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小花草玉梅正常和自然變異植株的AP3-3基因研究

發(fā)布時(shí)間:2017-07-31 22:22

  本文關(guān)鍵詞:小花草玉梅正常和自然變異植株的AP3-3基因研究


  更多相關(guān)文章: 小花草玉梅 花被片變異 Hi-Tail PCR MADS-box基因 NArAP3-3和VArAP3-3基因


【摘要】:花是被子植物獨(dú)有的必要的觀賞及生殖結(jié)構(gòu)。植株花發(fā)育是影響被子植物生存和繁衍的非常重要的生理過(guò)程。通過(guò)對(duì)變異植株花型變異原因、變異機(jī)制的探究,有利于進(jìn)一步了解花器官發(fā)育的進(jìn)化關(guān)系及解釋和修正花發(fā)育的分子模型,對(duì)于花型定向育種研究的發(fā)展擁有重大的應(yīng)用價(jià)值及意義。野生小花草玉梅(Anemone rivularis var.flore-minore)正常植株和花被片自然變異植株的外觀形態(tài)差異很大,本研究以二者為材料,利用常規(guī)PCR和高效熱不對(duì)稱(chēng)PCR(Hi-Tail PCR)技術(shù)從其正常和變異植株的基因組中各分離得到一個(gè)B類(lèi)基因。之后運(yùn)用生物信息學(xué)知識(shí)對(duì)其序列特征及預(yù)測(cè)蛋白進(jìn)行了綜合對(duì)比分析,以探索該變異植株中花被片變異產(chǎn)生的可能原因。經(jīng)分析獲得以下主要結(jié)果:(1)從正常和變異植株中各分離得到的B類(lèi)基因均屬于B類(lèi)MADS-box基因AP3家族的旁系同源基因AP3-3分枝,分別命名為NArAP3-3(正常植株)和VArAP3-3(變異植株)。(2)NArAP3-3基因全長(zhǎng)3795 bp,VArAP3-3基因全長(zhǎng)3898 bp,二者均包含有一個(gè)666 bp的CDS序列,可編碼221個(gè)氨基酸,具備典型的植物MADS-box基因結(jié)構(gòu),其所推導(dǎo)的氨基酸序列擁有MADS區(qū)、K區(qū)、I區(qū)和C區(qū)。對(duì)比NArAP3-3和VArAP3-3基因的全長(zhǎng)序列,發(fā)現(xiàn)VArAP3-3基因比NArAP3-3多了一段49 bp的插入,且在ORF序列與NArAP3-3基因相比有4個(gè)堿基突變。(3)對(duì)NArAP3-3和VArAP3-3基因的全長(zhǎng)序列、所編碼的221個(gè)氨基酸及插入序列做生物信息學(xué)分析,知其在基因啟動(dòng)子,蛋白質(zhì)基本性質(zhì)、結(jié)構(gòu)功能域、二級(jí)三級(jí)預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)等方面均有差異。這些差異可能是花被片變異產(chǎn)生的原因之一,小花草玉梅的變異植株中,花被片及雄蕊的變化可能均與VArAP3-3基因有一定相關(guān)性。VArAP3-3基因調(diào)控區(qū)和編碼序列的變化,可能造成其表達(dá)量上調(diào)及所譯蛋白的結(jié)構(gòu)性質(zhì)發(fā)生改變,使雄蕊退化減少,退化的雄蕊可能轉(zhuǎn)變成花被片使花被片輪數(shù)及數(shù)目增多。本研究為進(jìn)一步探索其變異機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:小花草玉梅 花被片變異 Hi-Tail PCR MADS-box基因 NArAP3-3和VArAP3-3基因
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:Q943.2
【目錄】:
  • 摘要5-6
  • ABSTRACT6-11
  • 第一章 文獻(xiàn)綜述11-30
  • 1.1 毛茛科及小花草玉梅的基本情況12-13
  • 1.1.1 毛茛科植物12
  • 1.1.2 小花草玉梅12-13
  • 1.2 被子植物花的重要性及多樣性13-14
  • 1.2.1 被子植物花的重要性13-14
  • 1.2.2 被子植物花的多樣性14
  • 1.3 植物花器官的起源、演化及形態(tài)發(fā)生14-20
