本文關(guān)鍵詞：基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的重癥手足口病相關(guān)基因研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)(RNA-seq)分析重癥手足口病(SHFMD)患者外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)轉(zhuǎn)錄組情況,篩選SHFMD相關(guān)基因,探討其發(fā)生的可能免疫機(jī)制。方法收集2014年5月至8月深圳市第三人民醫(yī)院收治的重癥和輕癥手足口病(MHFMD)患兒各5例,以及5例健康體檢兒童的外周血,均分離PBMC,采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)篩選顯著的差異表達(dá)基因(DEGs),并通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR對(duì)DEGs進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果 SHFMD組相對(duì)健康對(duì)照組共117個(gè)DEGs,其中108個(gè)基因上調(diào),9個(gè)基因下調(diào);SHFMD組相對(duì)MHFMD組共26個(gè)DEGs,其中14個(gè)基因上調(diào),12個(gè)基因下調(diào);兩組DEGs中共有8個(gè)相同基因,其中TNFRSF13C、IL-7R、THBS1和VEGFA下調(diào),S100A8、S100A12、IL-8和IL-1β上調(diào)(P均0.05)。結(jié)論 S100A8、S100A12、IL-8、IL-1β、TNFRSF13C、IL-7R、THBS1和VEGFA是SHFMD相關(guān)的差異表達(dá)基因,可能在SHFMD的發(fā)生中起重要作用,有望成為手足口病重癥化的預(yù)測(cè)基因。
【作者單位】： 南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院感染科;南華大學(xué)附屬深圳市第三人民醫(yī)院感染科;
【關(guān)鍵詞】： 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 重癥手足口病 預(yù)測(cè)基因
【基金】：深圳市新發(fā)傳染病重點(diǎn)專科基金(N o.201161) 深圳市科技創(chuàng)新委項(xiàng)目(N o.JCYJ20150402111430623)
【分類號(hào)】：R725.1
【正文快照】： 手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)主要是由腸道病毒71型(enterovirus 71,EV71)和柯薩奇A組16型(Coxsackievirus A 16,Cox A16)引起的急性小兒傳染病,主要表現(xiàn)為手、足、口腔等部位的皰疹、斑丘疹。少數(shù)患者病情進(jìn)展迅速,在發(fā)病1~5 d出現(xiàn)腦炎、腦膜腦炎、神經(jīng)源性肺

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本文編號(hào)：508350