肝癌（Liver Cancer）有多種類型,常見高發(fā)類型為原發(fā)性肝癌中的肝細胞癌（Hepatocellular Carcinoma,HCC）,其發(fā)病通常難以察覺,且一旦發(fā)病則進展迅速,容易錯過最佳診治時間而造成癌細胞轉(zhuǎn)移或進入局部晚期,因此治療起來很困難,并且預(yù)后效果很差,是威脅人們生命健康的重大癌癥。目前其致病機制不明確,普遍認為是由多種致病因素共同作用導(dǎo)致的結(jié)果。鑒于肝癌的發(fā)病特點,對疑似患者的早期診斷十分重要,目前我國的肝癌診斷主要是依據(jù)影像學(xué)檢查與血清分子標志物甲胎蛋白檢測,但這兩種方法都存在一些缺陷。近年來也有一些處于研究階段的潛在HCC生物標志物,但大都存在特異性低、敏感性低的缺點,未達到理想的檢測效果。因此,尋找新的高敏高特異生物標志物來輔助HCC相關(guān)臨床診斷與檢查具有重大的社會價值和經(jīng)濟效益,已是刻不容緩。癌癥因其致病因素多且復(fù)雜,被認為是由多生物分子,以及遺傳因素與環(huán)境因素等相互作用而造成的“系統(tǒng)病”,這意味著基于復(fù)雜系統(tǒng)與復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的背景篩選生物標志物的正確性。因此本文將基因表達數(shù)據(jù)結(jié)合基因間相互作用（Gene-Gene Interaction,GGI）網(wǎng)絡(luò),通過研究... 

【文章來源】：山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：83 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１－１中國２０１５年主要惡性腫瘤發(fā)病數(shù)與死亡數(shù)占比與分性別排名對比［５］??但是即使乙肝疫苗對控制乙型肝炎患病人數(shù)增加，從而降低肝癌患病人數(shù)有??

山東大學(xué)碩士學(xué)位論文??類背景基因間相互作用網(wǎng)絡(luò)，構(gòu)建正常與疾病兩個狀態(tài)下特異的基因間相互作??用網(wǎng)絡(luò)，基于基因等生物分子在兩個基因間相互作用網(wǎng)絡(luò)中所處拓撲位置的差??異，挑選出兩個狀態(tài)下網(wǎng)絡(luò)拓撲參數(shù)差異變化顯著的基因，從而篩選出潛在肝??癌生物標志物，并在不同網(wǎng)絡(luò)組分層次上與其他方法進行了對比研究。為復(fù)雜??疾病的早期診斷生物標志物的發(fā)現(xiàn)提供了理論模型上的技術(shù)支撐，為生物標志??物的篩選提供新思路，實現(xiàn)了從復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)中尋找肝癌生物標志物。圖１－３是本??文主要研究內(nèi)容的框架圖。??／ｒ???……Ｉ?＼（?＂ＴＩ??：?Ｗ綰拓撲參數(shù)?４?ｔｔｉｉＭ絡(luò)拓撲餐數(shù)?校塊柃測??丨ｋ?廠丁??｜?ｉ?：?Ｉ?，ＩＷ?￣＇＼?｜?機器學(xué)習(xí)??；人類雄ＷＮ相ＩＩ作用ｗｍ?：?Ｉ?＼??＇ｈ?．＾：｜?＾數(shù)右異網(wǎng)絡(luò)?Ｉ??＋?賴狀機（州絡(luò)Ｖ?■??Ａ?￥??肝癌葙因表達數(shù)據(jù)?Ｔ＿＿＿．．?Ｉ??聰狀態(tài)?ＧＧＩＭ?絡(luò)?（ｒ〇ｐ．ＭａｒｋｃＪ?，??Ｖｉ?１?—－１?—Ｊｙ??ｉ??￥Ｓ??／＊■－?＂?￣?＊ｖ?ｒ?＼?／?ｖ?？■一??Ｉ?廣?＞??節(jié)點?邊?派系?迪路?￣＾?小卩彳［＾絡(luò)ｍ分篩選十物標上物????｜￣＾?????圖１－３本文框架圖??１．４．２章節(jié)安排??本文共包括五個章節(jié)，每章節(jié)的具體內(nèi)容安排如下：??第一章：緒論。本章首先通過介紹全球及中國的肝癌相關(guān)數(shù)據(jù)、肝癌的分??類以及肝癌的流行病學(xué)特征對肝癌的研究現(xiàn)狀和研究意義進行了闡述，其次對??肝癌的致病機制研究現(xiàn)狀進行了總結(jié)與解釋，然后簡單介紹了生物標志物的定??義與意義，對

