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雞importin β1基因的克隆及生物信息學分析

發(fā)布時間:2017-09-22 03:11

  本文關(guān)鍵詞:雞importin β1基因的克隆及生物信息學分析


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【摘要】:[目的]對雞importin β1基因進行克隆和生物信息學分析。[方法]根據(jù)Gen Bank公布的雞importin β1基因序列(XM_015299473)設計合成特異性引物,通過RT-PCR從DF-1細胞中擴增importin β1基因CDS區(qū)并進行克隆和測序,利用生物信息學工具對其理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)進化樹進行分析。[結(jié)果]雞importin β1基因CDS全長2 268bp,共編碼755個氨基酸,該蛋白等電點為4.61,相對分子質(zhì)量84.15 k Da,分子式為C3712H5901N979O1152S46。蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預測顯示,雞importin β1蛋白含有豐富的二級結(jié)構(gòu),以α-螺旋為主(占64.90%)。importin β1基因同源性及系統(tǒng)進化樹分析結(jié)果表明雞與鵪鶉的親緣關(guān)系最近。[結(jié)論]雞importin β1基因的克隆和生物信息學分析為進一步研究其功能奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 貴州大學動物科學學院;貴州大學高原山地動物遺傳育種與繁殖教育部重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】雞importin β基因 克隆 生物信息學
【基金】:國家自然科學基金項目(“新城疫病毒M蛋白細胞核定位的分子機制及功能研究”,No.31502074) 貴州省省校合作計劃項目(“貴州省三穗鴨源新城疫病毒監(jiān)測及其防控體系研究”,黔科合LH字[2014]7669號) 貴州省科學技術(shù)基金項目(“以新城疫病毒為載體的新型鴨疫里默氏桿菌疫苗的研制及免疫保護效力研究”,黔科合J字[2015]2054號) 貴州大學引進人才科研項目(“三穗鴨源新城疫病毒SS-1株反向遺傳操作平臺的建立及其初步應用”,貴大人基合字[2014]10號)
【分類號】:S831
【正文快照】: importinβ蛋白是一類在真核生物中廣泛分布的核質(zhì)轉(zhuǎn)運受體蛋白,到目前為止,在人類細胞中發(fā)現(xiàn)importinβ家族成員超過20個,而在酵母細胞中大約有14個成員[1]。importinβ1蛋白屬于importinβ家族重要成員之一,其在細胞的基因轉(zhuǎn)錄、細胞周期調(diào)控及增殖分化等過程中發(fā)揮著重要作

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1 胡甘雨;司風玲;車燕飛;張玉娟;陳斌;;蔥蠅過氧化氫酶基因的克隆及生物信息學分析[J];西南大學學報(自然科學版);2014年01期

2 姚楊;黃原;蘇杰;;東亞三角渦蟲Rab蛋白cDNA序列的克隆與生物信息學分析[J];生物技術(shù)通報;2012年02期

3 張媛;張鐘仁;咸麗霞;邢國芳;;玉米谷胱甘肽過氧化物酶生物信息學分析[J];山西農(nóng)業(yè)科學;2013年08期

4 晁哲;林哲敏;劉海隆;張星;鄭心力;黃麗麗;謝亮;王峰;;雞熱休克蛋白70基因克隆、單核苷酸多態(tài)性檢測及生物信息學分析[J];中國畜牧獸醫(yī);2014年03期

5 蔡小寧;陳茜;楊平;任源浩;;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶的生物信息學分析[J];安徽農(nóng)業(yè)科學;2008年03期

6 陳塵;王政軍;曹鑫林;王U喼,

本文編號:898435


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