發(fā)布時間：2017-08-02 09:35

  本文關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌higB基因的擴增及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的擴增結(jié)核分枝桿菌(H37Rv)的higB基因,運用生物信息學(xué)方法預(yù)測其編碼蛋白的生物信息學(xué)特征。方法采用PCR方法擴增higB基因并對擴增產(chǎn)物測序,通過在線Protparam、protscale、SignaIP 4.1、MotifScan、SWISS_MODEL等程序,分析higB基因編碼蛋白的生物學(xué)特征。結(jié)果獲得的higB基因全長378bp,與預(yù)期大小基本一致,基因序列與GenBank上公布的MTB標(biāo)準(zhǔn)株的核苷酸同源性為100.00%。higB蛋白共125個氨基酸,分子質(zhì)量單位為14.429 8ku,理論等電點10.18,脂溶性系數(shù)77.36,不穩(wěn)定系數(shù)35.67,預(yù)測該蛋白為穩(wěn)定蛋白。higB蛋白無信號肽,其二級結(jié)構(gòu)中β-轉(zhuǎn)角占12%,無規(guī)則卷曲占34.4%,氨基酸序列中有3個潛在的B細(xì)胞抗原表位,4個Th細(xì)胞表位,5個磷酸化位點。結(jié)論成功擴增了結(jié)核分枝桿菌higB基因,通過生物學(xué)信息獲得了其編碼蛋白的信息學(xué)特征,為研究該蛋白的生物學(xué)功能和免疫活性奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 濰坊醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗學(xué)系;濰坊醫(yī)學(xué)院臨床學(xué)院病原生物學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 higB 擴增 生物信息學(xué)分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(No.81470001;No.81170080)
【分類號】：R440
【正文快照】： *?**?結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌引起的慢性傳染病。近年來,隨著耐藥株的不斷增多,結(jié)核病已成為嚴(yán)重威脅人類健康的疾病。世界衛(wèi)生組織(WHO)《2015年全球結(jié)核病報告》中2014年全球大約有960萬人感染結(jié)核病,其中約120萬人為結(jié)核病和艾滋病雙重感染,5%的結(jié)核病患者為耐多藥結(jié)核病(m

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1 陳玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭錫熔;;miR-146b靶基因預(yù)測和生物信息學(xué)分析[A];2012年江浙滬兒科學(xué)術(shù)年會暨浙江省醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會學(xué)術(shù)年會、兒內(nèi)科疾病診治新進展國家級學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2012年

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本文編號：608652