辣椒雜交種與親本苗期葉片基因差異表達分析
本文關鍵詞:辣椒雜交種與親本苗期葉片基因差異表達分析
更多相關文章: 辣椒 雜種優(yōu)勢 轉錄組 RNA-seq
【摘要】:目前辣椒雜種優(yōu)勢的利用已取得很大成效,但是辣椒雜種優(yōu)勢的分子機理仍然不明。辣椒雜種優(yōu)勢的分子機理是一個重要的生物學和農學課題。為比較分析苗期辣椒雜交種(D6×D7,D7×D6)及其親本(D6、D7)的成熟功能葉轉錄譜,把4個功能葉c DNA文庫在Illumina Hi Seq 2000平臺進行RNASeq分析。通過轉錄組測序,共得到0.6億條原始的reads,經(jīng)過篩選獲得0.44億條高質量reads(100 bp);虼嬖谂c缺失變異統(tǒng)計結果表明,單親表達一致型有1068個(6.20%)和780個(4.56%)基因分別在正交(D6×D7)和反交(D7×D6)中被檢測到,在4種基因存在與缺失變異類型中所占比例比較高。對雙親表達量不同的基因作進一步表達模式分析,結果表明,雜種(正、反交)與雙親相比,大部分基因呈均非加性表達,加性表達基因比例不足8%,在非加性表達基因中,超顯性表達的基因占大多數(shù),正、反交分別為66.08%和62.96%,這與偏單親的顯性模型分析結論相一致。
【作者單位】: 廣東省農科院蔬菜研究所;福建農林大學作物科學學院;
【關鍵詞】: 辣椒 雜種優(yōu)勢 轉錄組 RNA-seq
【基金】:國家自然科學基金(31301776) 廣東省科技計劃項目(2015B0202009,2016B070701010) 廣州市科技計劃項目(201510010119)
【分類號】:S641.3
【正文快照】: 雜種優(yōu)勢是指遺傳結構不同的兩個群體(或個體)雜交所產(chǎn)生的F1代在生產(chǎn)、生活、繁殖和適應性等方面優(yōu)于雙親均值或超過兩個親本的現(xiàn)象[1]。雜交育種是根據(jù)品種的選育目標選配親本,通過雜種優(yōu)勢群的劃分、自交系的培育、對自交系一般配合力和特殊配合力的檢測等手段,獲得新品種
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4 ;[J];;年期
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4 王sコ,
本文編號:541962
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