香鱗毛蕨4CL基因密碼子使用特性及表達預(yù)測分析
本文關(guān)鍵詞:香鱗毛蕨4CL基因密碼子使用特性及表達預(yù)測分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的研究蕨類植物中4CL基因的表達與分析,為蕨類植物次級代謝產(chǎn)物的積累和調(diào)控奠定理論基礎(chǔ)。方法運用CHIPS、CUSP和Codon W在線程序?qū)ψ灾骺寺〉南泖[毛蕨4CL基因(Df4CL)序列進行分析,并與大腸桿菌、酵母菌、擬南芥、煙草等基因進行比較,對了解Df4CL基因密碼子使用特性,為其選擇合適的表達系統(tǒng)具有重要意義。結(jié)果 Df4CL基因?qū)TGC選擇沒有偏向性,并且與小立碗蘚的密碼子使用偏好性相一致。在密碼子使用頻率上,Df4CL基因與擬南芥的差異小于與煙草、大腸桿菌、酵母的差異;基于4CL基因的密碼子使用偏性的系統(tǒng)聚類分析表明,香鱗毛蕨與小立碗蘚、擬南芥聚為一類。結(jié)論預(yù)示Df4CL基因更適合在擬南芥中外源表達。
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;齊齊哈爾大學(xué)生命科學(xué)與農(nóng)林學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 香鱗毛蕨 -香豆酸輔酶A連接酶 密碼子使用特性 基因表達
【基金】:國家自然科學(xué)基金資助項目(31070291) 齊齊哈爾市科學(xué)技術(shù)項目(NYGG-201206-4)
【分類號】:S567.239
【正文快照】: 李珊珊1,2,陳玲玲1,王鶴萌1,胡寶忠1*,常纓1*1.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,黑龍江哈爾濱1500302.齊齊哈爾大學(xué)生命科學(xué)與農(nóng)林學(xué)院,黑龍江齊齊哈爾161006香鱗毛蕨Dryopteris fragrans(L.)Schott是鱗毛蕨科(Dryopteridaceae)鱗毛蕨屬Dryopteris Adans多年生蕨類植物,其作為民間用
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本文編號:472460
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