的診??斷中,并不具有很高的使用價值。??2.1.2?GVF?Snake?分害IJ算法??在傳統(tǒng)的圖像處理領(lǐng)域,Snake又被大家稱作活動輪廓,它表示的在一張圖像??區(qū)域內(nèi)的一條曲線X(s)[263,其可以表示為:??Z(s)?=?(x(s),y(s),5?G?[0,1])?(2-2)??其中x(s),y(s)分別是x和y在圖像中的坐標值。??公式2-2在定義了活動輪廓的彈性曲線時,同時特定義了該彈性曲線的能量函??數(shù)。對于Snake模型來說,能量函數(shù)是該算法的核心,可以表示為:??Esnake?—?/〇?^snafce??=^{[^intCvCs))]?+?[Eimage^is))]?+?[Econ(v(s))]}ds?(2-3)??其中Firit表示由于曲線彎曲而產(chǎn)生的力;表示計算圖像信息而產(chǎn)生力;??則表示圖像外部的約束力。??Snake模型的最優(yōu)解本質(zhì)上就是最小化其能量函數(shù)。為了使Snake模型的能量??函數(shù)最小,需要對該函數(shù)的泛函數(shù)求極值,因此能量函數(shù)的最小化問題轉(zhuǎn)換成了??對偏微分方程的求解[27]。??Xu等人從力平衡角度,定義了一個名為梯度向量流的靜態(tài)外力Fe;ct?=?y)。??相比于傳統(tǒng)的Snake分割算法,由于加入了新的外力,則GVF擴大了曲線的外力??范圍,并且可以推動傳統(tǒng)的Snake算法收斂到凹陷處邊界。其分割結(jié)果如圖2-2所??不〇??■Kill??_??圖2-2?GVF?Snake算法分割結(jié)果??
?第二章相關(guān)研究及理論方法介紹???考慮了多尺度特征的融合,結(jié)合了高級特征和低級特征,增加了信息量,很適合??用于醫(yī)學(xué)圖像的合成任務(wù),但是U-net中使用了池化層對圖像降維,一定程度上也??會損失圖像的局部信息。??用于椎骨分割的U-Net結(jié)構(gòu)如圖2-3所示。由圖可以看出,該網(wǎng)絡(luò)實現(xiàn)了對??CT椎骨圖像的分割。相比較與FCN,U-net構(gòu)建了以全卷積網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ),在解碼??路徑中將在編碼網(wǎng)絡(luò)中與之對應(yīng)的特征圖對其進行補充,用反卷積操作代替池化??操作進行上采樣,從而可以提高分割結(jié)果的精度,但是其Dice系數(shù)也只有0.85,??并不能達到臨床診斷的要求。??16?32?32^|?32?32??2??1?十??'32?W?64*128?64?1??_?Hi??晷?64?128?128*256?128?畬??〇〇〇?i'i〇ga??4?126?256?256*512?256??疇?I'?f'—":?:???4??大池化操作??>卷積層*?RELU函致??捧*卷積層+?RELU函教??"I■上采樣操作??〈—連捿?J??圖2-3用于椎骨分割的U-Net結(jié)構(gòu)??2.2.2基于生成對抗網(wǎng)絡(luò)的椎骨分割算法??生成對抗網(wǎng)絡(luò)(GAN)作為近兩年深度學(xué)習(xí)領(lǐng)域的提出的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),其在圖像??生成、分割等圖像任務(wù)表現(xiàn)出了非常好的性能。與其他的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)相比,生成對??抗網(wǎng)絡(luò)最為引人注目的地方就是將對抗的這一概念引入了深度學(xué)習(xí)領(lǐng)域。??GAN就是一個對抗模型,用來生成和真實數(shù)據(jù)相似的結(jié)果。GAN主要包含兩??個部分,分別為生成器G和鑒別器D,如圖2-4所示。生成器G和鑒別器D互為??
本文編號:2909519
【文章來源】:電子科技大學(xué)四川省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:60 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-1融合Normalized?cut算法的OTSU分割結(jié)果[25]??6??
?第二章相關(guān)研究及理論方法介紹???由圖2-1可以看出,雖然該分割算法可以較為完整的分割出完整的腰椎,但是??對于每一個椎骨的邊緣以及形狀都會有所確實,分割的精度并不高。在臨床的診??斷中,并不具有很高的使用價值。??2.1.2?GVF?Snake?分害IJ算法??在傳統(tǒng)的圖像處理領(lǐng)域,Snake又被大家稱作活動輪廓,它表示的在一張圖像??區(qū)域內(nèi)的一條曲線X(s)[263,其可以表示為:??Z(s)?=?(x(s),y(s),5?G?[0,1])?(2-2)??其中x(s),y(s)分別是x和y在圖像中的坐標值。??公式2-2在定義了活動輪廓的彈性曲線時,同時特定義了該彈性曲線的能量函??數(shù)。對于Snake模型來說,能量函數(shù)是該算法的核心,可以表示為:??Esnake?—?/〇?^snafce??=^{[^intCvCs))]?+?[Eimage^is))]?+?[Econ(v(s))]}ds?(2-3)??其中Firit表示由于曲線彎曲而產(chǎn)生的力;表示計算圖像信息而產(chǎn)生力;??則表示圖像外部的約束力。??Snake模型的最優(yōu)解本質(zhì)上就是最小化其能量函數(shù)。為了使Snake模型的能量??函數(shù)最小,需要對該函數(shù)的泛函數(shù)求極值,因此能量函數(shù)的最小化問題轉(zhuǎn)換成了??對偏微分方程的求解[27]。??Xu等人從力平衡角度,定義了一個名為梯度向量流的靜態(tài)外力Fe;ct?=?y)。??相比于傳統(tǒng)的Snake分割算法,由于加入了新的外力,則GVF擴大了曲線的外力??范圍,并且可以推動傳統(tǒng)的Snake算法收斂到凹陷處邊界。其分割結(jié)果如圖2-2所??不〇??■Kill??_??圖2-2?GVF?Snake算法分割結(jié)果??
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