山東大學(xué)碩士學(xué)位論文??第２章研究數(shù)據(jù)及方法??２．１研究數(shù)據(jù)??為了構(gòu)建疾病不同狀態(tài)下的相互作用網(wǎng)絡(luò)以及挑選適合本例肝癌數(shù)據(jù)篩選??生物標志物的網(wǎng)絡(luò)拓撲參數(shù)，本文首先利用現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中的相互作用網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建??背景的人類基因間相互作用網(wǎng)絡(luò)，再挑選合適的肝癌基因表達數(shù)據(jù)集用于本文??？?方法的實現(xiàn)和后續(xù)候選生物標志物的二次驗證。？??２．１．１人類基因間相互作用網(wǎng)絡(luò)??長期以來，人們認為生物體內(nèi)主要包含三種生物大分子：ＤＮＡ、ＲＮＡ和蛋??白質(zhì)。具有特定序列的、帶有遺傳信息的ＤＮＡ片段被稱為基因，基因轉(zhuǎn)錄生成??ＲＮＡ?（ｍＲＮＡ、ｒＲＮＡ、ｔＲＮＡ），其中ｍＲＮＡ翻譯生成蛋白質(zhì)，蛋白質(zhì)是生命的??物質(zhì)基礎(chǔ)，與各種生物性狀和生命活動緊密相關(guān)。這種遺傳信息的傳遞遵循分子??生物學(xué)中的“中心法則”?［２６］。??〇?〇??、／?轉(zhuǎn)錄?、／翻譯??ＤＮＡ?＂１＂＂?—？?ＲＮＡ?，蛋白質(zhì)??逆轉(zhuǎn)錄??圖２－１中心法則【２６］??近年來基因組學(xué)的逐步研究表明，基因與基因以及相關(guān)表達產(chǎn)物之間存在著??復(fù)雜的關(guān)系，它們相互調(diào)控與關(guān)聯(lián)，進而形成相互作用的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。基因間相互??作用關(guān)系（Ｇｅｎｅ－ＧｅｎｅＩｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ，?ＧＧＩ）包括最常見的基因調(diào)控、基因－蛋白質(zhì)、??ＲＮＡ－蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)－蛋白質(zhì)、ＲＮＡ－ＲＮＡ和代謝物－產(chǎn)物之間的相互作用等�；�??因以及蛋白質(zhì)、ＲＮＡ、代謝物等生物分子之間內(nèi)部或外部的相互作用，構(gòu)成了一??個龐大的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)。上述所有相互作用關(guān)系的發(fā)生根據(jù)中心法則進行抽象后，最??１１??

【參考文獻】：
期刊論文
[1]2015年中國惡性腫瘤流行情況分析[J]. 鄭榮壽,孫可欣,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),陳茹,顧秀瑛,魏文強,赫捷.  中華腫瘤雜志. 2019 (01)
[2]復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)中社區(qū)發(fā)現(xiàn)算法的對比研究[J]. 潘利強,張燕琴,王書榮,周文英.  福建電腦. 2017(12)
[3]Immunology of hepatocellular carcinoma[J]. Meenakshi Sachdeva,Yogesh K Chawla,Sunil K Arora.  World Journal of Hepatology. 2015(17)
[4]美國“精準醫(yī)學(xué)計劃”解讀與思考[J]. 趙曉宇,刁天喜,高云華,陳婷,康迪,王磊.  軍事醫(yī)學(xué). 2015(04)
[5]Terpenoids as potential chemopreventive and therapeutic agents in liver cancer[J]. Roslin J Thoppil,Anupam Bishayee.  World Journal of Hepatology. 2011(09)
[6]社會性標簽系統(tǒng)的k-派系社團發(fā)現(xiàn)的研究[J]. 魯曉明,張晉朝.  科技信息. 2008(29)
[7]原發(fā)性肝癌的流行病學(xué)特征及其危險因素[J]. 葉家才,崔書中,巴明臣.  實用醫(yī)學(xué)雜志. 2008(10)
[8]分子流行病學(xué)研究中生物標志選擇的系統(tǒng)方法[J]. 黃鵬,譚紅專.  醫(yī)學(xué)理論與實踐. 2008(01)
[9]Liver expression of steroid hormones and Apolipoprotein D receptors in hepatocellular carcinoma[J]. FJ Vizoso,M Rodriguez,A Altadill,ML González-Diéguez,A Linares,LO González,S Junquera,F Fresno-Forcelledo,MD Corte,L Rodrigo.  World Journal of Gastroenterology. 2007(23)
[10]用于數(shù)據(jù)挖掘的聚類算法[J]. 姜園,張朝陽,仇佩亮,周東方.  電子與信息學(xué)報. 2005(04)

博士論文
[1]復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)拓撲結(jié)構(gòu)度量指標及應(yīng)用研究[D]. 王炳波.西安電子科技大學(xué) 2014
[2]幾種基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的比較[D]. 艾對元.蘭州大學(xué) 2008



本文編號：3343925