本文關(guān)鍵詞：基于高通量測(cè)序的慈竹筍轉(zhuǎn)錄組分析與基因功能注釋

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【摘要】：慈竹是我國(guó)四川當(dāng)?shù)氐膬?yōu)勢(shì)叢生竹種之一,其纖維長(zhǎng)度和質(zhì)量較優(yōu)異,是造紙、紡織等工業(yè)的良好原料。本文利用Illumina Hi SeqTM 2000平臺(tái),對(duì)10、50、100和150 cm高的慈竹筍進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,共得到69.28 M條讀長(zhǎng)(Reads),經(jīng)從頭拼接、組裝和聚類后得到111 137條非重復(fù)序列基因Unigene,其中共有63 094條注釋到COG、GO、KEGG、Swiss-Prot和Nr數(shù)據(jù)庫(kù)中。這些Unigene不僅具有一般的功能,如轉(zhuǎn)錄和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等,還涉及到蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)與代謝、次級(jí)代謝產(chǎn)物及細(xì)胞壁的生物合成等方面。不同高度慈竹筍的纖維素合成酶基因存在差異表達(dá),發(fā)現(xiàn)了可能調(diào)控慈竹生長(zhǎng)發(fā)育以及纖維素和木質(zhì)素生物合成的相關(guān)基因,為慈竹品種改良提供一定的理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 西南科技大學(xué)生命科學(xué)與工程學(xué)院四川省生物質(zhì)資源利用與改性工程技術(shù)研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 慈竹 轉(zhuǎn)錄組 高通量測(cè)序 功能注釋
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(Nos.31400257,31400333) 四川省“十三五”育種公關(guān)項(xiàng)目 四川省生物質(zhì)資源利用與改性工程技術(shù)研究中心基金(Nos.12zxsk07,13zxsk01,14tdgc05) 四川省教育廳科研項(xiàng)目(No.16ZA0145) 西南科技大學(xué)研究生創(chuàng)新基金(No.15ycx089)資助~~
【分類號(hào)】：S795.5
【正文快照】： 竹子是重要的非木材可再生資源,以生長(zhǎng)速度快、產(chǎn)量高、易加工、用途廣泛、經(jīng)濟(jì)價(jià)值高等特點(diǎn)著稱。近年來隨著分子生物學(xué)研究手段的發(fā)展,尤其是基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的廣泛應(yīng)用,毛竹、麻竹等竹種的基因組和(或)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)已經(jīng)被公布,一些與竹筍快速生長(zhǎng)以及竹材纖維形成的相，

本文編號(hào)：620883