  • 1.3.1 被子植物花的起源、演化及形態(tài)發(fā)生14-17
  • 1.3.1.1 萼片的起源15
  • 1.3.1.2 花瓣的起源15-16
  • 1.3.1.3 雄蕊的起源16
  • 1.3.1.4 雌蕊的起源16-17
  • 1.3.2 毛茛科植物各花部的起源和演化17-20
  • 1.3.2.1 花被的演化17-19
  • 1.3.2.2 雄蕊群19
  • 1.3.2.3 雌蕊群19-20
  • 1.4 花發(fā)育過(guò)程及調(diào)控基因20-25
  • 1.4.1 花發(fā)育過(guò)程及調(diào)控基因簡(jiǎn)介20-22
  • 1.4.2 MADS-Box基因家族22-25
  • 1.4.2.1 B類(lèi)MADS-Box基因亞家族23-25
  • 1.5 花器官屬性決定的分子模型25-28
  • 1.6 本研究的目的與意義28-29
  • 1.7 本研究的技術(shù)路線29-30
  • 第二章 小花草玉梅正常和變異植株的形態(tài)學(xué)特征比較30-34
  • 2.1 小花草玉梅花的變異現(xiàn)象30-31
  • 2.2 本研究所選材料的變化特點(diǎn)31-34
  • 2.2.1 小花草玉梅正常植株和綠白相間花變異植株的花部形態(tài)學(xué)對(duì)比方法31
  • 2.2.2 小花草玉梅正常植株和綠白相間花變異植株的花部形態(tài)學(xué)對(duì)比分析31-32
  • 2.2.3 討論32-34
  • 第三章 小花草玉梅正常和綠白相間花變異植株AP3-3 基因的克隆與分析34-51
  • 3.1 材料、試劑及儀器34
  • 3.1.1 植物材料34
  • 3.1.2 主要試劑34
  • 3.1.3 主要儀器34
  • 3.2 方法34-40
  • 3.2.1 小花草玉梅正常植株和綠白相間花變異植株的植物基因組提取34-36
  • 3.2.1.1 CTAB法提取植物基因組DNA的具體操作步驟34-35
  • 3.2.1.2 試劑盒法提取植物基因組DNA的具體操作步驟35-36
  • 3.2.2 小花草玉梅NArAP3-3 和VArAP3-3 基因中間序列的擴(kuò)增36
  • 3.2.3 NArAP3-3 和VArAP3-3 基因全長(zhǎng)序列的獲得36-39
  • 3.2.3.1 Hi-Tail PCR引物設(shè)計(jì)37-38
  • 3.2.3.2 Hi-Tail PCR擴(kuò)增條件38-39
  • 3.2.4 NArAP3-3 和VArAP3-3 基因序列的生物信息學(xué)分析39-40
  • 3.3 結(jié)果與分析40-47
  • 3.3.1 小花草玉梅NArAP3-3 和VArAP3-3 基因的克隆40-41
  • 3.3.2 NArAP3-3 和VArAP3-3 基因的結(jié)構(gòu)特征41-42
  • 3.3.3 NArAP3-3 和VArAP3-3 基因的系統(tǒng)進(jìn)化分析42-45
  • 3.3.4 NArAP3-3 和VArAP3-3 基因的啟動(dòng)子分析45-46
  • 3.3.5 NArAP3-3 和VArAP3-3 基因的氨基酸序列差異及其他相關(guān)性質(zhì)分析46-47
  • 3.3.6 NArAP3-3 和VAr AP3-3 蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)及三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)47
  • 3.4 討論47-51
  • 3.4.1 綠白相間花變異植株中VArAP3-3 基因的改變與其花部形態(tài)變化間的相關(guān)性分析47-49
  • 3.4.2 本研究結(jié)果對(duì)花發(fā)育分子機(jī)制“ABCDE”模型的解釋和驗(yàn)證49-51
  • 第四章 結(jié)論51-52
  • 參考文獻(xiàn)52-61
  • 致謝61-62
  • 作者簡(jiǎn)介62

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本文編號(hào):601390

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